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細胞有一套精妙的機制，根據環境變化調整蛋白質合成的速率。翻譯調控大多發生在起始階段，通過快速改變蛋白的表達水平，幫助細胞靈活應對外界壓力。 盡管人們早就意識到翻譯起始的重要性，但直接檢測單個mRNA的起始率一直比較困難。對起始密碼子進行系統性作圖，精確檢測相應的起始率，無疑將為翻譯調控領域帶來一場變革。 日前，康奈爾大學的研究團隊開發了一種定量分析翻譯起始的新測序技術，定量翻譯起始測序（QTI-seq）。該技術能夠在單核苷酸分辨率上對起始翻譯的核糖體進行實時作圖。這項研究發表在最近一期的Nature Methods雜志上，文章的通訊作者是康奈爾大學營養系助理教授錢書兵（Shu-Bing Qian）。錢書兵博士早年畢業于上海交通大學醫學院。主要研究興趣包括營養信號通路、應激反應、蛋白質合成、以及它們在人類疾病中的意義。 QTI-seq得到的翻譯起始圖譜不僅揭示了多樣化的起始密碼子選擇，還展現了在營養匱乏條件下細胞翻譯起始......閱讀全文
核糖體絕對是維持生命必不可少的一份子，因為細胞生長所需的各種蛋白全都是通過核糖體合成而來的。多年以來，主流的觀點都認為，核糖體蛋白或者核糖體組裝因子如果發生突變，對于發育中的胚胎一定是個致命性的打擊。小鼠試驗也發現，徹底喪失任意一種核糖體蛋白往往都會使胚胎夭折。可是核糖體蛋白或者核糖體組裝因子突
來自約翰霍普金斯大學的研究人員說，他們發現在所有細胞中負責構建蛋白質的分子機器——核糖體有時候甚至會在信使RNA的非翻譯區內合成蛋白質，這對長期以來為人們所接受的生物學理論提出了意外的挑戰。 霍華德休斯醫學研究所研究員、約翰霍普金斯大學醫學院分子生物學與遺傳學教授Rachel Green博士說
【1】elife：核糖體也能調控基因的表達？ doi：10.7554/eLife.45396 來自Stowers醫學研究所的研究人員發現了人體細胞中核糖體的一種新功能，即存在破壞正常mRNA的功能。“很長一段時間以來，很多人都認為核糖體是細胞中生產蛋白質的分子機器，”Stowers助理研究員
在蛋白質的合成過程中，RNA翻譯會影響蛋白質的折疊，而蛋白質折疊也會影響RNA的翻譯。 在過去的十年里，我們對細胞內蛋白質合成方式的認知取得了快速的增長，其中包括蛋白質合成的各個基本步驟：轉運RNA（transfer RNA， tRNA）是如何高保真、高速率地對信使RNA（messenger
一個細胞的內部運作涉及到不計其數的單個分子，它們參與到重復循環的相互作用之中來維持生命。蛋白質形成就是這種生命活動的基礎。 賓夕法尼亞大學的Joshua B. Plotkin教授說，由于蛋白質是細胞功能的基礎構件，科學家們一直以來對于細胞生成蛋白質的機制都極其地感興趣。 “蛋白質
6月17日的Science出了一期關于RNA的特刊。RNA與基因表達的分子生物學緊密相關：有形成特定結構的能力；作為信號載體；對自身的調節。例如非編碼小分子RNA，已知是基因表達的調控因子，和哺乳動物干細胞基因表達變化相關，而這種變化反過來和胚胎發育過程中細胞命運的決定有聯系。 DNA甲基化是
近日，華南理工大學林影教授和暨南大學張弓教授的團隊在Biotechnology for Biofuels雜志（生物工程類一區）上發表文章，使用翻譯全局控制方法，改善外源蛋白質在畢赤酵母中表達的折疊效率，有效提高活性蛋白質產量。據悉，這是翻譯組調控在真核生物細胞工廠底盤細胞中的首次成功應用，極大地
實驗方法原理 細胞的環境、復制周期的狀態和分化狀態的改變會引起一些 mRNA 半衰期的改變。 實驗材料
