ThermoFisher推出ProteomeDiscoverer蛋白質組學軟件

Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白質組學研究的突破性生物軟件

質量信息學平臺提供了強大的分析、開放和靈活架構，易于使用的界面

2008年5月30日，圣何塞，服務科學，世界領先的賽默飛世爾科技公司，今天宣布將在ASMS 2008（第56屆美國質譜大會）上，推出Proteome Discoverer，一款新的蛋白質組學分析軟件平臺，提供最全面的蛋白質組學定性定量數據查看。Proteome Discoverer使研究者可以在比以往更大的規模上，在一個程序里合并和比較從多個搜索引擎、公共數據庫和裂解方法中獲得的數據，并且易于使用、靈活。Proteome Discoverer強大的定量分析能力包括：工業標準級的最好實踐，新的賽默飛世爾科技的解決方案，同位素標記技術，如iTRAQ?和TMT?。

科學家們已經花費了十年的時間來完善蛋白測序，但發現目前的軟件產出的，僅是比一個定性數據列表多不了幾個的結果。取代了賽默飛世爾科技BioWorks?的Proteome Discoverer，是第一個商用的蛋白質組學數據分析平臺，使研究者們可以在一個程序中，合并、比較和分析從多個來源來的數據。

“今天的科學家們想要的，是比從他們的分析程序中的一個搜索引擎和一個蛋白序列多得多的結果，但是他們不想雇用一個完整的生物信息學團隊去獲得這些結果。”Andreas Huhmer，賽默飛世爾科技蛋白質組學市場總監說，“Proteome Discoverer是一套完全的流程解決方案，提供了功能性的一個層次，而迄今為止，達到這種層次要求一套復雜且昂貴的、客戶自建的解決方案。我們的軟件是一流的并且易于定制，因此研究者可以集中精力開展研究，而不用編程——科學不應該被軟件所局限。”

Proteome Discoverer可分析從所有的賽默飛世爾科技的質譜儀上獲得的數據，并兼容所有的標準蛋白質組學流程。它向上兼容使用BioWorks產生的數據，對現在的BioWorks用戶，提供無縫的升級途徑。Proteome Discoverer包括了SEQUEST檢索算法的許可（license），而SEQUEST是確定性的蛋白鑒定的工業標準。

Proteome Discoverer是一個開放和靈活的平臺，集成了新的工具，數據源和分析方法。

Proteome Discoverer一個主要的優點是從多種裂解方法中分析信息的能力，從而去發現更多的翻譯后修飾（PTMs），并提高多肽和蛋白鑒定的準確度。比如，在單次操作中，CID（碰撞誘導解離）和ETD（電子轉移解離）數據能被同時分析，提供結果的序列、翻譯后修飾和交叉確認信息。并且，從賽默飛世爾科技專有的、Z-Core算法（該算法分析由ETD產生的C-離子和Z-離子譜圖）中獲得的信息，能和CID譜圖數據合并檢索，在一個簡單易讀的格式中提高蛋白的覆蓋率（protein coverage）。

相似的，使用Proteome Discoverer的工作流程引擎，Proteome Discoverer使研究者可合并搜索引擎結果和公共數據庫信息，提供交叉確認的多種方法。例如，從Mascot?和SEQUEST等不同的搜索引擎中獲得的數據，可被合并入單個的報告中。其它的軟件特征包括：錯誤發現速率的自動化計算，可允許比較數據庫搜索引擎的結果。

Proteome Discoverer是一個開放的平臺，和常用的生物信息學工具兼容，比如InforSense KDE環境；同時也支持人類蛋白質組學組織（HUPO）開發的所有數據標準，如ProtXML和mzML文件格式。一個新的開發包，會在今年晚些的時候發布，將使研究者可定制平臺。

賽默飛世爾科技的Proteome Discoverer支持客戶服務器端應用的版本已開始銷售，具有靈活的授權模式和價格。關于Proteome Discoverer和賽默飛世爾科技產品的更多信息，請訪問賽默飛世爾科技在第56屆美國質譜大會（ASMS，丹佛， 6月1日至5日）的展臺，展位號：booth 41。或者訪問：www.thermo.com/proteomics

SEQUEST是美國華盛頓大學（University of Washington）的注冊商標
Mascot是Matrix科技公司的商標

關于Thermo Fisher Scientific（賽默飛世爾科技，原熱電公司）
Thermo Fisher Scientific(賽默飛世爾科技)（紐約證交所代碼：TMO）是全球科學服務領域的領導者，致力于幫助客戶使世界更健康、更清潔、更安全。公司年銷售額超過100億美元，擁有員工約33,000人，在全球范圍內服務超過350,000家客戶。主要客戶類型包括：醫藥和生物公司，醫院和臨床診斷實驗室，大學、科研院所和政府機構，以及環境與工業過程控制裝備制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific這兩個主要的品牌，幫助客戶解決在分析化學領域從常規的測試到復雜的研發項目中所遇到的各種挑戰。Thermo Scientific能夠為客戶提供一整套包括高端分析儀器、實驗室裝備、軟件、服務、耗材和試劑在內的實驗室綜合解決方案。Fisher Scientific為衛生保健，科學研究，以及安全和教育領域的客戶提供一系列的實驗室裝備、化學藥品以及其他用品和服務。賽默飛世爾科技將努力為客戶提供最為便捷的采購方案，為科研的飛速發展不斷地改進工藝技術，提升客戶價值，幫助股東提高收益，為員工創造良好的發展空間。欲獲取更多信息，請瀏覽公司的網站：www.thermo.com.cn