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  • Nature:7萬個單細胞測序,繪制人類妊娠早期的胎盤圖譜

    11月15日,來自英國劍橋桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)的研究人員在Nature上以長文形式發表了題為Single-cell reconstruction of the early maternal–fetal interface in humans的研究成果,利用妊娠早期胎盤的約7萬個細胞進行單細胞測序并繪制了圖譜,為理解人類妊娠早期的細胞組織和細胞通訊帶來了新見解。這項研究還探索了對妊娠成功至關重要的維持生理環境穩定的機制。 當前,人類細胞圖譜(Human Cell Atlas)等國際研究項目正在嘗試鑒定參與發育、健康和疾病的所有細胞類型。在人類妊娠早期,胎兒胎盤植入子宮內膜(蛻膜,decidual)、胎盤滋養細胞與母體細胞混合。這種關系對于妊娠成功至關重要,但是妊娠早期蛻膜內的細胞互作仍不清楚。 在這項研究中,研究人員描述了人類妊娠早期(6-14周)胎盤的約7萬個細胞的轉錄組以及與......閱讀全文

    Nature:7萬個單細胞測序,繪制人類妊娠早期的胎盤圖譜

      11月15日,來自英國劍橋桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)的研究人員在Nature上以長文形式發表了題為Single-cell reconstruction of the early maternal–fetal interface in humans的研究成果,

    Nature重磅!利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜

      肝臟是人體最大、功能最多的器官之一,在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是,肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%,就能夠完全再生的內臟器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一,也是導致死亡的主要原因。  盡管肝臟對人類健康極為重要,但健康

    Nature重磅!利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜

      肝臟是人體最大、功能最多的器官之一,在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是,肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%,就能夠完全再生的內臟器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一,也是導致死亡的主要原因。  盡管肝臟對人類健康極為重要,但健康

    Nature:單細胞測序(上)

      Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年,冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織,一并將這些DNA進行測序,生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序

    Nature:單細胞測序(下)

      隨著技術的飛速發展,成本大大降低,使得基因組測序成為常規技術。然而,大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序,它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。   該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序,研究小

    《細胞》:單細胞測序助力基因重組圖譜

      來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了來自一個成人男子91個

    PNAS:單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜

      斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》(PNAS)上發表文章,介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。  研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法,他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型,并確定神經元的亞型。他們還觀察了

    Nature單細胞測序繪制首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜

      哺乳動物的造血與免疫系統發育是在胚胎發育過程中由多個組織以復雜的協同作用所驅動的【1】。盡管研究界對于人體中這一過程所涉及的功能主體和時間序列都有了較為準確的認識,例如造血干細胞是先從受孕后2至3周的胚胎外卵黃囊(yolk sac)中,以及從3至4周的胚胎主動脈-性腺-中腎區域(aorta-go

    Nature-methods發布單細胞測序新技術

      來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術,可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。   資深作者Ri

    Nature新技術:CRISPR+單細胞測序=?

    CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因(pooled CRISPR screens),可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因,同時編輯許多細胞,然后實驗篩選編輯細胞,gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物

    Nature子刊:癌癥單細胞測序新技術

      只有通過近距離觀看修拉(Seurat)的繪畫,你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點,從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似,生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜,然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。   發布在7月22日《自然生物技術》(

    Cell:單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜

      最新發布在Cell上的一項研究表明,單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群,并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術

    Nature-immunoloy:新冠肺炎患者的單細胞免疫圖譜

      研究人員應用單細胞測序技術全面揭示了輕中型、重型新冠肺炎患者及其從發病期到康復期機體整體免疫學變化特征、機制和規律。   今年年初,新冠肺炎疫情在世界范圍內快速暴發。根據世界衛生組織最新統計數據顯示,截止到2020年8月11日,新冠肺炎在全球已導致累計近2000萬確診病例和超過73萬死亡病例,平

    著名學者Nature綜述:單細胞測序之現狀

      每個細胞都是獨一無二的,但我們的研究對象往往是細胞群體,忽略了這些細胞之間的異質性。正因如此,單細胞基因組學研究受到了越來越多的關注。  單細胞基因組學領域近年來發展得非常迅速,為人們揭示了復雜生物學體系的許多重要線索,包括微生物群落的生態多樣性和人類癌癥的基因組。一月二十五日Nature Re

    -著名學者Nature綜述:單細胞測序之現狀

      每個細胞都是獨一無二的,但我們的研究對象往往是細胞群體,忽略了這些細胞之間的異質性。正因如此,單細胞基因組學研究受到了越來越多的關注。  單細胞基因組學領域近年來發展得非常迅速,為人們揭示了復雜生物學體系的許多重要線索,包括微生物群落的生態多樣性和人類癌癥的基因組。一月二十五日Nature Re

    基于單細胞測序繪制腫瘤微環境相關細胞代謝圖譜

      腫瘤作為一個異常復雜的“生態系統”,不同類型的腫瘤細胞與非腫瘤細胞共同構成了腫瘤微環境。腫瘤存在腫瘤間異質性和腫瘤內異質性,可以說腫瘤內每種細胞都存在于不同的微環境中,每種細胞都可能有不同的代謝狀態。由于異質性,腫瘤細胞會通過改變自身代謝模式(即“代謝重編程”)來適應不同的微環境,以滿足其對能量

