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  • 發布時間:2015-02-10 10:48 原文鏈接: Science:單細胞分析?并行測序技術可以

      近日,一項發表于國際雜志Science上的研究論文中,來自美國的研究者描述了一種新型的大規模并行技術,通過利用新一代測序技術來在單細胞水平上實現對基因表達的監測;研究者表示,單細胞分析對于理解人類造血系統的必要性及重要性不斷凸顯,如果沒有這種分析的話,來自少許細胞的大量表達改變就和來自許多細胞的小型表達改變就會變得一樣沒有差別。

      文章中,研究者描述的這種“基于基因表達細胞計數的簡單方法”是利用細胞和分子特異性的條形碼來使得數萬個基因或者成千上萬個細胞被同時進行研究;單一的細胞和包含引物的顆粒會被置于微孔板中,當細胞被裂解后mRNA就會同顆粒上的條形碼引物進行雜交,這種顆粒可以實現磁性恢復并且移動到小管中進行反向轉錄和擴增,隨后再進行新一代測序分析。

      研究者Christina Fan說道,對擴增產物進行測序揭示了一種細胞標簽、分子索引以及基因的身份,而計算機分析可以對基于細胞標簽的測定序列進行聚合,從而利用相同的分子索引及基因測序信息對其進行拆解,進而實現對每一個細胞的每一個基因確定其完全的轉錄數量。這種特殊的標簽策略及大量的并行技術就可以使得對基因活性的單細胞分子變得可行,從而使得任何研究者都可以利用該方法進行分析。

      本文研究中研究人員還利用這種新技術報道了來自多種類型造血細胞的數據,研究者分析了1.5萬個細胞,在一系列的實驗中研究者描述了組成機體活躍造血系統的單一細胞亞型,同時他們也表示可以利用這種新技術在極低水平的正常細胞中也能夠檢測出罕見的惡性細胞類型。

      最后研究者Stephen Fodor博士說道,本文研究中開發的新型分析技術為后期進行發育生物學及相關疾病研究打開了一扇大門,檢測大量單個細胞的遺傳特性或許可以幫助開發出病人響應率較高的新型療法,當然也為開發早期有效的診斷手段提供了新的研究思路和線索。

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