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2015年7月28日，北京協和醫院和華大基因等機構的研究人員共同合作完成了類風濕關節炎（RA）口腔和腸道微生物元基因組研究。本項研究揭示口腔和腸道微生物菌群異常是RA病理生理和疾控的重要環節，并且為元基因組學輔助的RA個性化診療方案提供基礎。研究成果于今日發表在《自然醫學》雜志。 RA是一種致殘率較高的自身免疫性疾病，全球患者多達數千萬。一直以來RA被認為可能與細菌感染有關。然而，人們對可能參與疾病發生或疾病保護的細菌及其功能知之甚少。此外，雖然甲氨蝶呤等改善病情的抗風濕藥（DMARDs）能緩解病情，卻無法徹底根治，而且可能有嚴重的副作用。因此，全面了解RA相關的微生物菌群或有助推動我們對RA病理生理的深入探索、早期診斷和精準醫療。本研究中，北京協和醫院和華大基因的團隊合作，收集了未經DMARDs治療RA患者的牙菌斑、唾液和糞便樣本，以健康人群（包括直系親屬和共同生活無血緣關系親屬）作為對照，采用元基因組鳥槍法測序技術檢測......閱讀全文
元基因組是當前微生物組大數據最主要的存在形式之一。由于元基因組數據的復雜性、異質性以及指數級增長的體量，從中深度且快速發掘微生物群落結構和功能上的變化規律，一直是業界的一個重要技術瓶頸。近日，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心發表了元基因組高性能計算分析軟件Parallel-MET
元基因組是指一定環境下整個微生物群落中的所有遺傳信息的總和。元基因組數據的收集與分析克服了傳統分離培養方法僅局限于群落中可培養組分（一般僅占1%）的缺陷，使挖掘、認識與利用不可培養的組分（即另外之99%）成為可能，為全面研究自然狀況下微生物群落的結構與功能提供了新途徑。 元基