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  • 蛋白質化學交聯結合質譜鑒定技術取得新進展

    3月8日,國際著名期刊《eLife》在線發表了北京協和醫學院、北京生命科學研究所(NIBS)、北京大學和清華大學等處的一項最新成果,題為 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and comparing protein conformational states”。在這項研究中,研究人員開發了一種賴氨酸靶向交聯劑,以改進創新性的技術——蛋白質化學交聯結合質譜鑒定技術(chemical cross-linking of proteins coupled with mass spectrometry analysis,CXMS)。 NIBS的董夢秋和雷曉光兩位研 究員是本文共同通訊作者。董夢秋研究員早年畢業于四川大學,1995年碩士畢業于中科院上海生化所,2001年博士畢業于耶魯大學,曾經在美國加州大學圣 地亞哥......閱讀全文

    董夢秋:破譯衰老密碼

       辦公桌上、窗臺上,擺滿了綠植,還有一個精致的小魚缸,四平方米左右的辦公室干凈溫馨。在見識前幾位PI簡陋的辦公室后,這里的風景讓人眼前一亮。“哈哈,肯定是黃牛說的,他老說我這是閨房。”董夢秋的一串爽朗笑聲瞬間讓我輕松許多。   受“女生不太擅長理科”這種根深蒂固觀點的影響,我向來對很牛的女科研人

    董夢秋:化學交聯質譜讓結構生物學研究如虎添翼

      在蛋白質組學分析方法中,質譜獲得的是多肽序列結構的信息;那么用質譜是否可研究大分子蛋白的結構信息?近幾年來,董夢秋實驗室在中國做出了多項先驅性工作,主要集中在化學交聯質譜領域。在用單顆粒冷凍電鏡技術研究結構生物學屢創佳績的當下,很多研究者都把樣品一分為二,一份做冷凍電鏡,一份做交聯質譜。那么交聯

    質譜界重磅:繼Nature子刊后董夢秋團隊又發Nature

      交聯質譜技術(英文全稱Chemical cross-linking of proteins coupled with mass spectrometry, 簡稱CXMS或XL-MS);CXMS利用化學交聯劑將蛋白質或蛋白質復合體中空間距離足夠接近的兩個氨基酸通過共價鍵連接起來,酶切成肽段后用質譜

    -NIBS董夢秋研究組-解析衰老機制

      北京生命科學研究所董夢秋研究組致力于衰老過程及其調控機制等方面的研究(專訪董夢秋:學科交融,思想交融的結晶),近期其研究組與其他研究組合作接連發表文章,分別解析了秀麗線蟲衰老有關的兩個蛋白:PUD-1 和 PUD-2的生物學功能,以及鈣離子/鈣調素依賴性蛋白激酶II(CAMKII)和蛋白磷酸

    董夢秋、雷曉光eLife發表重要成果

      3月8日,國際著名期刊《eLife》在線發表了北京協和醫學院、北京生命科學研究所(NIBS)、北京大學和清華大學等處的一項最新成果,題為“Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and

    NIBS董夢秋組發表Nature子刊文章

      2012年7月8日,北京生命科學研究所董夢秋實驗室與中科院計算技術研究所賀思敏教授領導的pFind研究團隊合作在《Nautre Methods》在線發表題為“Identification of Cross-linked Peptides from Complex Samples”的文章。

    董夢秋、賀思敏Nature-Methods發表重要成果

      蛋白交聯是一種特殊的翻譯后修飾,在所有生命中起到了基礎性的作用,包括建立細胞外基質、調控蛋白在細胞內外的功能或半衰期等。內源蛋白質交聯有很多種形式,從相當普遍的二硫鍵或異肽鍵,到膠原和彈力蛋白中的特殊連接。  二硫鍵是許多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生長因子和細胞表面受體。但分析二硫鍵一直

    董夢秋:Observing-Protein-Unfolding-Using-Crosslinker-by-LCMS/MS

      分析測試百科網訊 2020年9月15日,2020年中國質譜學會質譜網絡研討會(2020CMSS)進行到第二天,由北京生命科學研究所董夢秋研究員、中國科學院生態環境研究中心汪海林研究員、同濟大學田志新教授、中國醫學科學院藥物研究所張金蘭研究員;吉林大學藥物代謝研究中心顧景凱教授、軍事醫

