單鏈cDNA的合成實驗
本方案利用的是總RNA,因為如果使用18SrRNA作內對照,在后續實驗中就不能使用帶poly(A)的RNA。并且必須用DNA酶處理RNA,以去除所有污染的基因組DNA。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。實驗步驟一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑去除 RNA 酶的雙蒸水10XRT-PCR 緩沖液(去除 RNA 酶的雙蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶緩沖液MMLV 逆轉錄酶(100~200U/ul)SUPERaseINRNA 酶抑制劑(20U/ul;Ambion)3. 核酸和寡核苷酸dNTP 混合物(10 mmol/L,包含所有四種 dNTP)隨機引物(5umol/L)總 RNA(達到 2.5ug)4. 實驗器材薄壁的 PCR 管二、方法1. 在冰上加 2ul50umol/L 的隨機引物到薄壁的 PCR 管中(一個......閱讀全文
單鏈-cDNA-的合成實驗
本方案利用的是總RNA,因為如果使用18SrRNA作內對照,在后續實驗中就不能使用帶poly(A)的RNA。并且必須用DNA酶處理RNA,以去除所有污染的基因組DNA。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。實驗步驟一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑去除 RNA 酶的雙蒸水10X
單鏈-cDNA-的合成實驗
一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑去除 RNA 酶的雙蒸水10XRT-PCR 緩沖液(去除 RNA 酶的雙蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶緩沖液MMLV 逆轉錄酶(100~200U/ul)SUPERaseIN
單鏈-cDNA-的合成實驗
實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑去除 RNA 酶的雙蒸水10XRT-PCR 緩沖液(去除 RNA 酶的雙蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶緩沖液
反轉錄合成單鏈-cDNA-實驗
cDNA 合成反應的體積,依賴于所用的錨定-任意引物組合的數目。下面提供的方案,適用于 24 個引物組合和兩個樣品。對于更多的樣品和/或更多的引物組合,調整相應主體混合液的體積。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒RNART主體混合液儀器、耗材薄壁PCR管離心管
反轉錄合成單鏈-cDNA-實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 RNA RT主體混合液 儀器、耗材 薄壁PCR管 離心管 熱循環儀
反轉錄合成單鏈-cDNA-實驗
試劑、試劑盒 RNART主體混合液儀器、耗材 薄壁PCR管離心管熱循環儀實驗步驟 一、材料1.核酸和寡核苷酸來自方案2的RNA為每個單獨的H-T11M引物,分別配制RT主體混合液蒸餾水 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?28.2ul5XRT緩沖液 ? ? ? ? ? ?
cDNA文庫構建技術cDNA鏈的反轉合成
實驗概要構建cDNA文庫是一種獲得目標基因并進一步進行基因重組,基因克隆的重要方法,而在該文庫構建中有mRNA 逆轉錄出cDNA是一步極為關鍵的操作。mRNA的逆轉錄主要由MMLV、AMV兩種逆轉錄酶催化合成cDNA,在這個逆轉錄過程中,模板mRAN及逆轉錄酶是兩個最重要的影響因素。對于mR
cDNA文庫構建技術cDNA鏈的反轉合成
構建cDNA文庫是一種獲得目標基因并進一步進行基因重組,基因克隆的重要方法,而在該文庫構建中有mRNA 逆轉錄出cDNA是一步極為關鍵的操作。mRNA的逆轉錄主要由MMLV、AMV兩種逆轉錄酶催化合成cDNA,在這個逆轉錄過程中,模板mRAN及逆轉錄酶是兩個最重要的影響因素。對于mRNA來講,一
cDNA-合成實驗
試劑、試劑盒二硫蘇糖醇dNTP隨機引物來自方案 4 的 RNA 樣品RNasin反轉錄緩沖液儀器、耗材PCR 管子熱循環儀實驗步驟一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑0.1mol/L 二硫蘇糖醇dNTP(每種 2.5 mmol/L)隨機引物(20~40U/ml)(1034731,RocheApplied
cDNA-合成實驗
試劑、試劑盒 二硫蘇糖醇dNTP隨機引物來自方案 4 的 RNA 樣品 RNasin反轉錄緩沖液儀器、耗材 PCR 管子 熱循環儀實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑0.1mol/L 二硫蘇糖醇dNTP(每種 2.5 mmol/L)隨機引物(20~40U/ml)(1034731,RocheAp
cDNA-合成實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 二硫蘇糖醇 dNTP 隨機引物 來自方案 4 的 RNA 樣品 RNasin 反轉錄緩沖液
cDNA文庫組標準流程三:cDNA雙鏈合成
1. Superscipt II—RT合成第一鏈:1. 在一RNase-free的0.2ml PCR管中,加入???????? xul?? mRNA(大約500ng)???????? 1ul?? Xho I Primer(1.4ug/ul)?????????? (5’ GAGAGAGAGAGAGAG
cDNA第一鏈的合成的方法
所有合成cDNA第一條鏈的方法都要用依賴于RNA的DNA聚合酶(反轉錄酶)來催化反應,主要有兩個關鍵因素,一個是mRNA模板,另一個是反轉錄酶 。商品化反轉錄酶有從禽類成髓細胞瘤病毒純化到的禽類成髓細胞病毒(AMV)逆轉錄酶和從表達克隆化的Moloney鼠白血病病毒反轉錄酶基因的大腸桿菌中分離到的鼠
關于cDNA第一鏈的合成介紹
所有合成cDNA第一條鏈的方法都要用依賴于RNA的DNA聚合酶(反轉錄酶)來催化反應,主要有兩個關鍵因素,一個是mRNA模板,另一個是反轉錄酶 [3] 。商品化反轉錄酶有從禽類成髓細胞瘤病毒純化到的禽類成髓細胞病毒(AMV)逆轉錄酶和從表達克隆化的Moloney鼠白血病病毒反轉錄酶基因的大腸桿菌
