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    大豆突變體基因定位測序方法的改良

    隨著新一代測序技術的發展和全基因組測序(Whole Genome Sequencing, WGS)成本的不斷下降,基于WGS的分離群體分組分析(Bulk Segregation Analysis,BSA)已經成為快速定位候選基因的常規工具,但已報道的方法依然有待完善。例如,依賴于自交系雜交的QTL-seq策略,需要后期耗費大量精力進行精細定位;而基于突變體的Mutmap策略,雖然不需要后期進行精細定位,但依然需要耗費大量時間用于突變體的自交與回交。這些方法的不足限制了大規模開展功能基因定位的效率。 中國科學院東北地理與農業生態研究所大豆分子設計育種重點實驗室馮獻忠團隊,圍繞大豆突變體功能基因定位,報道了一種稱為M2-seq的改良版WGS-BSA方法。它是一種快速有效的突變基因定位工具,僅基于M2代材料即可實現候選因果突變位點的快速定位,與以前報道的需要更高世代自交與回交的方法(例如,Mutmap)相比,在時間成本和測序費用......閱讀全文

    大豆基因組重測序表明:野生大豆遺傳多樣性更高

      “中原有菽,庶民采之。”五千年前,華夏始祖將野生大豆馴化,變成今天的“五谷”之一。而今,一項被稱為“大豆回家”的基因組研究計劃在其故鄉中國取得突破。   11月15日,由香港中文大學、華大基因研究院、農業部基因組重點實驗室、中國農業科學院等單位合作完成的《31個大豆基因組重測序揭示遺傳多樣性和

    首個野生大豆高質量參考基因組被解析

      近日,香港中文大學林漢明教授團隊及華大基因等多家國內外機構合作完成了全球首個野生大豆高質量參考基因組解析,該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優化栽培大豆品種提供了重要工具。相關研究成果近日在線發表于《自然-通訊》。圖片來源于網絡  基因組信息是當前作物改良計劃的重要基礎。過往大豆基因組研究主要

    科學家通過對野生大豆基因研究發現新型耐鹽基因

      由香港中文大學、華大基因等單位聯合完成的野生大豆W05的全基因組測序工作,通過對野生大豆重要農業性狀關聯基因研究,發現了新的耐鹽基因。7月10日,最新研究成果于《自然通訊》雜志在線發表。  大約6000至9000年前,我國就開始進行野生大豆的馴化。馴化過程中,大豆的栽培種丟失了很多與環境適應相關

    雙重PCR-毛細管電泳法快速檢測大豆中轉基因成分

    【摘要】 目的建立抗草甘膦轉基因大豆的快速檢測方法。方法:針對轉基因大豆基因組中被導入的35S啟動子、NOS終止子和CP4-EPSPS抗草甘膦基因等外源基因,自行設計了兩對引物,采用雙重PCR同時擴增上述基因,用8g/L羥丙基甲基纖維素為篩分介質,在50cm×100μm i.d.涂壁毛細管中,于一1

    最聰明的生物公司在做什么?扒一扒你不知道的黑科技

      近日,美國著名的《麻省理工科技評論》評選出了全球最聰明(創造力)的50家公司。這50個名單不僅包含了亞馬遜、谷歌、微軟等互聯網巨頭,也包含了創立于2013年的Editas Medicine這一類新型公司。在這50家公司里,生物醫療相關的公司總共有15家。  在這15家公司中,有10家公司與基因相

    香港中文大學等解析全球首個野生大豆高質量參考基因組

      香港中文大學林漢明團隊和華大基因等多家機構合作,完成全球首個野生大豆高質量參考基因組解析。該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優化栽培大豆品種提供了重要依據。相關成果近日在線發表于《自然—通訊》。  “大豆的基因組含有大量重復區,組裝時困難重重。我們整合了幾種最新測序方法產生大量數據,才最終把問

    基因組學推動生命科學大步向前

      2010年下旬,河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布,向全國征集曹姓男性DNA樣本,擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。   一下子,基因組科學成為熱門,這一話題“落入尋常百姓家”。   事實上,伴隨著2

