引物延伸分析(primerextensionanalysis)
引物延伸分析(primer extension analysis)主要用于mRNA 5′端作圖。poly(A)+RNA首先與過量5′端標記的且與靶RNA互補的單鏈寡核苷酸引物雜交,然后用反轉錄酶延伸這個引物。產生的cDNA與RNA模板互補且長度與引物5′端和RNA 5′端之間的距離相等。該法在mRNA 5′端作圖方面具有下述優勢:一旦引物被子起始合成,延伸反應大多會進行到RNA模板的5′最末端,產物大小可精確測定。此外,產物長度不會受靶基因內含子分布與大小的影響。 幾乎所有的引物延伸實驗多采用長20~30 bp合成寡核苷酸引物。當用于和靶序列雜交的寡核苷酸引物位于距mRNA 5′端150 bp以內時,可獲得最佳結果。在更遠距離處雜交的引物能增加異源延伸產物,因為反轉錄酶會在模板RNA的二級結構復雜區終止。因此,在設計引物時,除實際的序列之外還應考慮到雜交的位置。應盡可能使寡核苷酸的GC含量在50%左右且在3′端為G或C......閱讀全文
引物延伸反應
Primer extension analysis is used to determine the location and quantitate the amount of the 5′-end of specific RNAs. An end-labeled oligonucleotide i
引物延伸實驗
實驗材料 RNA試劑、試劑盒 T4多核苷酸激酶dATP醋酸鈉乙醇EDTARNaseA苯酚氯仿儀器、耗材 恒溫培養箱NAP-5柱-70°C冰箱低溫離心機實驗步驟 1. ?依次加入下列試劑,建立用以標記引物的反應混合液(終體積10 μl)(1)2.5 μl ?H2O(2)1 μl ?10×T4多核苷酸激
引物延伸實驗
引物延伸分析用于確定位置和定量特定RNA的5'-端的數量。結束標記的寡核苷酸雜交,RNA和利用中存在的脫氧核苷酸逆轉錄作為底漆。因此RNA的反轉錄成cDNA,變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析。cDNA的長度反映了基地之間的標記引物和RNA的5'-端核苷酸的數量,基因產品的數量是針對性的RN
引物延伸實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試劑、試劑盒 T4多核苷酸激酶 dATP 醋酸鈉 乙醇
引物延伸的概念
中文名稱引物延伸英文名稱primer extension定 義從與模板(RNA或DNA)結合的引物3′-OH端開始,在核酸聚合酶的作用下,按照堿基配對的原則,逐個連上核苷酸,由5′→3′方向合成與模板互補鏈的過程。該反應可用于聚合酶鏈反應、單核苷酸多態性檢測等。應用學科生物化學與分子生物學(一級學
引物延伸法 RNA 分析
? ? ? ? ? ? 實驗材料 T4 多核苷酸激酶 AMV 反轉錄酶 酵母 tRNA 試劑、試劑盒 10X 激酶緩沖液
引物延伸法 RNA 分析
實驗材料 T4 多核苷酸激酶AMV 反轉錄酶酵母 tRNA試劑、試劑盒 10X 激酶緩沖液 5X 雜交緩沖溶液 Tris-HCl MgCl2 DTT 放線菌酮 D dNTP RNasin 甲酰胺上樣染液 SephadexG-25 NaAc 乙醇 [r-32P]ATP儀器、耗材 水浴 雜交爐 電泳設備
5.6 引物延伸法 RNA 分析
引物延伸法可用于 RNA 的作圖和 RNA5'端的定暈。在此方法中,將過量的 5'端標記的單鏈 RNA 引物與待測的 RNA 雜交,隨后用反轉錄酶延伸該引物,生成句 RNA 模板互補的 cDNA。再在變性條件下通過聚丙烯酰胺凝膠電泳測定 cDNA 的長度,即可確定 RNA 端的位置,并且 cDNA
引物延伸實驗問題與解答
1)什么是引物延伸實驗?引物延伸實驗用于定量mRNA的量,測定低豐度的mRNA的種類。另外引物延伸實驗可標定轉錄產物的5`-端, 確定轉錄的精確起始。特異的末端標記的引物退火到RNA鏈的互補區域, 隨后用RNA作為模板,用反轉錄酶延伸引物得到cDNA,用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析cDNA。cDNA的
引物延伸分析(primer extension analysis)
引物延伸分析(primer extension analysis)主要用于mRNA 5′端作圖。poly(A)+RNA首先與過量5′端標記的且與靶RNA互補的單鏈寡核苷酸引物雜交,然后用反轉錄酶延伸這個引物。產生的cDNA與RNA模板互補且長度與引物5′端和RNA 5′端之間的距離相等。該法在mRN