生化與細胞所揭示調控起始性DNA甲基化發生的新機制
最近一期的《細胞研究》(Cell Research)以封面文章的形式發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所徐國良研究組在研究起始性DNA甲基化發生機制方面的新進展(Cell Res. 21: 1172-1181, 2011)。同期雜志就此新進展發表了評論性文章(Cell Res. 21: 1155-1156, 2011)。 DNA甲基化是一種非常重要的表觀遺傳標記,在哺乳動物的多種生理活動,包括基因印跡、X染色體失活、逆轉座子等寄生DNA的沉默、基因組穩定性的維持及組織特異性基因的表達調控等方面發揮著至關重要的作用。DNA甲基化譜式是在胚胎發育過程中逐步建立起來的,不同組織類型的細胞具有不同的甲基化譜式。DNA甲基化譜式的紊亂導致了多種神經退行性疾病以及癌癥的發生。那么哺乳動物細胞是如何精確調控DNA甲基譜式建立的呢?這是表觀遺傳學領域的一個基本問題,也是熱點問題。 在徐國良研究組的這項研究中,......閱讀全文
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術,如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等,已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化,它是在擴增片段長度多態性技術的基
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技
揭示DNA甲基化與基因沉默的關系
DNA 甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關,但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日,加州大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen團隊在Science 在線發表題為“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
DNA分析系統:基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的 調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中,基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后,這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化,把健康人的大便
線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日,吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史,同時也使以DN
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
DNA甲基化預測
實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測,并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有:GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究
Pyrosequencing DNA分析系統:基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中,基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后,這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化,把健康人的大便與結腸癌患
什么是DNA甲基化?
DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
DNA甲基化技術介紹
DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用,是目前新的研究熱點之一。介紹DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DN