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    第二章:4分鐘教你學會多重PCR引物設計

    多元 PCR (多重PCR,Multiplex PCR,MPCR) 是指在一個 PCR 反應中使用一個模板和幾對引物同時擴增多個目的片段的 PCR 反應。這項技術非常有用,他不僅可以提高 PCR 的產率還能提高 DNA 樣品的利用率。另一種形式的 MPCR 是組合 PCR, 組合 PCR 是在同一 PCR 反應中使用幾個不同的模板和幾對引物。多元 PCR 和組合 PCR 往往被當作同義詞使用。設計策略MPCR 要求所有的引物對在同一條件下擴增其各自的特異序列。大多數多元 PCR 反應 局限于擴增 5~10 個目的片段,原因之一是反應中,每另加入一對引物會導致一定程度的靈活性的丟失。引物數量的增加也使引物二聚體和非特異擴增出現的概率增加。因此,進行多元 PCR 要求周密計劃,且需多次嘗試,使反應條件優化。理論上,一個多元反應中,所有引物擴增其特異序列的效率應該是一樣的,但通常是很難預測一對引物的效率。在相似條件下,退火溫度幾乎相同......閱讀全文

    Primer 引物設計原則

    概念   引物,是一小段單鏈DNA或RNA,作為DNA復制的起始點,在核酸合成反應時,作為每個多核苷酸鏈進行延伸的出發點而起作用的多核苷酸鏈,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯鏈形式進行合成,因此引物的3′-OH,必須是游離的。類型  存在有自然中生物的DNA復制引物(RNA引物)和聚合酶鏈式反應(

    RT-PCR實驗方法大全

    RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。 3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單

    PCR引物設計及軟件使用技巧

    PCR引物設計及軟件使用技巧張新宇,朱有康,高燕寧(中國協和醫科大學中國醫學科學院腫瘤研究所,北京100021)摘要:本文旨在介紹使用軟件設計PCR引物的技巧。在PCR引物設計原則的基礎上,詳細介紹了兩種常用引物設計軟件的基本使用方法,并對其各自的優缺點進行了比較。一般性引物自動搜索可采用“Prem

    整理的PCR資料.供大家分享.2

    引物設計簡介1.寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設計也極大的影響擴增產量:若使用

    pcr實用技巧-2

    1.簡介寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設計也極大的影響擴增產量:若使用設計粗糙

    關于PCR你了解多少?

      實驗原理  PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,它類似于生物體內DNA的復制。在生物體內DNA復制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設計的特定序列,實現對特

    PCR技術 PCR技術的應用

    一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合

    RT-PCR實驗方法總結大全

    生物谷: RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。 3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存

    如何做好熒光定量PCR實驗

    熒光定量PCR實驗指南一、基本步驟:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;2、引物、探針的設計;3、引物探針的合成;4、反應體系的配制;5、反應條件的設定;6、反應體系和條件的優化;7、熒光曲線和數據分析;8、標準品的制備;二、技術關鍵:1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比

    寡聚核苷酸引物的選擇

    1.簡介    寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設

    PCR引物設計及評價實驗

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    PCR引物設計及評價實驗

    實驗方法原理聚合梅鏈式反應(polymerase chain reaction)即PCR技術,是一種在體外快速擴增特定基因或DNA 序列的方法,故又稱基因的體外擴增法。PCR技術已成為分子生物學研究中使用最多,最廣泛的手段之一,而引物設計是PCR技術中至關重要的一環,使用不合適的PCR引物容易導致實

    如何設計嵌套 PCR 引物以及注意事項

    嵌套 PCR 又稱巢式 PCR(nested PCR,nPCR),是指以第一次 PCR 產物為模板直接進行第二次 PCR 擴增,以增加 PCR 的靈敏度,第二次 PCR 設計的引物在第一次所用引物對的內部,這種引物被稱為「內部」或 「嵌套」引物。 以第一次 PCR 產物為模板進行第二次 PCR 擴

    PCR實驗技術(三)

    【注意事項】1. PCR引物設計:引物設計可能是PCR擴增成功最關鍵的因素。如引物設計欠佳,可能導致擴增產物不足,甚至擴增失敗,其原因是設計欠佳的引物可導致非特異擴增和/或形成引物二聚體,此又成為PCR反應的競爭性產物,從而進一步抑制PCR產物形成。在引物設計時必須考慮以下幾個因素,其中最

    第三篇 如何設計嵌套 PCR 引物以及注意事項

    嵌套 PCR 又稱巢式 PCR(nested PCR,nPCR),是指以第一次 PCR 產物為模板直接進行第二次 PCR 擴增,以增加 PCR 的靈敏度,第二次 PCR 設計的引物在第一次所用引物對的內部,這種引物被稱為「內部」或 「嵌套」引物。以第一次 PCR 產物為模板進行第二次 PCR 擴增,