    我國已完成31個大豆基因組重測序

      由香港中文大學、華大基因研究院、農業部、中國科學院等單位合作的“大豆回家”項目研究成果,“31個大豆基因組重測序揭示遺傳多樣性和進化選擇模式”11月14日在國際著名雜志《自然—遺傳學》上在線發表。  該研究首次對野生大豆和栽培大豆全基因組進行了大規模遺傳多態性分析,為全球大豆的遺傳學研

    浙江大學特聘教授連發多篇文章梳理多個關鍵基因功能

      浙江大學生科院植物生物學研究所的壽惠霞教授研究組主要研究方向為針對水稻、大豆磷鐵吸收代謝關鍵基因的克隆及功能研究,以及大豆功能基因研究;抗除草劑大豆新種質創制研究。近期其研究組接連發表文章獲得了系列研究進展。  在Journal of Experimental Botany雜志上,研究組利用mR

    作物基因組學研究進展

      摘要:農作物基因組學研究的發展,對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展,已經實現對重要農作物,如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序,在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了2017年度主要農作物基因組

    二代測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因

      野生大豆(Glycine soja)是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱,堿,鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究,將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日,華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代

    BMC Plant Biology測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因

      野生大豆(Glycine soja)是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱,堿,鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究,將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日,華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通

    同比增長600% 達安基因公布2020年Q1財報

    生殖健康與優生優育系列*人類免疫缺陷病毒1型 (HIV-1) 核酸測定試劑盒 (PCR-熒光探針法)    48反應/盒*人乳頭瘤病毒 (6,11型) 核酸檢測試劑盒 (PCR-熒光法)    20人份/盒*單純皰疹病毒

    二代測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因

    野生大豆(Glycine soja)是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱,堿,鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究,將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日,華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通量測

    我國率先構建野生大豆泛基因組

      中國農業科學院作物科學研究所與諾禾致源等合作,在國際上率先構建和分析了一年生野生大豆的泛基因組,為作物種質資源研究和利用提供了新的方法和啟示。該研究成果9月14日在線發表于國際著名學術期刊《自然—生物技術》。  項目牽頭人、中國農科院作科所研究員邱麗娟介紹,大豆是重要的油料和高蛋白糧飼兼用作物。

    南京農業大Genome Biology構建世界首個植物重復基因數據庫

      以往的研究發現,有的植物有復制自己基因的功能,即通過不同類型復制方式產生一個與原基因序列相同的新基因。基因復制產生的兩個同源基因稱為重復基因或“姊妹基因”。近年來,隨著測序技術的不斷升級和測序成本的大幅度降低,越來越多的植物基因組被破譯。  植物在千百年的進化中,怎樣變得越來越多姿多彩?一個重要

    高通量測序技術研究進展介紹

      第二代測序技術, 又稱新一代測序技術, 是相應于以Sanger 測序法為代表的第一代測序技術而得名。第二代測序中3種主流測序技術分別為依次出現的 Roche/454 焦磷酸測序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成測序(2006 年)和 ABI/SOLiD 連接酶測序(

    遺傳發育所等鑒定大豆百粒重調控基因

      大豆是我國重要的糧食作物和經濟作物,是植物蛋白和油分的重要來源。百粒重是大豆產量的重要構成因子,因此是大豆育種的重要目標性狀。由于栽培大豆品種遺傳基礎狹窄,在育種過程中某些栽培大豆品種中優異等位的丟失,阻礙了大豆百粒重和產量的進一步增加。近年來研究人員對大豆百粒重遺傳位點的研究較多,目前SoyB

    中美大豆品種存在大量遺傳變異

    美國種植的大豆品種同中國種植的大豆品種有何不同?依據新近完成的中國大豆基因組測序,科學家發現,中美大豆品種在基因組上存在著大量的遺傳變異。中國大豆基因組測序的完成,為優良大豆品種的培育奠定了基礎。相關研究以封面文章形式在線發表于最新一期的《中國科學—生命科學》(英文版)上。作為重要的經濟作物,大豆起

