單細胞轉錄組重要研究文獻匯總(二)
4.單細胞轉錄組測序在植物領域嶄露頭角相比動物的單細胞研究,由于植物具有細胞壁的特點,使得植物的單細胞研究相比較難,但是繼2月份的擬南芥根組織單細胞轉錄組學研究[8],本月在《Developmental Cell》上又發表了一篇基于擬南芥根組織的單細胞轉錄組學研究報道[9]。來自德國圖賓根大學植物分子生物學中心的研究人員運用10X Genomics 單細胞轉錄組測序方法對擬南芥的根組織細胞進行了圖譜鑒定。該圖譜提供了詳細的時空信息,確定了所有的主要細胞類型,包括靜止中心(QC細胞)的稀有細胞,揭示了在細胞命運轉化為獨特的細胞形狀和功能過程中的關鍵發育調控因子和下游基因。通過擬時間序列分析,該研究描繪了從細胞從niche到分化的精細發生軌跡及主要調控轉錄因子。幾乎在同一時間,華盛頓大學基因組科學中心的研究人員同樣利用擬南芥根組織的單細胞測序研究在植物頂級期刊《Plant Cell》上發表了擬南芥根圖譜結果[10......閱讀全文
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼,伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展,可以看到,在現有的高通量檢測技術領域,這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展,到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展,相信在接
單細胞轉錄組制備儀的功能
fluidigm C1 單細胞自動制備儀用于 mRNA 測序 更完整的流程 ?-首尾相連的流程對單細胞進行全轉錄組分析 最高的通量 ?-每次運行可前所未有的平行處理 96 個單細胞 更容易的操作 ?-直接從單細胞開始,簡化的樣本制備,只需 3 小時手工操作時間,沒有 片段化和純化步驟 更節省的成
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總(一)
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程,繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐,本月在《Nature
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總(二)
4.單細胞轉錄組測序在植物領域嶄露頭角相比動物的單細胞研究,由于植物具有細胞壁的特點,使得植物的單細胞研究相比較難,但是繼2月份的擬南芥根組織單細胞轉錄組學研究[8],本月在《Developmental Cell》上又發表了一篇基于擬南芥根組織的單細胞轉錄組學研究報道[9]。來自德國圖賓根大學植
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞轉錄組制備儀的技術指標
將 C1 應用于單細胞 mRNA 測序,可以從多個細胞個 體平行處理多達 96 個 cDNA 文庫,在任何 Illumina 測序儀上對 mRNA表達進行相對定量。此系統的主要特征包括: 高通量 ?-可對 96 個單細胞進行大規模平行、連貫的制備, 引入條形碼序列標記(Barcode),可將測
3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱 精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程,繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐,本月在《Nature