深度學習在基因表達譜分析上取得重要進展
近日，一項刊登在國際雜志Bioinformatics上的研究論文中，來自加州大學爾灣分校和博德研究所的研究人員通過深度學習算法進行大規模基因表達預測，并在預測精度上獲得了顯著提升。 全基因組表達譜分析被廣泛應用于描述細胞在不同生理病理條件下的活動狀態，例如不同的癌組織細胞在各種給藥條件下會產生截然不同的生理反應和表達譜。然而由于其相對昂貴的成本，目前只有少數資金充足的實驗室能夠進行大規模全基因組表達譜分析。 雖然人體全基因組含有約22000個基因，但是大量數據表明絕大部分基因的表達譜之間存在高度關聯。基于此假設，博德研究所的研究人員開發出L1000芯片技術，能以十分低廉的價格（~5$/樣本）測量約1000個"標桿"基因的表達譜。在此基礎之上，研究人員便可以結合已有的全基因組表達譜數據，計算預測剩余的約21000個"目標"基因的表達譜。目前研究人員采用基于線性回歸的計算模型進行預測，而大量實驗表明基因表達譜之間存在廣泛的非......閱讀全文
深度學習在基因表達譜分析上取得重要進展
近日，一項刊登在國際雜志Bioinformatics上的研究論文中，來自加州大學爾灣分校和博德研究所的研究人員通過深度學習算法進行大規模基因表達預測，并在預測精度上獲得了顯著提升。 全基因組表達譜分析被廣泛應用于描述細胞在不同生理病理條件下的活動狀態，例如不同的癌組織細胞在各種給藥條件下會產生
2016值得關注的技術：基因組分析深度學習
《Nature Methods》盤點2015年度技術，選出了最受關注的技術成果：單粒子低溫電子顯微鏡（cryo-EM）技術。 除此之外，也整理出了2016年最值得關注的幾項技術，分別為：細胞內蛋白標記（Protein labeling in cells）、細胞核結構（Unraveling nuc
科研人員發現深度學習揭示基因相互作用
近日，卡內基梅隆大學計算機科學家采用了一種深度學習方法，近年來徹底改變了人臉識別和其他基于圖像的應用程序，并將其功能重定向到探索基因之間的關系。 他們說，訣竅在于將大量的基因表達數據轉換成更像圖像的東西。善于分析視覺圖像的卷積神經網絡（CNN）方案隨后可以推斷出哪些基因正在相互作用。 （圖片
t-DEG（轉錄組差異表達基因深度分析）
?本公司采用自主研發與成熟開源軟件相結合的方式構建了專業高效的生物信息分析流程，對您獲得的海量RNA-seq序列的質量、特征等重要信息進行圖形可視化；對兩個以上生物學樣本之間的差異表達基因進行可信分析；對差異表達所揭示出的重要科學問題進行中肯分析；讓您快速“發現”所關注生物學問題，醫學問題和農業問題
深度學習算法“解密”腦活動
英國《自然·醫學》雜志9月25日在線發表的一項研究，報告了一種可以分析四肢癱瘓患者大腦活動的深度學習算法。該算法已被用于向患者的前臂肌肉傳遞電刺激，從而恢復癱瘓肢體的功能性運動。 慢性癱瘓患者的生活質量可以通過腦機接口加以改善。腦機接口可以將控制運動的中樞神經系統回路和輔助設備（例如計算機光標
AI偵探敲碎深度學習黑箱
研究人員創建了能填補照片空白的神經網絡，以鑒別人工智能瑕疵。 Jason Yosinski坐在美國加州舊金山的一個小型玻璃辦公室內，陷入了對人工智能的沉思。作為優步公司的研究科學家，Yosinski正為在筆記本電腦上運行的人工智能（AI）進行“腦外科手術”。 很多AI將改變人類現代生活，例如
深度學習協助預測厄爾尼諾 |《自然》論文
《自然》發表的一篇論文Deep learning for multi-year ENSO forecasts報道了一種可以提前一年半預測厄爾尼諾事件的深度學習方法，克服了該領域內長期存在的一項挑戰。用來預測厄爾尼諾現象的CNN預測系統來源: Ham et al. 厄爾尼諾事件發生于太平洋東部和
TPU將成深度學習的未來？（二）
能夠進行數據推理的第二代TPU第一代的TPU只能用于深度學習的第一階段，而新版則能讓神經網絡對數據做出推論。谷歌大腦研究團隊主管Jeff Dean表示：“我預計我們將更多的使用這些TPU來進行人工智能培訓，讓我們的實驗周期變得更加快速。”“在設計第一代TPU產品的時候，我們已經建立了一個相對
深度學習算法準確追蹤動物運動
根據英國《自然·神經科學》雜志8月21日在線發表的一項研究，美國哈佛大學團隊運用一種新型深度學習算法，成功追蹤動物運動及行為，其準確度可達到人工水平，而且無需采用追蹤標記物或進行費時的手動分析。專家認為，這一成果打開了海量的數據來源之門。 準確追蹤行為發生期間的身體運動部位是運動科學的一項重要
TPU將成深度學習的未來？（一）
在Google I/O 2016的主題演講進入尾聲時，谷歌的CEO皮采提到了一項他們這段時間在AI和機器學習上取得的成果，一款叫做Tensor Processing Unit（張量處理單元）的處理器，簡稱TPU。在這個月看來，第一代的TPU處理器已經過時。在昨天凌晨舉行的谷歌I/O 2017