cDNA第二鏈的合成方法
cDNA第二鏈的合成方法有以下幾種:(1)自身引導法。合成的單鏈eDNA3’端能夠形成一短的發夾結構,這就為第二鏈的合成提供了現成的引物。當第一鏈合成反應產物的DNA—RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶I Klenow片段或反轉錄酶合成eDNA第二鏈,最后用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環,
RLMRACE法合成雙鏈cDNA
實驗概要掌握合成雙鏈cDNA的RLM-RACE技術,可構建高質量的cDNA文庫。主要試劑1.?酶類及分子量標準?? 1)? 高保真酶Easy-A high fidelity cloning enzyme,Merck公司Stratagene系列;?? 2)?Taq DNA Polymerase,上海申
關于cDNA第二鏈的合成方法介紹
(1)自身引導法。合成的單鏈eDNA3’端能夠形成一短的發夾結構,這就為第二鏈的合成提供了現成的引物。當第一鏈合成反應產物的DNA—RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶I Klenow片段或反轉錄酶合成eDNA第二鏈,最后用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環,即可進一步克隆。但自身引導合成法
cDNA的合成
一 原理 逆轉錄PCR?(RT-PCR) 具有靈敏度高、專一性好、簡便快捷等優點,其不僅是定量檢測微量樣品和表達水平低的基因的一種有效方法,同時也是從真核生物中獲得目的基因的一條重要途徑。 cDNA的合成是RT-PCR的重要環節。以mRNA為模板,在逆轉錄酶的催化下,隨機引物、oligo(dT)或基
CDNA第一條鏈的合成-(20微升體系)
CDNA第一條鏈的合成 (20微升體系)一、??按以下順序加樣于500微升EP管中1. RNA 5 UL2. Oligo Dt 1 UL3. dNTP 1 UL (濃度10mM)4. DEPC水 5UL (為試劑盒中配套的水)共12UL混勻離心——70℃水浴5分鐘——冰浴2分鐘(片刻)二、??繼續按
cDNA的合成實驗原理和操作步驟
一、實驗目的掌握植物cDNA合成的原理和方法二、實驗原理反轉錄酶主要用于體外cDNA的合成。目前最常用的反轉錄酶(reverse transcriptase) 有SuperscriptII、M-MLV和AMV等。它們具有依賴于RNA或DNA的DNA聚合酶活性和RNaseH酶活性,可以以RNA分子
cDNA合成技術
實驗材料RNA試劑、試劑盒α32PdNTPmRNA甲基氫氧化汞β-巰基乙醇RNase抑制劑引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆轉錄酶EDTA酚-氯仿乙醇瓊脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1儀器、耗材SephadexG-100離心柱層析離心管恒溫水浴鍋電泳儀低溫離心機實驗步驟
cDNA合成技術
實驗材料 RNA試劑、試劑盒 α32PdNTPmRNA甲基氫氧化汞β-巰基乙醇RNase抑制劑引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆轉錄酶EDTA酚-氯仿乙醇瓊脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1儀器、耗材 SephadexG-100離心柱層析離心管恒溫水浴鍋電泳儀低溫離心機實
cDNA合成技術
? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試劑、試劑盒 α32PdNTP mRNA 甲基氫氧化汞 β-巰
單鏈Oligo合成與DNA組裝技術-(二)
2.2 Golden Gate組裝Golden Gate組裝技術是基于非同源重組的代表性技術,其利用Ⅱ型限制性酶 BsaⅠ在識別位點外部切割的特性,設計特異的突出序列同時組裝多個片段,且酶切和酶連可以同時進行,原理如圖3所示。首先,擴增目的片段,在兩端加上BsaⅠ識別序列,同時在識別序列內側
單鏈Oligo合成與DNA組裝技術-(一)
合成生物學作為迅速發展的交叉學科,已在生物醫藥、新材料、診斷、能源和數據儲存等領域展現越來越廣泛的應用潛力。合成基因組學作為合成生物學的重要研究方向,著重于新生命體系的從頭設計與合成,其以Oligo(寡核苷酸鏈)合成、拼裝和轉移等核心技術為支撐。新生命體系的從頭設計與合成不僅需要合成組成基因組的小片
cDNA合成技術3
2. 電泳分析(1) 用50mM NaCl, 1mM EDTA制備1.4%的堿性瓊脂糖電泳, 并置堿性電泳緩沖液中30分鐘。(2) 取樣品液, 用TE調整體積, 使第一鏈和第二鏈產率測定液的體積相同,加入等體積的2×樣品緩沖液(20mmol/L NaOH, 20%甘油,0.025%溴粉蘭)。(3)
cDNA合成技術2
3. 第一鏈產量測定第一鏈摻入率(%)= 摻入cpm/總cpm ×100%摻入dNTP(nmol)=2nmol dNTP/μl ×反應體積(μl)×(第一鏈摻入率)設330為每mol dNTP的平均分子量合成cDNA量(ng)=摻入dNTP (nmol)×330ng/nmolmRNA向cDNA轉變率
cDNA合成技術1
Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系統采用M-MLV反轉錄酶的RNase H缺失突變株取代AMV反轉錄酶,使合成的cDNA更長。該系統的第一鏈合成使用M-MLV反轉錄酶,cDNA第二鏈合成采用置換合成法,采用 RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ進行置換合成
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料 3' 引物鏈親和素磁珠儀器、耗材 電泳儀PCR 儀離心機凝膠成像儀
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗可用于:(1)體外診斷;(2)體內治療等。實驗方法原理SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料3