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    重測序構建芝麻超高密度圖譜以及花序基因的定位

    連鎖分析尋找QTL位點,是最經典的性狀定位方法。而遺傳圖譜的密度是限制定位精度的其中一個方面。目前,構建圖譜的方法已從基于傳統的SSR、AFLP等基于片段長度多態性的分子標記,過渡到了基于SNP芯片或NGS測序的SNP分子標記。NGS測序最常用的是簡化基因組測序和全基因組重測序,區別在于標記數量的多少。隨著測序價格的不斷降低,重測序高密度標記的優勢將更加明顯。本文介紹了伯豪客戶近期的一篇使用重測序(該研究中重測序服務由伯豪生物提供)構建圖譜進行QTL定位的文章。研究背景芝麻是重要的油籽作物,具有無限花序的特征,俗稱“芝麻開花節節高”。但是,這樣的性狀使種子不同時間成熟,極不利于作物收集,影響農產品質量。圖1. 無限花序(Dt)和有限花序(dt)的形態區別。其中dt型僅在莖頂端形成花簇。技術路線研究結果在此前的QTL定位研究中,使用構建的芝麻遺傳圖譜遠未達到飽和。這項研究使用了全基因組重測序策略,對兩種生長特征的親本和其F2群體構......閱讀全文

    重測序構建芝麻超高密度圖譜以及花序基因的定位

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