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對環境樣品（如海水、醫院表面和人類腸道）直接進行微生物測序，已經闡明了我們世界中存在的大量微生物。然而，一個微生物物種可能存在遺傳多樣性，而在宏基因組分析中往往捕獲不到這種多樣性。最近在《Genome Research》發表的一項研究中，科學家們開發了一種新的工具，來檢測細菌物種內的遺傳差異，并在母嬰微生物組和海洋宏基因組中發現了一種新的傳播模式，此前在物種水平的分析中沒有發現。 在一個給定的細菌物種中，基因內容可能與參考基因組有50%或更多的不同。本文資深作者、來自Gladstone研究所和加州大學舊金山分校的Katherine Pollard博士說：“這表明在菌株水平上的大量變異可能有真正的功能性后果。因此，迫切需要一種高效的計算工具，量化來自于鳥槍宏基因組學數據的這種變異。” 研究人員開發了一種工具——MIDAS，用于快速分析不同菌株之間的基因內容和單核苷酸變異的差異。為了創建MIDAS，研究人員首先生成一個數據庫......閱讀全文
當今，研究人員通常依賴新一代測序儀，將獨特的DNA堿基序列（只有四個）翻譯成字母：A，G，C和T。而DNA鏈長達數十億個堿基，這些機器可產生非常短的讀數，一次大約50至300個字符。為了從這些字母中提取信息，科學家們需要重建基因組的位置——這個過程類似于重建一本書中文本片段的句子和段落。 但
截至2019年12月23日，中國學者在Cell，Nature及Science在線發表了107篇文章（2019年的Cell ，Nature 及Science 已經全部更新），iNature團隊對于這些文章做了系統的總結： 按雜志來劃分：Cell 發表了31篇，Nature 發表了44篇，Scie
常用生物軟件（windows)全面介紹一、基因芯片1、基因芯片綜合分析軟件。 ArrayVision 7.0 一種功能強大的商業版基因芯片分析軟件，不僅可以進行圖像分析，還可以進行數據處理，方便protocol的管理功能強大，商業版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0
2016年11月11-12日，由中國質譜學會主辦、華質泰科生物技術（北京）有限公司承辦的“2016第四屆中國原位電離質譜會議（AIMS2016）”在廣州白天鵝賓館召開。本屆會議涵蓋原位電離質譜技術前沿基礎、原位電離質譜小型化、原位電離質譜產業化和原位電離質譜技術應用新趨勢的四大主題，吸引了兩百余
為進一步提高中國獸醫診斷服務在可靠性、準確性、及時性和高通量等方面的表現，第二屆國際獸醫檢測診斷大會將于2020年9月10-12日在南京國際展覽中心舉行。大會廣泛邀請全球獸醫檢測診斷的杰出代表與不斷進取的中國獸醫進行深層次的分享、對話及相互啟迪。大會詳情時 間：2020年9月
一些研究表明，目前已經公布的基因組存在多種污染，隨著這個問題越來越突出，我們需要找出方法來應對 Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。這位來自勞倫斯伯克利國家實驗室的生物信息學家最開始是為了比對這些微
造血干細胞（hemapoietic stem cell, HSC）是存在于造血組織中的一群原始造血細胞，它不是組織固定細胞，可存在于造血組織及血液中。造血干細胞在人胚胎2周時可出現于卵黃囊，妊娠5個月后，骨髓開始造血，出生后骨髓成為干細胞的主要來源。在造血組織中，所占比例甚少。現代醫學中，造血干
人類免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus, HIV），即艾滋病（AIDS，獲得性免疫缺陷綜合征）病毒，是造成人類免疫系統缺陷的一種病毒。1983年，HIV在美國首次發現。它是一種感染人類免疫系統細胞的慢病毒（lentivirus），屬逆轉錄病毒的一種。HIV通過
