2015CNHUPO生物質譜高級研討會成功舉辦

發布時間：2015-01-28 09:31 原文鏈接： 2015CNHUPO生物質譜高級研討會成功舉辦

　　2015年1月22日，“2015CNHUPO生物質譜高級研討會”在北京文津國際酒店隆重召開。此次活動以“蛋白定量”為主題，旨在積極促進我國生物質譜技術的發展和應用，加強國內外相關研究領域的專家學者之間的交流與合作。特邀Dr. Mike MacCoss (University of Washington)，Dr. Robert Everley (Harvard Medical School-Steve Gygi Laboratory) 和劉斯奇教授、鄧海騰教授、紀建國教授等多名國內知名專家圍繞生物質譜在蛋白定量上的應用做專題報告，吸引了行業內專家學者近300余人參加。本次會議由中國人類蛋白質組組織(CNHUPO)主辦，賽默飛世爾科技（中國）有限公司獨家贊助，分析測試百科網全程參與并記錄了此次會議。

　　北京蛋白質組研究中心錢小紅女士

　　會議伊始，北京蛋白質組研究中心技術總監錢小紅女士致辭。錢女士首先表示非常歡迎前來參加2015CNHUPO生物質譜高級研討會的各位業內專家學者，特別邀請并感謝Mike MacCoss，Robert Everley等外國教授前來做報告，非常感謝賽默飛世爾科技對此次報告會議的傾情贊助。最后祝愿參會觀眾能夠享受這次生物質譜前沿技術邀請報告會。

　　華盛頓大學 Mike教授

　　來自華盛頓大學的Mike教授帶來題目為《Plenary session I--DIA/PRM Enabling proteomics to shift from list building to robust quantitative measurements》的報告。在2006年以前,利用軟件構建針對蛋白質組學的方法還不存在，也沒有能夠跨越供應商的數據分析軟件。Mike教授認為，應該有一種可以替代srm或有很好針對性的二級質譜軟件，能夠有目的和選擇性地接收寬帶數據，當有一個新的目標肽時，避免重新運行實驗。他在報告中介紹了采用skyline軟件進行SRM和DIA定量的分析流程，同時介紹了multiplex和overlap兩種新的DIA改進模式，可有效改善DIA定量實驗的選擇性。

　　中國科學院大連化學物理研究所周愿博士

　　來自中國科學院大連化學物理研究所的周愿博士帶來題目為《基于質量虧損的蛋白質組定量新方法》的報告。周愿博士主要分享了三種該實驗室開發的定量方法。一，基于質量虧損的二級碎片離子定量方法。該方法碎片離子相差5mDa，需要使用基于Orbitrap的超高分辨率質譜平臺才能分開。該方法在LTQ Orbitrap Velos質譜平臺上測試，定量準確性較好，98%的蛋白有定量信息，有4個數量級的動態范圍。二，基于質量虧損的a1離子定量方法。基于質量虧損的二級碎片離子定量方法需要較高的分辨率，需要使用基于Orbitrap的超高分辨率質譜平臺。該實驗在 Q Exactive質譜平臺上完成，二級分辨率設置為35K時，98%的肽段含有a1離子。基于a1離子的定量方法定量準確度較高，1:50的比值下依然能得到較準確的比值。三，基于質量虧損的SILAC定量方法。pSILAC定量方法是使用兩種質量相差36mDa的賴氨酸進行標記，y離子進行定量。pSILAC定量方法準確度和精確度較好，97%的蛋白有定量信息。

　　清華大學生命科學學院鄧海騰教授

　　來自清華大學生命科學學院的鄧海騰教授帶來題目為《結合蛋白質組學和代謝組學研究細胞穩態》的報告。該課題由湯海平博士完成，尚未發表。癌細胞中Hsp60高表達使抗氧化能力提升，該研究使用Q Exactive結合TMT定量方法研究Hsp60 knockdown和過表達兩組樣本，并同時進行蛋白質組和代謝組分析，發現與兩個新陳代謝和能量代謝pathway相關。其中代謝組學部分與清華大學劉曉蕙教授組合作完成，采用Q Exactive，TSQ quantiva（MRM）進行相關代謝通路的研究。

　　華盛頓大學 Mike教授

　　來自華盛頓大學的Mike教授帶來題目為《The Chorus Project: A community solution for the storage, sharing, and analysis of mass spectrometry data》的報告。數據管理和分析面臨著許多重要問題，例如高價值的數據量越來越多，經濟學和文化對數據的需求越來越大，數據儲存和運輸要求越來越高，算法改進的影響等等。Mike教授在報告中介紹了一個新的網絡平臺，所有實驗室均可在其平臺上進行數據的儲存、分析、共享等，并在未來希望可以進行在線的快速數據檢索。