病毒感染可以引起多種疾病，嚴重威脅人類健康。但機體也并非坐以待斃，而是進化出多種方式感知病毒的感染并通過激活自身的免疫系統清除體內的病毒。病毒的感染誘導干擾素產生，而干擾素上調多種干擾素刺激基因(ISGs)的表達。根據已有報道，ISGs在HIV-1 病毒復制期的多個步驟以不同機制抑制病毒【1】。
實驗方法原理 細胞的環境、復制周期的狀態和分化狀態的改變會引起一些 mRNA 半衰期的改變。實驗材料 DEPC細胞多聚核糖體RNA底物試劑、試劑盒 乙酸鉀乙酸鎂DTTTris-乙酸組織培養液無菌去離子水磷酸肌酸ATPGTP乙酸鉀精胺RNase 抑制劑儀器、耗材 高溫烤箱勻漿器研杵低速離心機超速離心機
核糖體是細胞內蛋白質生成的重要場所，有著蛋白質“合成工廠”之稱。當經由轉錄過程生成的mRNA從細胞核出來后，核糖體會與之結合，并在tRNA的協助下啟動翻譯過程形成蛋白質。在真核生物的進化過程中，核糖體的大小也明顯增加，主要由rRNA和蛋白質構成。 很多科學家認為，這一生成蛋白質的關鍵車間都是相
蛋白質翻譯一直是科學家們重點研究的生物學過程。目前人們對翻譯過程的常規機制已經有所了解，不過實際上蛋白的合成方式并不只有一種。 Arizona州立大學的研究人員，首次在全基因組范圍內研究了不依賴帽子結構的翻譯機制，鑒定了在這一機制中作為翻譯增強元件(TEE)的mRNA序列，這些序列位于編碼
細胞的環境、復制周期的狀態和分化狀態的改變會引起一些 mRNA 半衰期的改變。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編：鄭曉飛。實驗方法原理細胞的環境、復制周期的狀態和分化狀態的改變會引起一些 mRNA 半衰期的改變。實驗材料DEPC細胞多聚核糖體RNA底物試劑、試劑盒乙酸鉀乙酸鎂DTTTris-乙酸
翻譯是核糖體讀取mRNA上承載的遺傳信息并轉譯為氨基酸序列的有序過程。mRNA序列除了包含氨基酸序列的信息，還可能攜帶調控翻譯延伸速率的信息。但相比于從密碼子到氨基酸的明確對應關系，學界關于翻譯延伸速率的調控信息知之甚少。新興的ribo-seq技術通過RNA酶降解無核糖體“保護”的mRNA片段，
來自哈佛大學的研究人員報告稱，她們在活細胞中實時成像了單個mRNA分子翻譯。這一重大的突破性成果發布在5月5日的《細胞》（Cell）雜志上。 論文的通訊作者是著名的華人女科學家莊小威（Xiaowei Zhuang）。莊小威早年畢業于中國科技大學少年班，34歲時成為了哈佛大學的化學和物理雙學科正
一種名叫核糖體的細胞器可生產蛋白質。過去許多研究學者認為，核糖體之間不存在差別，任意一個核糖體能制造體內任何蛋白。6月15日一篇挑釁性文章表明，有一些核糖體只生產專門產品，其他蛋白質生產概不負責！ 生物學家們爭論不休，到底核糖體有沒有“術業”分工？在這篇《Molecular Cell》文章發表
核糖體是負責蛋白質合成的重要細胞結構，美國西北大學和哈佛大學的研究人員首次通過模擬天然程序，成功在體外合成了有功能的核糖體。文章于六月二十五日發表在Nature旗下的Molecular Systems Biology雜志上。 在體外人工構建核糖體，一直是合成生物學領域的研究熱點。在此之
最近，有研究報道CRISPR-Cas9系統能夠靶定病毒RNA，因此這種現象提出了一個有趣的問題：Cas9是否也可能影響細胞mRNAs的翻譯。7月13日，來自深圳大學第一附屬醫院的研究人員，在Nature子刊《Scientific Reports》上發表題為“Targeting cellular
外源基因在原核細胞中表達是基因工程操作中最初取得成功的途徑。1 原核生物基因表達的特點同所有的生命過程一樣，外源基因在原核細胞中的表達包括兩個主要過程:即 DNA轉錄成mRNA和 mRNA翻譯成蛋白質。與真核細胞相比，原核細胞的表達有以下特點:①原核生物只有一種RNA 聚合酶(真核細胞有三種)識別原