Bruce Budowle博士是北德克薩斯大學健康科學中心(UNTHSC)應用遺傳學研究所的執行主任。自2009年成立以來，該研究所集中了一大批致力于完善遺傳學方法的知名科學家，以增強幾個研究領域，包括法醫DNA。在UNTHSC的法醫科學項目(全美只有14個)
最近，美國福賽思研究所、麻省綜合醫院（MGH）和哈佛大學公共衛生學院等處的科學家，開發出一種新的方法，收集用于基因組和轉錄組分析的唾液與糞便。該方法不需要專業人員和設施，同時還能保持樣品的完整性。這種方法也為消化道微生物組的基因組成和乳糜瀉、口腔癌、牙周炎和肥胖癥相關的細菌，提供了重要的見解。
最近，美國福賽思研究所、麻省綜合醫院（MGH）和哈佛大學公共衛生學院等處的科學家，開發出一種新的方法，收集用于基因組和轉錄組分析的唾液與糞便。該方法不需要專業人員和設施，同時還能保持樣品的完整性。這種方法也為消化道微生物組的基因組成和乳糜瀉、口腔癌、牙周炎和肥胖癥相關的細菌，提供了重要的見解。
人體中最多的組成部分是什么？基因還是細胞呢？NO，NO，是機體的微生物！它們的數量與人體細胞的比例達到10∶1。僅在我們人體腸道中，就含有超過100萬億個細菌，這些細菌有助于人體消化食物，產生維生素以預防食物中細菌所誘發的疾病。 腸道菌群是指機體腸道的正常微生物群的總和，近年來關于腸道菌群的研
正常情況下，人排出的糞便中，有1/3到2/3的固體成分是腸道細菌。近年來，越來越多的證據顯示腸道微生物組對人體健康有著重要影響，也有越來越多的科學研究試圖從糞便中分析腸道菌群的特點，獲知有關疾病的線索。 本周剛剛在《自然·醫學》上在線發表的最新一批論文里，兩個跨國科學家團隊就在這一領域做出了新
微生物幾乎是無所不在的，它們對生態環境和人體健康起到了不容忽視的作用。然而人們對微生物的了解還相當匱乏，因為許多微生物是無法在實驗室中培養的。科學家們想了很多方法來探索這些“微生物暗物質”，但還不能同時鑒定微生物的身份和活性。 現在，加州理工（Caltech）和美國能源部聯合基因組研究所（DO
CRISPR領軍人物、加州大學伯克利分校的Jennifer Doudna研究團隊開始探索新型且高效的Cas系統。他們分析了宏基因組數據集，試圖確定是否天然存在更小巧的Cas酶。他們最終發現了比Cas9小得多的Cas14。 CRISPR-Cas或許連自己都想不到，如今會變得這么紅。它原本只是細菌
過去100年發生的多起事件讓世人密切關注未來發生傳染病大流行的風險。2018年是1918年流感流行的100周年，估計有數千萬人死于100年前那次流感。現在擁有比一個世紀前更好的干預措施，季節性流感疫苗，但不一定完全有效預防。每年需要接種或選擇接種的人所占比例較小。世界上還有抗生素可以幫助治療細菌
單細胞基因組學和宏基因組學是開創性的技術，可幫助研究人員評估環境微生物群落的結構和功能。現在應用這些技術的項目越來越多，但是，仍缺乏一種高通量過程來檢查所組裝的基因組序列，從而阻礙了這些技術的廣泛應用。目前，去除已上傳到公共數據庫的微生物基因組中的污染序列，還是一個手動和耗時的過程，為了去除污染
單細胞基因組學和宏基因組學是開創性的技術，可幫助研究人員評估環境微生物群落的結構和功能。現在應用這些技術的項目越來越多，但是，仍缺乏一種高通量過程來檢查所組裝的基因組序列，從而阻礙了這些技術的廣泛應用。目前，去除已上傳到公共數據庫的微生物基因組中的污染序列，還是一個手動和耗時的過程，為了去除污染
2019年3月份即將結束了，3月份Cell期刊又有哪些亮點研究值得學習呢？小編對此進行了整理，與各位分享。 1.Cell：迄今為止最大規模人體微生物組研究揭示出數千種新型微生物物種 doi:10.1016/j.cell.2019.01.001 在一項新的研究中，來自意大利特蘭托大學計算宏基