    單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜

      2019年10月8日,四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy

    Nature:浙大領銜在構建人類單細胞圖譜方面取進展

      在一項新的研究中,來自中國浙江大學等研究機構的研究人員朝構建全面的人類單細胞圖譜邁出了一大步。相關研究結果于2020年3月25日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在這

    單細胞測序揭示肺癌腫瘤免疫細胞亞型的細胞圖譜

      最近免疫療法的出現標志著多種癌癥的研究和護理發生了巨大變化,給世界各地的患者和家庭帶來了新的希望。對于那些對治療有反應的人來說,結果可能是激動人心的。激活病人的癌癥免疫系統可以殺死或縮小腫瘤,在某些情況下,會導致完全緩解。  盡管取得了重大進展,但只有少數人從免疫治療中獲益,原因尚不清楚。  免

    單細胞測序新突破:-北大繪制出人類胚胎基因調控圖譜

      北京大學第三醫院的湯富酬研究員等采用先進的單細胞RNA測序技術,繪制出人類植入前胚胎和胚胎干細胞的轉錄組圖譜,有望在干細胞領域改善人類輔助生殖技術,以及預測潛在遺傳病產生的健康影響。研究成果發表在8月11日《自然結構與分子生物學》(Nature Structural & Molecular

    華人學者Nature-Methods發布單細胞測序重要工具

      新一代測序技術(NGS)大大增進了我們對疾病(比如癌癥)的理解。不過NGS的研究對象是細胞群體,會掩蓋細胞之間的異質性。正因如此,單細胞測序(SCS)技術受到了越來越多的關注。  德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員開發了首個用于單細胞DNA測序的突變檢出程序,Monovar。這一重要成果發

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      新一代測序技術(NGS)大大增進了我們對疾病(比如癌癥)的理解。不過NGS的研究對象是細胞群體,會掩蓋細胞之間的異質性。正因如此,單細胞測序(SCS)技術受到了越來越多的關注。  德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員開發了首個用于單細胞DNA測序的突變檢出程序,Monovar。這一重要成果發

    Nature,Science兩大頂級雜志聚焦單細胞測序

      去年Nature Methods盤點值得期待的技術中,就有單細胞測序,今年Science盤點更是將這一技術列為2013科研熱點的榜首。近期兩個研究組分別在Science,Nature Methods雜志上公布了單細胞測序技術的最新進展,分別介紹了這種“Solitary Sequencin

    Nature-Methods-|-朝思暮想:單細胞蛋白質組測序之夢

      近期,Nature Methods 雜志技術編輯Vivien Marx發表文章 A dream of single-cell proteomics,探討了單細胞蛋白組學的發展,提出了該技術有可能會面對的問題和潛在解決方案。單細胞蛋白質組測序的夢想并不遙遠(Credit: S. Larochell

    Nature:如何利用單細胞mRNA測序發現罕見細胞類型?

      近日,來自荷蘭的科學家在著名國際學術期刊nature上發表了一項最新研究進展,他們利用一種新的計算方法結合轉錄組測序發現了小腸中一些罕見的細胞類型,這對于深入了解器官的細胞組成,探究健康和疾病狀態下的組織生物學具有重要意義。  理解一個器官的發育和功能需要對組成該器官的所有細胞類型的特性有一個清

    《Nature-Methods》更便宜、更全面的單細胞RNA測序技術

      微流控技術革新促進了單細胞RNA測序發展,它為單細胞基因組學提供了一種低成本、高通量的方法。然而,這種方法捕獲完整RNA轉錄信息的能力有限。(圖片來源:Cornell)  康奈爾大學生物醫學工程學院助理教授Iwijn De Vlaminck課題組開發了一款更健全的、低成本的方法解決了這個問題,不

    單細胞測序繪制首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜

      2019年10月10日,來自英國Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等機構的科學家在Nature上以長文形式發表了題為“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究,首次報道了由胎肝驅動的人胚胎

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      2019年10月10日,來自英國Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等機構的科學家在Nature上以長文形式發表了題為“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究,首次報道了由胎肝驅動的人胚胎

    北京大學Nature子刊單細胞RNA測序新成果

      來自北京大學第三醫院、教育部輔助生殖重點實驗室的研究人員,采用先進的單細胞RNA測序技術繪制出了人類植入前胚胎和胚胎干細胞的轉錄組全景圖,這一重要的研究成果發表在8月11日的《自然結構與分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)雜志上。   

    Nature子刊:突破性測序技術繪制甲基化圖譜

      通過一種新的DNA測序技術,研究人員首次繪制了致病菌全基因組甲基化標記圖譜。通過比較相關菌株之間的甲基化模式,他們發現了稱作噬菌體的病毒感染細菌顯著改變宿主的一種方式。   布萊根婦女醫院(Brigham and Women"s Hospital)、霍華德休斯醫學研究所研究員Matthew K

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