    實時熒光Taqman 探針設計的幾個要點

    實驗室很多同學都要做Real time PCR實驗,實驗室的師兄師姐都會有很多寶貴意見,不過也有實驗室前沒有做過的,查找了下資料和大家分享下關于實時熒光 Taqman 探針設計、實時熒光PCR探針的選擇、引物的設計及評價。熒光探針法是用序列特異的熒光標記探針來檢測產物,探針法的出現使得定量

    PCR引物設計及評價

    【實驗目的】1、掌握引物設計的基本要求,并熟悉使用Primer premier5.0軟件進行引物搜索。2、掌握使用軟件oligo6.0對設計的引物進行評價分析。【實驗原理】一、引物設計原則聚合梅鏈式反應(polymerase chain reaction)即PCR技術,是一種在體外快速擴增特定基因或

    PCR實驗技術

                                    PCR實驗技術 PCR(聚合酶鏈式反應) 【原理】&nb

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    【實驗目的】1、掌握引物設計的基本要求,并熟悉使用Primer premier5.0軟件進行引物搜索。2、掌握使用軟件oligo6.0對設計的引物進行評價分析。【實驗原理】一、引物設計原則聚合梅鏈式反應(polymerase chain reaction)即PCR技術,是一種在體外快速擴增特定基因或

    PCR引物設計及評價實驗(二)

    5.  按照搜尋結果顯示,在主窗口中檢查該引物對的二級結構情況,逐條分析,依次篩選。下面進行序列篩選:點擊其中一對引物,如第21#引物,在“Peimer Premier”主窗口,如圖所示:該圖分三部分,最上面是圖示PCR模板及產物位置,中間是所選的上下游引物的一些性質,最下

    PCR引物設計技巧

    自從1985年美國PE-Cetus公司的人類遺傳研究室 Mullis等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(PCP) 以來,PCR已經成為了分子生物學領域最基本也是最重要的技術手段之一 。然而能否找到一對合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地擴增模板DNA序列,無疑決定著PCR的成敗。現在動物遺

    PCR引物設計技巧

    自從1985年美國PE—Cetus公司的人類遺傳研究室 Mullis等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(PCP0 以來,PCR已經成為了分子生物學領域zui基本也是zui重要的技術手段之-[ I。然而能否找到一對合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地擴增模板DNA序列,無疑決定著PCR的成敗。現在動

    PCR引物設計技巧

    自從1985年美國PE—Cetus公司的人類遺傳研究室 Mullis等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(PCP0 以來,PCR已經成為了分子生物學領域最基本也是最重要的技術手段之-[ I。然而能否找到一對合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地擴增模板DNA序列,無疑決定著PCR的成敗。現在動物遺傳育

    第八章:常用引物設計工具大集合

    Oligo 6作為目前最好、最為專業的引物設計軟件,Oligo 的功能很強大,他主要功能有:普通引物對的搜索、測序引物的設計、雜交探針的設計以及評估「引物對」質量的功能。如何使用Oligo6 請參看:「兩分鐘教你學會 Oligo 7」BLASTBLAST(Basic Local Alignment

    操作ABI PCR儀時需要注意的事項有哪些?

    操作ABI PCR儀時需要注意的事項有哪些?  1.PCR引物設計:    引物設計可能是PCR擴增成功最關鍵的因素。如引物設計欠佳,可能導致擴增產物不足,甚至擴增失敗,其原因是設計欠佳的引物可導致非特異擴增和/或形成引物二聚體,此又成為PCR反應的競爭性產物,從而進一步抑制PCR產物形成。    

    PCR Array 簡單實用的檢測基因表達的高通量方法

     簡介:什么是PCR芯片?實時定量PCR是檢測基因表達zui靈敏,zui可靠的方法。通過在試驗過程中,實時監測熒光染料的信號變化,反映樣品中的基因拷貝數。實時定量PCR線性范圍廣(能達到5個數量級),因此可以檢測同一樣品中表達量極低的基因和表達量很高的基因。但是,由于實時定量PCR需要制備

    PCR引物設計知識與技巧分析

    PCR引物設計知識與技巧分析自從1985年Mullis等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈式反應(PCP) 以來,PCR已經成為了分子生物學領域zui基本也是zui重要的技術手段之一。然而能否找到一對合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地擴增模板DNA序列,無疑決定著PCR的成敗。現在動物遺傳育種早已進入

    RT-PCR實驗方法總結大全

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    PCR使用技巧

    基本PCR引物設計參數 引物設計的目的是在兩個目標間取得平衡:擴增特異性和擴增效率。特異性是指發生錯誤引發的頻率。特異性不好或劣等的引物會產生額外無關和不想要的PCR擴增子,在EB染色的瓊脂糖凝膠上可見到;引物效率是指在每一PCR循環中一對引物擴增的產物與理論上成倍增長量的接近程度。&nb

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