經過1500位左右的讀者投票，最后iNature編輯部得到了2019年中國生命科學領域20大進展，其中結構有2項，植物3項，生物機理研究4項，新方法/技術/動物模型6項，生物醫學5項。 結構：顏寧團隊Cav通道結構，這些結構為未來針對Cav通道病的藥物發現奠定了基礎； 中科院生物物理所饒子和
人體是由自身細胞及共生的大量微生物細胞所共同組成的復雜共生生命體。人體腸道微生物數量龐大、種類繁多，被稱為“第二基因組”。在人體微生物組學中，96-99%的微生物聚集在胃腸道，腸道微生物與機體健康有著極為密切的聯系。 本文，我們整理了腸道微生物行業的產業現狀，包括腸道微生物的應用場景、產業化
2019年上半年很快就結束了，iNature盤點了中國學者在Cell，Nature及Science發表的成果，我們發現總共有86篇（截至2019年6月24日），具體介紹如下： 4-6月發表的文章 【1】2019年6月21日，西北工業大學王文，中科院昆明動物研究所/BGI 張國捷及丹麥哥本哈根
新產品將Illumina Genome Analyzer的讀長和安捷倫SureSelect平臺有效結合，大大簡化實驗操作流程 2009年4月30日，北京——Illumina公司（NASDAQ：ILMN）和安捷倫科技（NYSE：A）于日
時光總是匆匆易逝，轉眼間，2019年就要結束了，在即將過去的一年里，科學家們在腸道微生物組研究領域取得了哪些重要的研究成果呢？本文中，小編對相關重要的研究成果進行整理，分享給大家！ 圖片來源：6xc.com.au 【1】Nat Biotechnol：突破！科學家在人類腸道微生物組中鑒別出10
5月份就要過去了，生物谷小編根據本站報道的Cell、Nature和Science文章的點擊量，對讀者們關注度比較高的文章進行了盤點，這三大期刊雖然不能完全代表整個生物學領域的進展，但仍然十分具有指導性，囊括了生物學各個領域的部分最前沿進展。癌癥，HIV以及腸道微生物仍然是讀者們最為關注的幾個領域
1977年，Science的兩篇論文描述了第一種用于確定DNA片段中化學堿基順序方法。而在這些文章發表之前，分子生物學家已經能夠排列片段。四十年過去了，如今，DNA測序技術正以驚人的速度向前發展。在過去十年中，高通量測序技術使數據生成呈指數級增長態勢。 由此產生的大量數據在基礎生物學領域的應用已經產
CRISPR-Cas或許連自己都想不到，如今會變得這么紅。它原本只是細菌體內的適應性免疫系統，現在卻能夠編輯幾乎任何生物的基因組。近年來幾種Cas酶陸續進入人們視線，但這也許只是冰山一角，科學家預測還有許多酶是未知的。 于是，CRISPR領軍人物、加州大學伯克利分校的Jennifer Doud
截至2019年12月13日，中國學者在Cell，Nature及Science在線發表了105篇文章（2019年的Cell已經全部更新完畢，而對于Nature及Science只剩下了一期，將分別會12月19日及20日進行更新），小編對于這些文章做了系統的總結： 按雜志來劃分：Cell 發表了30
截至2019年12月31日，中國學者在Cell，Nature及Science在線發表了186篇文章，其中生命科學領域有109篇，材料學有30篇，物理學有20篇，化學有12篇，地球科學有15篇。iNature團隊對于這些文章做了系統的總結： 按雜志來劃分：Cell 發表了31篇，Nature 發
一、基因檢測公司梳理 目前全國涉及基因檢測概念的公司有200余家，按照業務范圍劃分，這些公司可以分為：①最上游的基因檢測儀器開發企業（測序儀、芯片掃描儀、PCR設備），②提供樣本處理試劑和耗材的中上游企業（建庫試劑盒、檢測試劑盒、工具酶、基因芯片），③提供第三方基因檢測服務的中游企業