973計劃支持蔬菜基因組學研究取得重要進展
在973計劃的支持下,中國農業科學院蔬菜花卉研究所黃三文研究員的研究團隊構建了包含360多萬個位點的黃瓜全基因組遺傳變異圖譜,為全面了解黃瓜這一重要蔬菜作物的進化及多樣性提供了新思路,并為全基因組設計育種打下了基礎。該研究成果于10月21日由《自然 遺傳學》雜志在線發表。 黃瓜是最重要的蔬菜之一,相比其他園藝作物有著較小的基因組,因此常被用來作為研究植物或者蔬菜重要經濟性狀形成的重要模式系統。在該研究中,科研團隊對115個黃瓜品系進行了重測序,并對一個野生黃瓜進行了從頭測序。他們共發現330多萬個單核苷酸多態性位點(SNPs),33萬多個小插入和刪除,594個獲得/缺失變異。基于這些數據,研究人員構建了一個單核苷酸分辨率的黃瓜遺傳變異圖譜。利用該遺傳變異圖譜,科學家證實了黃瓜發源于印度,同時將控制葉片、果實大小以及苦味等性狀的關鍵基因定位在了染色體上,為下一步利用這些重要蔬菜馴化基因打下了基礎。 973計劃2......閱讀全文
多吃水果蔬菜喔!不信?有數據哩
我們一直念叨,或者被念叨,要多吃水果和蔬菜。可是具體要吃多少,才有助于身體健康呢? 近日,倫敦帝國理工學院的科學家們給出了一份答案:每天吃5份(400g)以上的水果、蔬菜能夠有效降低心臟病、中風、癌癥的概率,且可以預防過早死亡! 吃多少果蔬?5份可以,10份更佳! 每天我們需要攝取多少水果
缺乏數據使用指導原則,基因組數據共享遇阻
基因組數據共享將生物醫學研究推向快車道,但向公共領域發布的現有數據指南一方面承認免費和無條件使用數據的重要性,另一方面還未能解決這種重要性與數據生產者首次發布數據的“權利”之間的關系。 在美國能源部聯合基因組研究所負責人Nikos Kyrpides看來,這種自相矛盾導致了數據生產者和數據使用
蔬菜中心:繪成世界首張西瓜基因組序列圖譜
我國是世界第一西瓜生產與消費大國,但是人們卻始終未能從外到內了解它,直到2013年1月,國際學術頂級刊物《自然·遺傳學》發表了世界首張西瓜基因組序列圖譜(影響因子35.532),標志著人類成功破譯了西瓜遺傳“密碼”。這項由蔬菜中心主任許勇的研究團隊牽頭進行的科研創新,為高效培育兼具優質、高產、抗
973計劃支持蔬菜基因組學研究取得重要進展
在973計劃的支持下,中國農業科學院蔬菜花卉研究所黃三文研究員的研究團隊構建了包含360多萬個位點的黃瓜全基因組遺傳變異圖譜,為全面了解黃瓜這一重要蔬菜作物的進化及多樣性提供了新思路,并為全基因組設計育種打下了基礎。該研究成果于10月21日由《自然 遺傳學》雜志在線發表。 黃瓜是最重要
基因組數據分析的“金標準”
五月十八日,美國安大略癌癥研究所、俄勒岡健康與科學大學、賽智生物網絡(Sage Bionetworks)、分布式DREAM 團體(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大學圣克魯茲分校的癌癥研究人員,在《Nature M
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0,并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題,在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0,并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題,在線發表在Nucleic Acids Rese
國家基因組科學數據中心公布數據資源整合挖掘體系
近日,國家基因組科學數據中心在國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表題為Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章,以整體形式介紹基因組數據資源整合與挖掘體系建
國際癌癥基因組聯盟公布逾1萬個癌癥基因組數據
國際癌癥基因組聯盟(International Cancer Genome Consortium,簡稱"ICGC")近日向科研界公布了超過1萬個癌癥基因組的數據。這些數據能更好地幫助全世界的癌癥研究者從基因方面了解癌癥,加快對癌癥的研究并幫助更多癌癥靶向治療的發展。 安大略癌癥研究所所
北京基因組所數據資源建設取得進展
近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊研究論文在線發表于《核酸研究》期刊。該研究成果的發表是國內首次以數據中心為模式,整體發布我國生命組學數據資源建設情況,標志著生命與健康大數據中心建設取得實質性重要進展,也標志著我國建設綜合性基因組數據資源獲得國際同行認可。 生命與健