Science：利用單細胞RNA測序分析黑色素瘤
單細胞分析是一種開創性方法，如今在整個生物領域中正被用來研究一個共同的問題：如何研究異質細胞群體中的細胞多樣性。這種多樣性能夠對細胞存活和增殖、對藥物療法和干預作出的反應以及很多其他的生物過程產生深刻影響。單細胞技術已被用于眾多研究---比如，研究自身免疫疾病中的免疫反應異質性，研究傳染病中的宿主-病原體相互作用，研究人轉錄組。如今，它被用來研究癌癥組織---一種多樣性的復雜細胞環境，這經常難倒科學家們。 在過去兩年來，在美國布羅德研究所骨干成員、麻省理工學院生物學教授和霍華德-休斯醫學研究所研究員Aviv Regev的領導下，計算生物學家、細胞回路專家和布羅德研究所成員Levi Garraway的癌癥研究團隊合作接受這個挑戰。 在一項新的研究中，通過與麻省理工學院副教授、單細胞分析先鋒Alex Shalek合作，Garraway團隊研究黑色素瘤，即最為致命的皮膚癌。他們的研究有助揭示腫瘤的多樣性細胞環境，這不僅對腫瘤中......閱讀全文
Science：利用單細胞RNA測序分析黑色素瘤
單細胞分析是一種開創性方法，如今在整個生物領域中正被用來研究一個共同的問題：如何研究異質細胞群體中的細胞多樣性。這種多樣性能夠對細胞存活和增殖、對藥物療法和干預作出的反應以及很多其他的生物過程產生深刻影響。單細胞技術已被用于眾多研究---比如，研究自身免疫疾病中的免疫反應異質性，研究傳染病中的宿
淺談單細胞RNA測序的技術與分析難點
如今，單細胞生物學是一個熱門話題。而在這一領域中，最前沿的則是單細胞RNA測序（scRNA-seq）。傳統“批量的”RNA測序方法（RNA-seq）可以一次處理成千上萬個細胞，并得到變異的平均水平。但是沒有兩個細胞是完全相同的，而scRNA-seq則可以揭示出每個細胞獨特的微妙變化，甚至可以揭示全新
計算小RNA分子的單細胞測序新法
最近，卡羅林斯卡學院的研究人員開發出了一種單細胞程序，測量了單個胚胎干細胞中短的非編碼RNA序列的絕對數量。這種新方法可以加深我們對于“基因是如何被調節、不同的細胞類型如何發展”的理解。相關研究結果發表在10月31日的《Nature Biotechnology》。當我們基因中的信息被使用時――例如構
單細胞RNA測序，眾多研究都pick它
多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。 多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。單細胞測序的最初動力來自癌癥研究，可幫助人們了解腫瘤異質性和腫瘤微環
單細胞RNA測序發現新的免疫細胞
最近在《Nature Immunology》發表的一項新研究，詳細檢測了一組新發現的免疫細胞（被稱為ILC）。通過對單個扁桃體細胞的基因表達進行分析，瑞典卡羅林斯卡學院的科學家們，發現了三個以前未知的ILC子群，并揭示了關于“這些細胞在人體中如何發揮功能”的更多信息。 先天淋巴細胞（ILC）是
更便宜、更全面的單細胞RNA測序技術
康奈爾大學生物醫學工程學院助理教授Iwijn De Vlaminck課題組開發了一款更健全的、低成本的方法解決了這個問題，不僅推動了單細胞基因組學發展，而且為感染和免疫生物學研究提供了一條新途徑。這篇題為“Simultaneous Multiplexed Amplicon Sequencing
單細胞測序，解密小RNA分子的未知功能
隨著科研人員對各種遺傳疾病和癌癥的深入挖掘，單細胞基因組方法捕獲的信息變得越來越重要。卡羅林斯卡學院（ Karolinska Institute）的研究人員近日公布了一種新方法，這種方法可以讀取個體胚胎干細胞中短的、非編碼RNA序列，有助于人們更好地理解基因如何調控不同細胞類型的發展。相關結
干細胞先驅發表單細胞RNA測序新成果
人多能干細胞是研究人類胚胎發育的理想模型，可以揭示譜系分化背后的細胞和分子機制。不過，人們還不清楚單個干細胞如何退出多能狀態并轉化為相應的前體細胞。 Morgridge研究院的科學家們使用單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術，對來自人胚胎干細胞的譜系特異性前體細胞進行了轉錄組分析，揭示了
浙大80后教授發表單細胞RNA測序研究
基因表達變異是小鼠胚胎干細胞（ESC）的一個重要特征，但人們還不清楚這背后的具體原因。 浙江大學和哈佛大學的研究人員對小鼠胚胎干細胞進行了單細胞mRNA-seq分析。他們發現，這些細胞表現出的異質性是血清培養造成的。這項研究發表在一月二十一日的Cell Reports雜志上，文章的通訊作者是浙
環狀 RNA 測序案例分析
案例：以結腸癌，卵巢癌，特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是構成生物體 RNA 網絡的一部分，而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的