　　哈佛學院 Robert教授

　　來自哈佛學院的Robert教授帶來題目為《Plenary session II--TMT/SILAC quan The Power of Multiplexing for Comprehensive Quantitative Proteomics》的報告。Multiplexing標記（如TMT）大量節省機時，且基于Orbitrap Fusion的SPS MS3定量準確性、靈敏度均有顯著提高，采用該方法對結腸癌細胞系進行蛋白組定量，超過7200個蛋白可獲得定量信息。此外，報告還對KRAS激活狀態下EGF信號通路進行定量磷酸化蛋白質組學研究工作進行了介紹，用10-plex TMT MS3方法分析未分級的腦及肝臟組織樣品，實驗發現Fusion MS3的高質量譜圖數是前一代質譜的1.8倍。Steve Gygi組對Orbitrap Fusion的優異性能給出了極高評價。

　　北京大學生命科學學院紀建國教授

　　來自北京大學生命科學學院紀建國教授帶來題目為《通過TMPP進行高準確度多肽從頭測序、定量，以及磷酸化位點確定》的報告。生物學和生物醫學的問題正在逐漸被社會所關注，例如蛋白質定量、修飾與功能的關系，重大疾病的發病機制、靶標、標志物、治療監控等。紀建國教授在報告中介紹了一種新的定量技術，即應用TMPP標記方法，一方面可以簡化二級質譜圖，另一方面可以把CID和ETD譜圖整合起來獲得質量更高的質譜圖，從而獲得更好的定量結果，此外，紀教授還介紹了應用于這種技術進行多肽從頭測序和磷酸化分析的結果。

　　復旦大學生物醫學科學研究所申華莉研究員

　　來自復旦大學生物醫學科學研究所的申華莉研究員帶來題目為《定量脂組學和蛋白組學聯合研究肝癌轉移過程中的脂質代謝調控》的報告。申華莉老師首先介紹了脂類組學相關內容，隨后對團隊的研究工作進行了講述，申老師介紹了通過對3種轉移程度不同的肝癌細胞系的脂質組學進行分析，確定了轉移的差別可能與2種脂肪酸的比例失調有關，并進一步通過蛋白質組學分析，確定其可能的機制，并發現了STAT3可能與其相關。

　　中國科學院北京基因組研究所劉斯奇教授

　　來自中國科學院北京基因組研究所的劉斯奇教授帶來題目為《利用定量蛋白質組學研究mTOR相關的信號通路》的報告。mTOR具有多種功能，mTOR信號與生物功能相關的分子機制和疾病也有待探索。劉教授認為由mTOR信號識別表達是理解mTOR功能機制的一個關鍵。報告中介紹了通過mTOR相關mRNA和差異蛋白質組學分析，認為 mRNA測量不能真正反映蛋白質功能分子的變化，并對mTOR相關蛋白進行全面的功能分析。

　　賽默飛世爾科技組學市場總監 Andreas先生

　　來自賽默飛世爾科技組學市場總監Andreas先生帶來題目為《Protein Quantitation -which LCMS method is right for my experiment？》的報告。蛋白質定量轉換有敏感、準確、廣泛的動態范圍，而且最小的方法開發不需要選擇轉換。Andreas先生在報告中介紹了通過TMT標記研究闡明生物在空間和時間的多路復用，并且證明蛋白質復合物及其交互需要可再生的蛋白質網絡覆蓋率和DIA分析策略，這對理解細胞信號事件多路復用和等量化方法如何滿足精度需要提供了幫助。

　　賽默飛世爾科技王璐博士

　　來自賽默飛世爾科技的王璐博士帶來題目為《推動多重定量組學技術流程的進一步完善》的報告。在多重蛋白組分析細胞分化研究中，細胞分化過程中的蛋白組會非連續性變化，而現有的多重標記的定量實驗流程中，多肽定量缺乏合適的方法。王博士介紹了thermo新開發的兩種新型肽段定量的方法，比色法肽段定量（CPQ）和熒光法肽段定量（FPQ），其實驗結果精確，比普通的BCA法更加靈敏。隨后王博士又介紹了一種新的反相高pH值反相萃取柱，簡便易用，其效果和反相高效液相色譜的結果類似。

　　賽默飛世爾科技軒玥博士

　　來自賽默飛世爾科技的軒玥博士帶來題目為《Novel DIA techniques--DIA/WiSIM/etc Using novel data independent analysis methods to obtain characterization of a biological pathway 》的報告。軒玥女士首先介紹了數據獨立分析和傳統的定量工具，隨后引出DIA技術的重要性，它能實現極限的性能，有著超高的質量精度以及高分辨率的全掃描功能，是一項很有意義的技術，并系統介紹了應用thermo儀器進行DIA分析的3種方法。

　　報告會結束后，賽默飛又舉行了有獎問答活動，參會者踴躍參加，場面熱鬧非凡。