華南農業大學教授王艇團隊、福建農林大學教授劉仲健團隊和中山大學教授蘇應娟團隊在國家自然科學基金、廣東省基礎與應用基礎研究基金等項目的資助下，基于統計基因組學分析揭示了麻栗坡兜蘭簡單重復序列的表達調控關鍵基序。相關成果近日發表于《先進科學》（Advanced Science）。
簡單重復序列（SSR）在原核和真核生物的基因組廣泛存在，能驅動物種快速發生遺傳變異、基因表達進化和環境適應。位于基因內的SSR更是可被用作調節基因表達和生理代謝過程的“旋鈕”，進而引發表型改變。可是，對于這些具基因表達調控功能的SSR（eSSR），它們的基序組成、拷貝數以及在基因中的分布式樣對基因表達產生的效應，目前還所知較少。
該研究對麻栗坡兜蘭轉錄組的SSR進行了系統的統計基因組學分析，證實eSSR基序類型與基因表達水平存在關聯，鑒定出9個表達調控基序（expMotif）和11個基序-轉錄區組合；發現基序類型-轉錄區組合是決定SSR所起表達調控作用的關鍵因素，并提出了解釋eSSR作用機制的模型；同時，對eSSR分布與MYB、F-box和TCP家族旁系同源基因的表達水平的相關性也進行了實驗驗證，結果表明eSSR重復單位的突變可導致所在基因的表達發生顯著改變。
該研究為認識重復序列對蘭科植物基因組的適應性進化提供了新見解，所建立起的eSSR高通量統計基因組學分析框架也可用于其他植物的研究。
相關論文信息：https://doi.org/10.1002/advs.202304848
科技日報北京6月6日電 （記者張夢然）新一期《自然·醫學》發表的一項大規模遺傳學研究結果顯示，相比目前已知的其他任何非性別相關基因，RNU4-2基因的罕見突變，可能是更多臨床診斷智力障礙病例......
5月29日，中國科學院深圳先進技術研究院研究員姜青山、高級工程師黃小羅、中國農業科學院深圳農業基因組研究所戴俊彪研究員等聯合在SmallMethods發表最新研究成果。研究人員設計了一種名為"......
線粒體與衰老息息相關，近年來，通過優化線粒體功能“延年益壽”的研究十分熱門。然而，浙江大學聯合中國科學院分子植物科學卓越創新中心的科研團隊卻另辟蹊徑，他們在昆蟲核基因組中發現了與線粒體協同演化的基因，......
Evosep在2024年ASMS會議上發布了可擴展蛋白質組學工作流程的突破性創新。這些創新突顯了Evosep致力于增強蛋白質組學作為工具箱的效率和可訪問性，特別是針對加速藥物發現過程和將轉化研究與基于......
華大智造近日公布了其2023年的財務報告，2023年的營業收入達到了29.11億元，較2022年的42.31億元降低了31.19%。營業總成本33.31億元，其中研發投入9.1億元，占總收入的31.2......
DNA的發現是人類研究地球生命遺傳本質的里程碑。地球上幾乎所有生命，從病毒、單細胞微生物、低等真核生物、動植物、哺乳動物，乃至人類都使用DNA遺傳物質進行細胞復制和生命繁衍。而mRNA的發現也是同樣重......
中新網武漢5月16日電(王俊芳)中外科研人員通過對已滅絕諾氏駝的化石材料開展古基因組研究，破解了諾氏駝基因之謎，并發現歐亞大陸雙峰駱駝不同物種在地質歷史時期存在廣泛的基因流動，其演化歷史比學界已有認知......
茶枝柑屬于蕓香科柑橘屬寬皮橘物種，是歷經700多年馴化栽培的柑橘變種，其果皮制干即為中藥“廣陳皮”，含有多種生物活性成分。多甲氧基黃酮是“廣陳皮”中關鍵的藥用成分，但目前對其生物合成的遺傳基礎及調控機......
近日，第二屆（2024）動物基因編輯抗病育種專題研討會在北京舉行。研討會現場。主辦方供圖研討會上，《“動物基因編輯產業促進”倡議書》發布。中國工程院院士、中國科學院亞熱帶農業生態研究所首席研究員印遇龍......
·一名杜氏肌營養不良患者在2期臨床試驗中去世，死于心臟驟停。這是輝瑞第二次宣布其DMD基因治療藥物fordadistrogenemovaparvovec在臨床試驗中出現死亡事件。當地時間2024年5月......