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基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析，在上一篇中，我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容（具體內容查看鏈接）。在這里，我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。細胞譜系分析，最簡明的理解就是細胞領域的進化樹，通常指的是某類祖源細胞，在特定條件下，有多個發育軌跡和命運，變化過程類似復雜樹狀分支變化過程。因此，該分析的目的就是用單細胞數據還原復雜細胞命運變化。該分析的結果呈現內容可以簡單概括為兩點：1.細胞變化命運：2.不同命運細胞的marker基因。以Monocle來進行細胞譜系分析為例，Monocle細胞譜系分析的目的是在實驗中了解細胞是如何通過一個基因表達變化的生物程序進行轉化的。每個細胞都可以看作是高維空間中的一個點，每個維描述基因組中不同基因的表達。識別基因表達變化的程序相當于學習細胞在這個空間中遵循的軌跡。但是，分析中維度越多，學習軌跡就越困難。然而，許多基因通常彼此共存。因此，可以......閱讀全文
本文中，小編整理了近年來單細胞測序領域的重磅級研究成果，與大家一起學習！ 【1】Cell：開發出空間單細胞測序技術，有助揭示早期乳腺癌產生浸潤性之謎 doi：10.1016/j.cell.2017.12.007 在一項新的研究中，來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員報道一種新的遺傳
本期為大家帶來的是發育生物學領域的最新研究進展，希望讀者朋友們能夠喜歡。 1. Eur Respir J：新研究揭示肺臟發育高清圖譜 DOI: 10.1183/13993003.00746-2019 過早出生的嬰兒常常患有肺部發育不良，并可能面臨危及生命的后果。為了給這些嬰兒提供新穎的治療
——也許不久的將來，定位組織中的基因表達就會成為一種常規技術了。 對于基因表達研究來說，空間一直都是具有挑戰性的前沿研究領域。但是隨著越來越多的研究人員獲得了技術進展，這已經不再是令人望而生畏的領域了。這些方法的多樣性和創造性使其成為一個值得關注的技術方向。 空間基因表達對于理解組織中細胞的
中科院生物物理研究所，北京大學，北京大學第三醫院和首都醫科大學附屬安貞醫院的研究人員發表了題為“Single-cell RNA-Seq surveys a developmental landscape of the human prefrontal cortex”的文章，繪制了人腦前額葉胚胎
5月22日，科技部官網發布了《關于對國家重點研發計劃干細胞及轉化研究等6個重點專項2018年度項目申報指南征求意見的通知》，其中，“干細胞及轉化研究”重點專項、“蛋白質機器與生命過程調控”重點專項、“納米科技”重點專項 與生物醫學領域相關。 關于對國家重點研發計劃干細胞及轉化研究等6個重點專項
“十三五”期間，通過支持我國優勢學科和交叉學科的重要前沿方向，以及從國家重大需求中凝練可望取得重大原始創新的研究方向，進一步提升我國主要學科的國際地位，提高科學技術滿足國家重大需求的能力。各科學部遴選優先發展領域及其主要研究方向的原則是： （1）在重大前沿領域突出學科交叉，注重多學科協同攻關，
每個月都有一大波新的CRISPR工具來襲。比如，Cas9抑制劑的出現可在各種場景下防止脫靶效應。人們也將CRISPR-Cas9系統與前沿的單細胞測序技術相結合，開發出新的策略。與此同時，研究人員開發出Cas9以外的效應物核酸酶，比如C2c2，靶向RNA以實現編輯和成像應用。 對于這些熱門的技術
當你讀到這篇文章時，又一波CRISPR工具將會浮出水面。它們將需要接受測試和優化。不過，如果你詢問開發者你在開展概念驗證研究時是否應當試用它們時，你將僅獲得鼓勵。畢竟，迄今為止它們還不能從Addgene公司獲得，但是將會很快上市了。 最新發布的一系列CRISPR工具包括新的譜系追蹤方法，該方法