生物通報道：在核糖體翻譯mRNA的過程中，許多情況都會導致翻譯停頓，終止步驟也常常發生。除了細胞編程好的停頓以外，停在mRNA上的核糖體需要被終止和回收，以維持細胞的翻譯能力。 有很大一部分核糖體停頓來自于缺乏終止密碼子的異常mRNA。轉錄錯誤、初級轉錄本錯誤加工、以及mRNA錯誤剪切，都會形
來自佛羅里達大學斯克里普斯研究所的科學家們確定了成功生成細胞的基本工作單位――蛋白質的一系列復雜的生化步驟。相關論文發布在7月6日的《細胞》(Cell)雜志上。 該研究闡明了活細胞內大型復雜蛋白質生產機器核糖體的組裝。核糖體是許多商業用抗生素的靶點，由于核糖體組裝和功能對于細胞生長極其重要
在基因表達研究中，研究者比較注意選擇合適的表達載體和宿主系統，而往往忽視基因本身是否與載體和宿主系統為最佳匹配這樣一個實質性問題。基因的最佳化表達可以通過對基因的重新設計和合成來實現，如消除稀有密碼子而利用最佳化密碼子，二級結構最小化，調整GC含量等。以下就密碼子最佳化、翻譯終止效率和真核細胞
近20年來，高通量技術的發展支持了大規模的基因組、轉錄組和蛋白質組定量分析。這些數據被用來分析在不同系統和條件下轉錄組與蛋白質組的定量關系。這些研究有時候會導致一些沖突的結論，尤其是究竟在何種程度上mRNA的量控制了蛋白質的量。 基礎生命科學研究和轉化生命科學研究的一個核心問題是：基因組
在基因表達研究中，研究者比較注意選擇合適的表達載體和宿主系統，而往往忽視基因本身是否與載體和宿主系統為最佳匹配這樣一個實質性問題。基因的最佳化表達可以通過對基因的重新設計和合成來實現，如消除稀有密碼子而利用最佳化密碼子，二級結構最小化，調整GC含量等。以下就密碼子最佳化、翻譯終止效率和真
在核糖體這個復雜的蛋白質合成機器上每個組成核糖體的蛋白都有自己的分子伴侶將其指引到正確位置，避免受到損傷。在一項新研究中，研究人員了解到了更多關于核糖體分子伴侶如何發揮作用的信息，發現每個分子伴侶都會以獨特的方式與被保護的蛋白結合。研究人員借助X射線晶體成像技術解析了結合分子伴侶的核糖體蛋白的原
本周又有一期新的Science期刊（2020年1月31日）發布，它有哪些精彩研究呢？讓小編一一道來。圖片來自Science期刊。 1.Science：在神經元突起中，單核糖體偏好性地翻譯突觸mRNA doi:10.1126/science.aay4991 RNA測序和原位雜交揭示了神經元樹
基因表達(gene expression)是指儲存遺傳信息的基因經過一系列步驟表現出其生物功能的整個過程。典型的基因表達是基因經過轉錄、翻譯，產生有生物活性的蛋白質的過程。基因的表達主要涉及到兩個過程：轉錄和翻譯。 第一節影響外源基因表達的因素 利用基因工程技術
蛋白質是多肽鏈組成的三位結構，多肽鏈的氨基酸序列由DNA密碼書寫，編寫多肽鏈的過程發生在核糖體，它們被稱為蛋白質合成機器。根據遺傳密碼，來自DNA拷貝序列的信使RNA逐個聚合氨基酸分子，直到整條鏈的終點才從核糖體上脫離。 核糖體合成蛋白質的過程被稱為“翻譯”，所以生物體的所有蛋白質都是通過翻譯
輸送 信號肽可使正在翻譯的核糖體附著到rER膜上。 在信號肽指引下蛋白質在細胞內的輸運 核糖體是通過信號肽的功能而附著并合成分泌蛋白的。因此游離的核糖體和膜結合核糖體之間本身并無差異。信號肽是作為一種附著到ER膜上的信號識別，此可能通過開始合成出的N-端頭幾個氨基酸的疏水功能。然后蛋白鏈插
在穩定狀態的時候，mRNA的水平決定了蛋白質的水平，而且蛋白質的合成會有延遲(Figures 3A and 3B)。很難嚴格地定義“穩定的狀態”，姑且認為我們通常做組學實驗時收集的細胞，如果在某個時間段內(通常幾小時)的蛋白或者mRNA水平保持相對恒定，則被看做是 “穩定的狀態”。在短暫的適