Cell子刊顛覆經典教條,癌癥表觀遺傳有新說
由澳大利亞Garvan醫學研究所Susan Clark教授領導的一個研究小組在新研究中揭示:前列腺癌中基因組的大片區域(約達到2%)受到了表觀遺傳調控激活。這一成果發表在12月13日的《癌細胞》(Cancer cell)雜志上。 激活區域包含許多前列腺癌特異基因,例如前列腺癌最常見的標志物PSA(前列腺特異抗原)和PCA3等。直到現在,人們都并不清楚這些基因是通過表觀遺傳調控。 Clark教授實驗室在以往的研究中證實,相似地前列腺癌基因組的大片區域也被表觀遺傳調控沉默,表明癌癥的表觀遺傳組(epigenome)有結構性重排。 表觀遺傳學(Epigenetics)是著眼于研究不涉及DNA序列改變,通過影響細胞核內基因組的結構調控基因表達的生物化學改變的一門遺傳學科。通過某些分子的附著或脫離準確打開或關閉DNA結構,使得基因在結構打開時表達,結構關閉時沉默。 在表觀遺傳激活方面,新研究表明,一種稱......閱讀全文
北京基因組所揭示半甲基化在基因表達調控中的作用
DNA甲基化是最早發現的表觀遺傳標記之一,在真核細胞基因表達調控中發揮重要作用。隨著DNA甲基化檢測技術的進步,研究發現DNA甲基化具有完全甲基化和半甲基化兩種狀態,以及可以穩定遺傳的半甲基化修飾。關于DNA半甲基化是否具有獨特的生物學功能仍有爭議,因而需要對DNA半甲基化進行研究。此外,傳統的
何厚勝/衛功宏/任善成合作發現調控前列腺癌的新機制
Nature子刊 |? 既往眾多的大規全基因組關聯研究(GWAS)在人類基因組上發現了 269 個與前列腺癌發病風險密切相關的風險區域,其中包含了大量單核苷酸多態性 (SNP) 位點,但是其中約 98% 的 SNP 位點位于基因組上的非編碼區。 這些非編碼區的位點與前列腺癌之間究竟僅僅是統計
基因組中表達基因的類型介紹
基因組中表達的基因分為兩類:⑴一類是維持細胞基本生命活動所必須的,稱管家基因(house keeping gene),如各種組蛋白基因;⑵另一類是指導合成組織特異性蛋白的基因,對分化有重要影響,稱奢侈基因(luxury gene),即組織特異性(tissue-specific gene)表達的基因,
Cell子刊顛覆經典教條,癌癥表觀遺傳有新說
由澳大利亞Garvan醫學研究所Susan Clark教授領導的一個研究小組在新研究中揭示:前列腺癌中基因組的大片區域(約達到2%)受到了表觀遺傳調控激活。這一成果發表在12月13日的《癌細胞》(Cancer cell)雜志上。 激活區域包含許多前列腺癌特異基因,例如前列腺癌最常見
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術,如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等,已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化,它是在擴增片段長度多態性技術的基
準確率達92%!甲基化助力前列腺癌診斷!
前列腺癌(PCa)是老年男性最高發的惡性腫瘤之一,在我國,該病發病率正在快速增長。前列腺癌被稱為“沉默的殺手”,不甚明朗的腫瘤分期極易造成“過度治療”,也可導致疾病進展時的措手不及或無效治療,因此,找尋可準確分辨前列腺癌真正狀態的標志物成為了當務之急。近日,英國和加拿大的科學家們確定了一種可檢測
準確率達92%!甲基化助力前列腺癌診斷!
前列腺癌(PCa)是老年男性最高發的惡性腫瘤之一,在我國,該病發病率正在快速增長。前列腺癌被稱為“沉默的殺手”,不甚明朗的腫瘤分期極易造成“過度治療”,也可導致疾病進展時的措手不及或無效治療,因此,找尋可準確分辨前列腺癌真正狀態的標志物成為了當務之急。近日,英國和加拿大的科學家們確定了一種可檢
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技
基因是否表達:cfDNA全基因組測序可揭曉
《Nature Genetics》雜志上的研究表明,血循環游離DNA(cfDNA)可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中,把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯,最后轉變成具有生物活性的蛋白質分子的
線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日,吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史,同時也使以DN
全基因組測序解讀重要甲基化機制
DNA看起來只是AGTC四種堿基的簡單排列,可一旦它與組蛋白包裝形成染色質,情況就復雜得多了。組蛋白主要有四種,分別是H2A、H2B、H3和H4。這些組蛋白要么令DNA盤繞起來保持沉默,要么將DNA解開允許基因表達。組蛋白上的化學修飾(如甲基化),能夠影響它對基因的控制。 H3K4me3是
全基因組甲基化定量檢測技術LUMA
LUMA介紹 基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件,有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此,我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化,稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methyl
家蠶基因組甲基化譜研究獲突破
我國科學家利用新一代測序技術構建家蠶絲腺甲基化譜 由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”,5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》(Nature Biotechnology)上發表,這是中國科學家
全基因組甲基化定量檢測技術LUMA
LUMA介紹基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件,有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此,我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化,稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methylat
基因是否表達,做個cfDNA全基因組測序就可揭曉
8月29日,《Nature Genetics》雜志上的研究表明,血循環游離DNA(cfDNA)可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中,把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯,最后轉變成具有生物活性的
Nat-Med:1178個生物標志物被鑒別-將助前列腺癌患疾病預測
近日,一項刊登在國際雜志Nature Medicine上的研究報告中,來自加利福尼亞大學等機構的科學家們通過研究在男性基因組中鑒別出了1178個生物標志物,其或能幫助有效預測男性機體前列腺癌生長的趨勢,相關研究結果表明,預測男性前列腺癌進展的線索或許在其遺傳性DNA中。圖片來源:UCLA Hea
細胞化學基礎植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
關于植物葉綠體基因組基因表達調控的研究的介紹
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
基因組直接測序法檢測甲基化的介紹
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
基因組直接測序法檢測DNA的甲基化
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應
北京基因組所揭示RNA甲基化調控基因剪接機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂課題組在研究m6A甲基化修飾調節mRNA選擇性剪接規律過程中,發現了讀碼器YTHDC1通過招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時抑制剪接因子SRSF10與RNA的結合,促進外顯子被保留的分子機制。該研究結果于2016
抑制前列腺癌轉移的新途徑AMP激活的蛋白激酶(AMPK)
前列腺癌(PCa)是全球男性癌癥死亡的主要原因。雖然具有局限性腫瘤的患者有良好的預后,但轉移性患者的5年生存率下降至30%。去勢療法是治療前列腺癌的標準治療方式之一,該療法最初會限制腫瘤,但最終會導致去勢抵抗性前列腺癌(CRPC)復發。大部分的去勢抵抗患者最終轉變為轉移性去勢抵抗,而轉移是導致前列腺
《基因組生物學》—夏慶友小組—家蠶基因表達研究
日前,國際生物學權威期刊《基因組生物學》在線發表了西南大學蠶學與系統生物學研究所夏慶友教授領銜的課題組關于利用家蠶全基因組芯片分析家蠶多種組織基因表達特征的最新研究成果。?家蠶是重要的經濟昆蟲,既能用于蠶絲的生產、也能作為生物反應器生產外源蛋白;同時,家蠶也是鱗翅目昆蟲生化、分子遺傳以及基因組研究的
進行全基因組甲基化檢測需要多少錢
建庫是5000塊錢一個庫,測序就是1500每G,看您要測多少G的數據量,信息分析大概要5000塊錢左右吧。。。