    董夢秋發現線粒體的“超氧炫”頻率可以預測線蟲的壽命

      2014年2月12日,北京生命科學研究所董夢秋實驗室與北大分子醫學研究所程和平實驗室在《自然》雜志在線發表題為“Mitoflash frequency in early adulthood predicts lifespan in Caenorhabditis elegans”的文章,報

    蛋白質化學交聯結合質譜鑒定技術取得新進展

      3月8日,國際著名期刊《eLife》在線發表了北京協和醫學院、北京生命科學研究所(NIBS)、北京大學和清華大學等處的一項最新成果,題為 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks an

    享受“慢科研”——訪北京生命科學研究所杜立林、董夢秋夫婦

      城市西北角,北京生命科學研究所(NIBS)。在這里,一對科研伉儷共同工作,他們是妻子董夢秋和丈夫杜立林。2007年,他們雙雙從海外歸來,在這里分別建立起自己的實驗室,既是同事,又是夫妻。他們如何相識、相戀、相伴,攜手從事生命科學研究?從研究生到獨立研究員,一路走來,又有多少故事?他們又有怎樣的獨

    董夢秋等鈣離子/鈣調素依賴性蛋白激酶II調控機制獲進展

      2013年6月25日,北京生命科學研究董夢秋實驗室在《eLIFE》雜志發表題為“CAMKII and Calcineurin regulate the lifespan of Caenorhabditis elegans through the FOXO transcription fact

    蛋白質質譜鑒定技術概述及常見問題

    蛋白質(Protein)是生物體中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物細胞,作為生命的物質基礎之一,蛋白質在催化生命體內各種反應進行、調節代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用,因此蛋白質也是生命科學中極為重要的研究對象。現代研究結果發現越來越多的多肽同蛋白質一樣

    雷曉光課題組在發展化學交聯質譜技術領域取得最新進展

      化學交聯結合質譜技術 (chemical cross-linking coupled with mass spectrometry, CXMS) 是近年來迅猛發展的一種檢測蛋白質結構和蛋白質相互作用的方法。隨著質譜儀器以及交聯數據搜索軟件的發展,CXMS技術已經獲得了長足的進步,但在該技術中能夠

    如何判定蛋白質的質譜鑒定結果的差異

    1 單個蛋白鑒定1. 用于鑒定純化的單個蛋白的溶液或粉末,或經過SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的單個條帶或二維電泳的單個點。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分離多肽,離子化的多肽進入質譜,母離子檢

    蛋白質凝膠電泳后或者質譜后怎么鑒定

    看你的目的.如果你只是檢測目標蛋白大小的話,加上蛋白質marker,考染觀察條帶大小即可.你要是想知道蛋白質的氨基酸序列的話就去打質譜.話說蛋白質的質譜就是序列分析.

    如何判定蛋白質的質譜鑒定結果的差異

    1 單個蛋白鑒定1. 用于鑒定純化的單個蛋白的溶液或粉末,或經過SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的單個條帶或二維電泳的單個點。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分離多肽,離子化的多肽進入質譜,母離子檢

    質譜鑒定,常見疑問解答

    問題1、一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級?答:一級質譜鑒定的方式主要為胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定;二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF的

    暨大研發另類質譜鑒定算法,大幅提高蛋白質組鑒定能力

      暨南大學的研究人員利用翻譯組測序(RNC-seq)數據作為穩態細胞內蛋白質的“標準答案”,并另辟蹊徑,提出了蛋白水平上的一種簡單有效的多算法結果整合策略,不用做額外的實驗,零成本輕松提高蛋白質組鑒定數量,同時有效降低假陽性率。  鳥槍法質譜(shotgun mass spectrometry)是

    CASMS分論壇:相互作用組學和結構蛋白質組學前沿

    ? 分析測試百科網訊 美國東部時間2021年8月9日-13日,首屆美國華人質譜學會(CASMS)學術研討會暨展覽會在Gather.Town隆重舉行。8月11日的“Frontiers in Interactomics and Structural Proteomics” (相互作用組學和結構蛋白質組學

