環狀RNA在腸道干細胞自我更新中的重要作用
腸道是食物消化和吸收的主要場所，由單層上皮細胞形成腸上皮屏障。除了上皮細胞，腸道中還有大量的免疫細胞。即使在成體穩態（homeostasis）條件下，腸上皮仍經歷著快速的自我更新，在小鼠中大約5天可以更新一次【1】。定位于腸道隱窩中的干細胞可以分化為腸道中所有的上皮細胞類型【2】。腸干細胞的自我更新和分化是腸道持續更新和損傷修復的基礎。腸道干細胞處于微環境中，受不同微環境因子的精細調控。但是，免疫細胞作為腸道中數目眾多且作用關鍵的細胞類群，在腸道干細胞自我更新中的作用尚不清楚。 環狀RNA（cicrRNA）由RNA的5‘和3‘末端通過共價連接形成【3】。盡管曾被認為只是RNA剪切的副產物，但越來越多的研究表明cicrRNA具有重要的功能。cicrRNA與其他長鏈非編碼RNA類似，可以作為miRNA sponge，也可以通過結合啟動子區域，結合mRNA調控元件或隔離RNA結合蛋白來起作用【4】。同時，一些cicrRNA還可以......閱讀全文
環狀RNA在腸道干細胞自我更新中的重要作用
腸道是食物消化和吸收的主要場所，由單層上皮細胞形成腸上皮屏障。除了上皮細胞，腸道中還有大量的免疫細胞。即使在成體穩態（homeostasis）條件下，腸上皮仍經歷著快速的自我更新，在小鼠中大約5天可以更新一次【1】。定位于腸道隱窩中的干細胞可以分化為腸道中所有的上皮細胞類型【2】。腸干細胞的自我
云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用（二）
4.對年齡相關性白內障circRNA的分析顯示，circZNF292可以通過海綿機制調節miR-23b-3p功能發表期刊：Aging-us影響因子：4.831發表時間：2020.9.10研究方法：全轉錄組測序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、雙熒光素酶實驗等云序提供文章鏈接：Pr
云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用（一）
環狀RNA作為新發現的RNA分子，從誕生之日起就是光環加身，屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中，“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇，較2018年增長約20%，其中大
環狀 RNA 測序案例分析
案例：以結腸癌，卵巢癌，特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是構成生物體 RNA 網絡的一部分，而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的
環狀RNA研究深度剖析
1.環狀RNA為什么火？它到底是何方神圣？ 2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世，徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學界！經過嚴格統計匯總后，2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項，其中有兩項杰出青年基金，一項優秀
環狀RNA研究方法（一）
至2015起云序生物已經完成10000+例環狀RNA全轉錄組測序服務，涵蓋了50+疾病，20+物種，幫助眾多客戶在環狀RNA分子的研究中取得突破性進展。客戶發表的環狀RNA文章高達20篇以上。此外云序生物還提供環狀RNA機制研究手段，rip&RNA pull down技術，幫助客戶沖刺高分機制文章。
環狀RNA結合功能蛋白
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉錄前
環狀RNA研究方法（二）
在此基礎上，哪些環狀RNA分子發生了差異表達？在這里火山圖、Venn圖應有盡有。根據p=2的標準，一共發現42個環狀發生上調，47個環狀發生下調。?圖3. 差異環狀RNA的篩選2. 差異環狀RNA分子的qPCR驗證對于一篇做譜的文章，差異環狀RNA的結果驗證只需做到qPCR即可。對5個上調和5個下調
環狀RNA研究文章匯總（二）
4.世界首篇人膠質瘤環狀RNA研究（影響因子：3.0）膠質瘤作為最常見的顱內惡性腫瘤占顱腦腫瘤的40%~50%，電磁輻射等其他環境致癌因素會導致膠質瘤的發生，盡管手術切除、術后放療、藥物化療等方法可以作為主流的膠質瘤治療手段，但是多形性膠質母細胞瘤（GBM）的強侵襲、增殖能力仍給病人的治療造成很大的
環狀RNA研究深度剖析（二）
目標circRNA的機制研究 a RIP-qPCR：挑選功能最為明顯的1個circRNA做RIP-qPCR實驗，檢測circRNA是否與AGO2蛋白結合。（AGO2是circRNA發揮海綿作用的指示蛋白） b RNA pull down：對上述circRNA進行RNA pull down實驗，拉