高通量彗星實驗箱COMPAC-50---成就更好的彗星實驗 單細胞凝膠電泳(彗星實驗)作為評估DNA損傷的實驗方法一直受到廣泛關注。從傳統的院校和科研機構,到相關的醫藥企業,越來越多的研究者表現了對彗星實驗濃厚的興趣。例如制藥企業中遺傳毒性藥物的篩選等。 Figure 1 堿性彗星實驗流程圖 任何方式的彗星實驗,都要經歷以上幾個實驗步驟。然而,樣品通量低、操作流程費勁是限制該實驗應用的主要因素。傳統彗星實驗中,每次一個一個的來測定50個細胞的DNA損傷程度,相當的耗時。為了進行大批量樣品的DNA損傷檢測,Cleaver Scientific公司與Leicester大學氧化應激小組共同合作研發的一款新型高通量彗星電泳系統COMPAC-50。Leicester大學氧化應激小組在Scientific Report發表的一篇文獻中詳細描述了這種彗星實驗裝置的升級過程,提到新型高通量載玻架和高通量電泳槽對于實驗的......閱讀全文
單細胞凝膠電泳(彗星實驗)作為評估DNA損傷的實驗方法一直受到廣泛關注。從傳統的院校和科研機構,到相關的醫藥企業,越來越多的研究者表現了對彗星實驗濃厚的興趣。例如制藥企業中遺傳毒性藥物的篩選等。Figure 1 堿性彗星實驗流程圖 任何方式的彗星實驗,都要經歷以上幾個實驗步驟。然而,樣品通量低、操作
彗星實驗高通量實驗過程的新方法單細胞凝膠電泳,或者我們稱之為彗星實驗,作為研究DNA損傷的形成和修復,吸引了越來越多研究者的興趣。此外,彗星實驗不再局限于應用在院校和科研機構。現在,越來越多的相關工業企業對彗星實驗有了顯著的興趣,例如制藥企業中的遺傳毒性藥物篩選。事實上,彗星實驗為醫藥行業的推進和發
在研究過程中對于樣品的碾磨技術也在不斷的進步,如果采用傳統的碾磨方式,就是利用電動玻璃勻漿機進行,那么一次只能針對一樣樣品進行研磨,速度比較慢,而且每次在樣品碾磨完畢之后都需要對儀器進行消毒清洗,這就比較麻煩。針對傳統研磨方式的缺點,我公司引進的高通量組織研磨儀可以在1分鐘內完成2×24、2×48、
隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以
隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以
邊連接邊測序(SOLiD和Complete Genomics)從根本上來說,SBL法包含了雜交和對標記的探針的連接15。探針包含了一到兩個特定堿基序列和一系列通用序列,這可以使得探針與模板之間進行互補配對。錨定的片段則包含一段已知的和接頭互補的序列用于提供連接位點。連接之后,模板被系統進行測序反應1
隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以
邊合成邊測序:SNA(454,Ion Torrent)與CRT不同的是,SNA方法依賴于單信號標記dNTP來對鏈進行延伸。四種核糖核酸都必須反復添加到測序反應過程中。不僅如此,SNA不需要將dNTP屏蔽,因為測序反應過程中下一個堿基的缺失會阻止鏈的延伸。堿基的寡聚體則是一個例外,在這種情況下,信號的
表一:NGS平臺概述。單分子長讀長測序(PacBio和ONT)最近這段時間,最常用的長讀長測序法平臺就是使用PacBio Biosciences(PacBio)57的單分子實時測序法(single-molecule real-time sequencing, SMRT)(圖5a)。該設備使用
圖5: 長讀長實時測序原理。長reads的合成與真正測序的平臺不同的是,合成長讀長技術依賴于一個barcode系統來結合不同的片段,通過已有的短讀長測序儀來獲得長讀長reads61。該方法將大的DNA分子分割成若干個小片段到微孔中或者乳液中。每個微孔或者乳液中的模板被切割并且加上了barcodes。