12月20日至22日,2019年南京鼓樓全國消化系統疾病病理學術會議在南京召開。此次會議由中國抗癌協會腫瘤病理專業委員會食管癌協作組、肝癌病理協作組、胃腸疾病協作組、中國研究型醫院學會超微和分子病理學會消化疾病學組、江蘇省醫學會病理學分會消化疾病學組等單位主辦,由南京大學醫學院附屬鼓樓醫院承辦、志諾維思(北京)基因科技有限公司協辦。共有近百家醫院近四百位病理專家、學者及從業人員參加了此次會議。
大會開幕式上,“中國食管癌病理大數據多中心研究項目”正式啟動,中國抗癌協會腫瘤病理專業委員會候任主委、大數據學組組長劉艷輝教授、中國抗癌協會腫瘤病理專業委員會食管癌協作組組長薛麗燕教授、副組長侯英勇教授、李媛教授、樊祥山教授、志諾維思董事長兼首席執行官凌少平參與了啟動儀式,共同按下項目啟動按鈕,將現場的熱烈氣氛推向高潮。
項目啟動儀式現場
中國食管癌病理大數據多中心研究項目簡介
“中國食管癌病理大數據多中心研究項目”由中國醫學科學院腫瘤醫院作為主研究中心,有來自于全國的30余家中心參與,旨在通過對全國食管癌的基本病理資料進行統計分析,在更廣泛、更真實的背景中獲得目前中國人群食管癌發病及食管癌病理大數據特征,在多中心大樣本的基礎上建立中國食管癌病理數據庫,比較不同地區食管癌臨床病理資料數據的差異,從而提升我國食管癌病理診斷能力,為食管癌臨床診斷及治療提供重要病理依據。該項目同時也期待利用多中心研究數據整合我國食管癌病理研發資源,加強科研產出,凸顯我國食管癌病理研究的國際影響力。
薛麗燕教授作會議報告
“中國食管癌病理大數據多中心研究項目”也是由中國抗癌協會腫瘤病理專業委員會領導的“中國腫瘤病理大數據多中心研究計劃”的一部分。該計劃于2018年8月正式啟動,旨在通過對中國近五年來十大惡性腫瘤的病理診斷報告及病理圖像等數據進行回顧和整理,為制定新一代病理診斷標準提供科學依據及數據支撐。在該計劃的引領下,先后啟動了包括肺癌、肝癌、鼻咽癌、淋巴瘤在內的多個癌種的病理大數據多中心研究。志諾維思(北京)基因科技有限公司作為該研究項目的唯一技術支持單位,在以往項目中幫助協會完成了平臺搭建、數據上傳、文本數據的結構化、規范化初步評估、流行病學分析等工作。
病理大數據多中心研究的挑戰——標準化和結構化
病理大數據多中心研究項目最大的挑戰在于數據收集和數據結構化處理。由于病理報告數據為非結構化的文本數據,如果由病理醫生整理填寫CRF,那么收集整理數據將會是巨大的工作量且極其耗時緩慢。且不同醫院、不同醫生之間報告格式、書寫習慣差異較大,數據處理過程十分耗時耗力。
樊祥山主任介紹鼓樓醫院即將上線的胃癌結構化病理報告模板
為此,由中國抗癌協會腫瘤病理專業委員會大數據學組發起,在20日召開了“消化系統腫瘤結構化病理診斷模板分享和討論會”,旨在通過分享和交流現階段結構化病理診斷報告的進展和經驗,與病理專家共同探討數據結構化問題,期望通過結構化報告模板這一形式,來推進規范化標準化病理診斷的落實,為大數據、AI等新技術在病理學科的發展和應用,解決最根本的數據標準化和結構化問題。
本次會議就食管癌、胃癌、結直腸癌、肝癌、胰腺癌共5個癌種17個診斷模板進行了分享,其中志諾維思與南京鼓樓醫院合作開發的胃癌結構化報告模板錄入系統、與肝癌病理學組合作開發的肝癌結構化報告模板錄入系統、與中國醫學科學院腫瘤醫院合作開發的食管癌結構化報告模板錄入系統均獲得了很高的人氣。
志諾維思解決方案
志諾維思團隊搭建的病理數據智能平臺,形成了歷史數據+增量數據的完整解決方案,可幫助病理科快速建立結構化的病理專病數據庫,充分發掘釋放數據價值,使得多中心協作研究更加便捷高效。
對于歷史數據,志諾維思運用自然語言處理技術和領域知識庫進行指標的結構化信息提取,目前已形成成熟的算法框架,可對不同癌種不同單位的書寫特征定制化調整,快速解決歷史數據的結構化問題。
對于增量數據,志諾維思團隊開發搭建了病理結構化報告模板錄入和數據管理分析系統iPathologyTM EIR,從數據產生到數據應用,全流程實現結構化和智能化。數據錄入模塊依據國內外病理診斷規范和標準,以及病理科室的實際使用需求,定制化設計結構化報告模板,包含自動計算、關聯填寫等輔助錄入功能,可以兼容多標本多病灶的復雜情況;數據管理功能模塊可以全指標任意組合設置篩選條件,滿足不同的科研視角;數據分析模塊,搭載專業的統計算法,自定義高級分析與圖表可視化。
志諾維思也將與病理專家共同探討解決方案,以符合病理學科需求的產品和服務,來解決數據標準化和結構化問題,從而實現鏈接數據智慧抗癌。
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