    科學家首次成功克隆大豆雄性不育基因MS1

       近日,中國農業科學院作物科學研究所大豆育種技術創新與新品種選育創新團隊聯合國內優勢單位,成功克隆了大豆遺傳育種界尋覓50年的雄性不育基因MS1。5月4日,相關研究成果在線發表于《植物生物技術雜志》。  作科所孫石研究員介紹,大豆是典型的自花授粉作物,花器官小,人工雜交困難、效率低,不同地理來源

    科學家“解碼”西紅柿青島搶到成果使用權

      西紅柿是廣受大家喜愛的食物,但有誰知道它是怎么來的?是什么讓它如此美味而又營養豐富呢?22日,記者從青島農業大學了解到,經過長達8年的辛苦研究,青島農業大學教授姜國勇參與的國際番茄基因組研究于近日最終完成。   今年5月31日,國際權威學術期刊《自然》以封面文章的形式首次公布了科學家對栽培番茄

    SLAF-seq技術:大規模基因分型高通量策略

    大規模基因分型在遺傳相關性研究中起著重要作用,尤其是和高通量測序技術結合后,它為基因挖掘帶來了新的機遇。大規模基因分型的有效解決方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),該技術前期利用生物信息學方法,對目標物種的參考基因組(

    第七屆國際基因組學大會在香港成功召開

      2012年11月29日至12月1日,為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦,《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港,共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展,并深入探

    第七屆國際基因組學大會在香港成功召開

      2012年11月29日至12月1日,為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦,《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港,共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展,并深入探

    作物基因組學研究進展(一)

    作物基因組學研究進展農作物基因組學研究的發展,對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展,已經實現對重要農作物,如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序,在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了2018年度主要農

    遺傳發育所在大豆可變剪接研究中取得進展

      作為一種重要的基因轉錄后調控機制,可變剪接在真核生物中普遍發生,在基因表達和功能多樣性調控中起著重要的作用。不同物種、同一物種的不同組織以及不同基因家族的可變剪接在形式和比例上都存在差異,然而,決定這些差異的因素還尚不為人知。   中國科學院遺傳與發育生物學研究所田志喜課題組通過對來自大豆不同

    碳離子束輻照誘變大豆效應及育種研究獲進展

      重離子束是一種新型育種誘變劑,相比于其他誘變源,重離子具有較高的傳能線密度(Linear Energy Transfer,簡稱LET)和生物學效應(Relative Biological Effectiveness,簡稱RBE),可以在較高的存活率下獲得相對較高的突變率和較寬的突變譜,由此創造優

    中國大豆基因組公布并發現該基因組組裝錯誤

      大豆是重要的糧食經濟作物,為人類提供了主要的油料和蛋白資源。大豆起源于中國,古稱“菽”,約在5000年前由其野生種馴化而來,隨后廣泛傳播于世界各地。大豆在引種和改良過程中產生了遺傳瓶頸效應,使來自不同主產區的大豆品種間具有顯著的遺傳變異。目前,我們廣泛采用的大豆參考基因組來源于美國品種“Will

    我國學者利用SMRT、Hi-C等技術破解大豆Gmax_ZH13基因組

      大豆是重要的糧食經濟作物,為人類提供了主要的油料和蛋白資源。大豆起源于中國,古稱“菽”,約在5000年前由其野生種馴化而來,隨后廣泛傳播于世界各地。大豆在引種和改良過程中產生了遺傳瓶頸效應,使來自不同主產區的大豆品種間具有顯著的遺傳變異。目前,我們廣泛采用的大豆參考基因組來源于美國品種“Will

    雙重PCR-毛細管電泳法檢測大豆轉基因

                實驗方法原理 針對轉基因大豆基因組中被導入的35S啟動子、NOS終止子和CP4-EPSPS抗草甘膦基因等外源基因,自行設計了兩對引物,采用雙重PCR同時擴增上述基因,用8g/L羥丙基

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