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    超高分辨直接觀測基因表達的染色質時空調控

    生命科學的一個基本問題是在個體發育中,單個細胞如何分化成各種類型的組織細胞。這個過程高度依賴于基因表達的精確時空調控,而這種細胞特異基因表達與染色質的調控密切相關。比如,不同的順式調控原件增強子能夠在不同細胞中選擇性地激活目標基因。每個基因經常由分布在千堿基(kb)甚至兆堿基(Mb)以外的多個增強子來調節,而增強子能夠選擇性地激活靶基因常常歸因于基因組的三維空間結構。因此,在納米尺度、千堿基分辨率條件下研究染色質的三維結構對解析胚胎發育過程中細胞分化與細胞命運決定至關重要。 基于高通量測序的染色質構象捕獲技術(3C和Hi-C)已經鑒定出大量的組織特異染色質環(loops),并發現了胚胎發育不同時期的特異染色質拓撲結構域(TADs)。但是這些研究主要是群體細胞分析的結果,并不能知道單細胞行為是否有所不同。單細胞Hi-C方法雖然揭示了染色質結構的異質性,但其分辨率不足以在單細胞水平看到清晰的TAD結構。2018年11月份,哈佛......閱讀全文

    超高分辨直接觀測基因表達的染色質時空調控

      生命科學的一個基本問題是在個體發育中,單個細胞如何分化成各種類型的組織細胞。這個過程高度依賴于基因表達的精確時空調控,而這種細胞特異基因表達與染色質的調控密切相關。比如,不同的順式調控原件增強子能夠在不同細胞中選擇性地激活目標基因。每個基因經常由分布在千堿基(kb)甚至兆堿基(Mb)以外的多個增

    超高分辨成像

    超高分辨成像 常規共聚焦的XY分辨率只有200nm左右,奧林巴斯專利FV-OSR超高分辨技術可達到120nm,適用于大部分樣品,無需特殊熒光染料,常規熒光染料、熒光蛋白均可進行成像,最多可實現4色同步超高分辨率成像。?

    STED超高分辨成像

    ?STED超高分辨成像采用受激發損耗(STED)技術,實現XY最小分辨率≤50nm,Z軸最小分辨率≤130nm。固態長壽命損耗激光器:592nm,660nm,775nm,實現不同染料的超高分辨成像,可見光全光譜覆蓋。STED WHITE 油浸物鏡 (HC PL APO 100x/1.40 OIL),

    調控基因表達的“染色質環”新因子篩選獲進展

    ? 中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院、生物島實驗室研究員姚紅杰課題組通過系統性篩選在基因組上與CTCF共定位的轉錄因子,鑒定出大量與CTCF存在高共定位率的新轉錄因子,并選取了轉錄因子BHLHE40進行后續的功能驗證,發現BHLHE40可以調控CTCF在基因組上的結合,進而影響其介導的遠距離染色質

    研究揭示染色質修飾調控植物基因表達新機制

      8月6日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心植物分子遺傳國家重點實驗室何躍輝研究組(與劉仁義研究組合作)和杜嘉木研究組(與美國威斯康辛大學鐘雪花研究組合作)在《自然-遺傳學》背靠背分別發表題為Polycomb-mediated gene silencin

    利用納米孔測序技術揭示基因表達的染色質調控基礎

      作為染色質的基本單元,核小體由大約147 bp的DNA和組蛋白八聚體(H2A, H2B, H3和H4)組成。核小體的動態定位和折疊組織會產生兩種不同的染色質狀態:“開放”(open)和“閉合”(closed)。核小體的定位和染色質狀態的動態變化對以DNA為模板的生物學過程(比如,轉錄、DNA復制

    生命科學:染色質修飾沉默植物基因表達領域獲重要突破

      在國家自然科學基金(項目編號:31721001)等資助下,中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心何躍輝課題組在染色質修飾沉默植物基因表達領域獲重要突破,發現了植物特有的染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的蛋白形成BAH-EMF1蛋白復合體,以介導高等植物基因沉默的分子機制。研究成

    染色質修飾如何調控基因表達? 中國學者提出新見解

      中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心的研究人員最新發表兩篇Nature Genetics文章,利用生化、分子、遺傳、組學及結構生物學等研究方法,分別揭示了植物特有染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的SHL和EBS形成BAH-EMF1復合體而介導植物基因沉默

    擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構及基因表達調控

      6月11日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro

    LIGHTNING超高分辨率應用實例

    隨著光學技術的日益普及,越來越多的研究者將其應用到了與人類健康密切相關的領域,但傳統的共聚焦成像已經不能滿足需求,科學家們希望在更精細的維度深入探索人類疾病的發展進程,了解病原體和宿主的相互作用,以及追蹤長時間的生物學過程。 LIGHTNING 顯著提升共聚焦分辨率和信噪比?今天給大家分享的是非常適

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