    暨大另類質譜鑒定算法策略大幅提高蛋白質組鑒定能力

      鳥槍法質譜(shotgun mass spectrometry)是蛋白質組研究的標準研究方法。從質譜譜圖中鑒定蛋白質需要依賴搜庫算法,現有許多算法被開發出來,常見的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P

    蛋白質質譜測序

    蛋白質譜一般來講是用來對某個蛋白質進行鑒定的方法而蛋白質測序實際上就是檢測蛋白質的多肽鏈數目,不一定要用到質譜技術簡單說,蛋白質測序的方法有很多,一般是在構建完成后,通過測序來對比之前的預測的序列是否正確。而質譜檢測一般是用在蛋白質表達純化完成后,用來鑒定是否是最初設計的那個蛋白。

    利用納升級液相色譜-串聯質譜進行蛋白質鑒定實驗

    實驗材料:修飾胰蛋白酶試劑、試劑盒:消化緩沖液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? 萃取液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

    利用納升級液相色譜-串聯質譜進行蛋白質鑒定實驗

    實驗材料修飾胰蛋白酶試劑、試劑盒消化緩沖液萃取液清洗液脫色液儀器、耗材多通道移液槍Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管實驗步驟3.1 膠內蛋白的水解和多肽的提取(一天的實驗方案)對于從 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 電泳(經考馬斯亮藍 G-250

    利用納升級液相色譜--串聯質譜進行蛋白質鑒定實驗

    實驗材料 修飾胰蛋白酶試劑、試劑盒 消化緩沖液萃取液清洗液脫色液儀器、耗材 多通道移液槍Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管實驗步驟 3.1 膠內蛋白的水解和多肽的提取(一天的實驗方案)對于從 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 電泳(經考馬斯亮藍

    2014年度北京質譜年會大會報告

      2014年度北京質譜年會于2014年3月21~22日在北京拉斐特城堡酒店隆重開幕。本次質譜年會由北京理化分析測試技術學會北京質譜分會主辦,國家大型科學儀器中心北京質譜中心協辦。來自各大科研機構、院校、廠商的科研工作者們近400人參加并聆聽了年會開

    2020CMSS精彩繼續,質譜揭開生命組學與藥代的神秘面紗

      分析測試百科網訊 2020年9月15日,2020年中國質譜學會質譜網絡研討會(2020CMSS)進行到第二天,由北京生命科學研究所董夢秋研究員、中國科學院生態環境研究中心汪海林研究員、同濟大學田志新教授、中國醫學科學院藥物研究所張金蘭研究員;吉林大學藥物代謝研究中心顧景凱教授、軍事醫

    蛋白鑒定方法之質譜相關技術

      質譜已成為連接蛋白質與基因的重要技術,開啟了大規模自動化的蛋白質鑒定之門。 用來分析蛋白質或多肽的質譜有兩個主要的部分,1)樣品入機的離子源,2)測量被介入離子的分子量的裝置。 首先是基質輔助激光解吸附電離飛行時間質譜(MALDI-TOF)為一脈沖式的離子化技術。 它從固相標本中產生離子,并在飛

    質譜鑒定微生物的原理

      在應用MALDI-TOF MS時,通常將微生物樣本與一種飽和的低分子量無機化合物溶液(稱為基質)進行混合加在靶板上,待干后樣本與基質共結晶后形成了以基質包裹構架的樣本固體沉淀。樣本基質結晶體經激光輻射,基質從激光中吸收能量使樣品吸附,基質與樣品之間發生電荷轉移使得樣品分子電離,離子在加速電場下獲

    田志新:位點和結構特異性定量N糖蛋白組學研究進展

      分析測試百科網訊 2020年9月15日,2020年中國質譜學會質譜網絡研討會(2020CMSS)進行到第二天,由北京生命科學研究所董夢秋研究員、中國科學院生態環境研究中心汪海林研究員、同濟大學田志新教授、中國醫學科學院藥物研究所張金蘭研究員;吉林大學藥物代謝研究中心顧景凱教授、軍事醫學科學院放射

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