Nature子刊:長讀長DNA分析會導致錯誤
研究表明,讀取長串DNA的先進技術會產生有缺陷的數據,這些數據可能影響基因研究。 新方法可以讀取很長的“遺傳密碼”,準確率高達99.8%,然而,如果樣本是超過30億堿基的基因組,這相當于數百萬個錯誤。 這些錯誤可能錯誤地表明一個人的基因差異會增加某種疾病的風險。研究員說,這些技術產生的數據應該被謹慎解釋,因為它可能會給人類和動物的遺傳信息解析帶來問題。 以前的基因測序技術重點是讀取短串DNA,然后將這些序列拼湊在一起,耗時耗力。這種方法對讀取單基因很有用,但不適用于整個生命體研究。 愛丁堡大學的專家們研究了最近發表的三項人類基因組序列研究(都采用的長讀長技術)。他們發現,即使使用了修正軟件,這些數據仍然包含數千個錯誤。研究小組認為,如果將這些技術用于臨床研究或患者診斷,可能會產生重大影響。 文章發表在《Nature Biotechnology》雜志,愛丁堡大學Roslin研究所的Mick Watson教授說:“長讀......閱讀全文
Nature:用于蛋白質分析的單分子DNA技術
George Church 及同事開發出用于并行蛋白相互作用分析、借助用于蛋白功能分析的單分子DNA方法的一個“單分子相互作用測序”(SMI-seq)技術。 SMI-seq的工作原理是,通過核糖體顯示或酶結合將蛋白耦合到DNA識別符或“條碼”上。 這些條碼化的蛋白然后在水溶液中被一起分析,并
Nature解析癌癥與“垃圾”DNA
癌癥是由多次遺傳改變(或突變)而引起的一類疾病。我們從父母那里繼承了或強或弱的形成某些癌癥類型的遺傳易感性;此外,在我們的一生中我們的細胞內也會不斷地累積新的突變。盡管已開展了很長一段時間的癌癥遺傳起源研究,直到現在研究人員仍無法估量基因組一些非編碼區域的作用。 來自日內瓦大學(UNIGE)的
Nature:被丟失的“垃圾”DNA
在人類基因組中,基因只占據2%的序列,其余的均是由稱作非編碼DNA的遺傳物質構成。科學家們多年來一直試圖解開這一謎團:為何基因組中會存在如此龐大數量的這種遺傳物質? 現在,一項新研究帶來了出乎意料的新發現:絕大多數的非編碼DNA也許確實并非復雜生命所需。這一研究發表在 5月12日的《自然》(N
Nature子刊:長讀長DNA分析會導致錯誤
研究表明,讀取長串DNA的先進技術會產生有缺陷的數據,這些數據可能影響基因研究。 新方法可以讀取很長的“遺傳密碼”,準確率高達99.8%,然而,如果樣本是超過30億堿基的基因組,這相當于數百萬個錯誤。 這些錯誤可能錯誤地表明一個人的基因差異會增加某種疾病的風險。研究員說,這些技術產生的數據應
Nature子刊:DNA“籠子”的妙用
來自麥吉爾大學的研究人員在最新一項研究中指出,DNA鏈制成的納米結構可以用于封裝小分子藥物,并在特定的刺激下釋放藥物,這一研究成果公布在9月1日的Nature Chemistry雜志上。 這項研究將有助于生物納米結構在藥物遞送方面的應用,也將為設計以DNA為基礎的納米材料開辟新的道路。
潘學文博士Nature解析DNA修復
生物通報道:來自貝勒醫學院的研究人員指出了一種核小體重構因子:Fun30在DNA雙鏈端粒末端切除過程中扮演的重要角色,為進一步解析DNA雙鏈斷裂修復過程提供了新思路,相關成果公布在Nature雜志上。 文章的通訊作者之一是華裔科學家潘學文博士(Xuewen Pan,生物通音譯),其早年
Nature:DNA復制過程的關鍵奧秘
最近,沙特國王科技大學(King Abdullah University of Science and Technology,KAUST)的研究人員,揭開了DNA復制過程中的一個關鍵奧秘。相關研究結果發表在最近的國際頂級學術刊物《Nature》。 在一個細菌分裂之前,它必須通過一個稱為DNA復
Nature:DNA講述歷史 基因中發掘細節
英德研究人員在14日出版的美國《科學》雜志上報告說,絲綢之路的貿易、成吉思汗的西征乃至歐洲的殖民擴張等重大歷史事件的影響,都反映在現代人類的基因中。 研究人員利用世界各地95個民族近1500人的DNA(脫氧核糖核酸)數據,繪制出一幅過去4000年中的人類基因交流地圖,為人類通過基因分析的方
Nature子刊揭示DNA剪刀的秘密
科學家們通過低溫冰凍定格了差不多兩百個生物學結構,首次為人們展示了DNA雙鏈斷裂的整個過程。 西班牙國家癌癥研究所(CNIO)的研究團隊開發了一種特別的生物學晶體制造技術,首次觀察到了DNA雙鏈斷裂的全過程。他們通過計算機模擬,將這個微秒級的過程展現在人們眼前。這一成果發表在十二月八日的Nat
Nature Methods發布首個DNA精確模擬平臺
模擬可以將實驗手段無法直接觀察到的活動呈現在人們眼前。科學家們日前開發了首個能夠精確模擬DNA的平臺,有助于研究DNA的結構改變,以及DNA與蛋白和藥物的互作。 分子動力學可以解析發生在不同時間尺度上的過程(從皮秒到分鐘),適用于不同規模的分析體系(從納米到米)。這一技術能用來模擬DNA的各種