腫瘤基因專家致力挖掘單細胞大數據潛能
近年來,隨著測序技術的迅猛發展,單細胞測序技術已逐漸走入人們視野。2013年,單細胞測序技術成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數的基于NGS的基因檢測,都是在大量細胞宏觀水平上,對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術則是在單個細胞的水平上,對其遺傳物質進行檢測,從而從更精細的水平觀察突變如何協同作用來驅動疾病。因而,相較于常規的基因檢測,單細胞測序可以獲得更為龐大的細胞遺傳信息。 但在單細胞測序領域,如何對這些龐大的細胞遺傳信息進行分析仍是一大難題。以免疫細胞T細胞為例,單細胞測序技術可以發現T細胞亞群、不同的T細胞狀態、不同細胞亞群的異質性及其潛在效用。這些細胞信息都需要通過生物信息學工具進行分析、整合,才能充分發揮單細胞測序的優勢,對龐雜的細胞遺傳信息進行更深入的了解。 百奧智匯致力于單細胞測序技術和生物信息技術研究,通過與醫院、科研機構以及制藥公司合作,挖掘單細胞基因組學和生物信息學......閱讀全文
人類胸腺單細胞圖譜助力腫瘤免疫治療
胸腺是T細胞的分化、發育和成熟的場所,是組成免疫系統的重要器官。到目前為止,還不清楚在整個生命過程中,人體胸腺中的早期免疫前體細胞如何發育為T細胞。盡管已通過各種動物模型對胸腺進行了廣泛的研究,但是還未有詳細的人類胸腺細胞圖譜得以報道。 由來自VIB炎癥研究中心(VIB Center for
腫瘤基因專家致力挖掘單細胞大數據潛能
近年來,隨著測序技術的迅猛發展,單細胞測序技術已逐漸走入人們視野。2013年,單細胞測序技術成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數的基于NGS的基因檢測,都是在大量細胞宏觀水平上,對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術則是在單個細胞的水平上,對其遺傳物質進行檢測,從
Science:構建腫瘤浸潤T細胞的泛癌單細胞圖譜
靶向腫瘤特異性T細胞的癌癥免疫療法已使許多癌癥患者受益,但是針對不同類型的癌癥的臨床療效差異很大。腫瘤浸潤T細胞經常進入功能失調狀態,這一現象被廣泛稱為T細胞衰竭(T cell exhaustion),而效應T細胞的抗腫瘤功能受多種因素調節,包括調節性T細胞(Treg細胞)的存在。T細胞的狀態和
基于單細胞測序繪制腫瘤微環境相關細胞代謝圖譜
腫瘤作為一個異常復雜的“生態系統”,不同類型的腫瘤細胞與非腫瘤細胞共同構成了腫瘤微環境。腫瘤存在腫瘤間異質性和腫瘤內異質性,可以說腫瘤內每種細胞都存在于不同的微環境中,每種細胞都可能有不同的代謝狀態。由于異質性,腫瘤細胞會通過改變自身代謝模式(即“代謝重編程”)來適應不同的微環境,以滿足其對能量
單細胞測序揭示肺癌腫瘤免疫細胞亞型的細胞圖譜
最近免疫療法的出現標志著多種癌癥的研究和護理發生了巨大變化,給世界各地的患者和家庭帶來了新的希望。對于那些對治療有反應的人來說,結果可能是激動人心的。激活病人的癌癥免疫系統可以殺死或縮小腫瘤,在某些情況下,會導致完全緩解。 盡管取得了重大進展,但只有少數人從免疫治療中獲益,原因尚不清楚。 免
單細胞分離用于單細胞基因擴增
單細胞分離連接不同管徑大小的毛細玻璃針,可分離捕獲各種非貼壁狀態的單細胞和微粒等,如細菌、酵母、藻類細胞、植物花粉、原生動物單細胞、懸浮細胞、血液細胞、免疫細胞、卵細胞、各種懸液中單細胞及特殊標記的單細胞等。 單細胞分離用于各種類型的細胞分離培養、純化、檢測;獲得單克隆細胞;用于單細胞基因擴增,
單細胞檢測技術在腫瘤研究中的新挑戰和新方向
單細胞轉錄組研究是近期生命科學領域運用最火的組學檢測技術之一,來自麻省總醫院和哈佛醫學院的研究人員在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上討論了單細胞轉錄組測序技術在腫瘤研究中的經驗與未來挑戰。在此,我們對該review中的部分內容進行解讀和分享。
Cell:-中國學者首次發布大規模腫瘤單細胞水平免疫圖譜
2017 年 6 月 15 日,北京大學生命科學學院 BIOPIC 中心、北京未來基因診斷高精尖創新中心、北大 ?-清華生命科學聯合中心張澤民研究組,首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院暨北京大學第九臨床醫學院肝膽胰外科彭吉潤研究組,及美國 AMGEN 公司的歐陽文君研究組在《Cell》雜志發表了題為
cell-張澤民團隊首次發布大規模腫瘤單細胞水平免疫圖譜
2017年6月15日,北京大學生命科學學院 BIOPIC 中心、北京未來基因診斷高精尖創新中心、北大 ?-清華生命科學聯合中心張澤民研究組,首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院暨北京大學第九臨床醫學院肝膽胰外科彭吉潤研究組,及美國 AMGEN 公司的歐陽文君研究組在《Cell》雜志發表了題為“Land
Nature:開啟單細胞病理學新篇章-Hyperion助力臨床腫瘤治療
在臨床上,對腫瘤的分類是癌癥診斷、判斷預后以及治療方案選擇的重要依據。目前這種分類主要是依據腫瘤組織學特征以及少量Marker的表型進行的。近年來,隨著單細胞分析技術的發展,腫瘤患者個體間以及個體內普遍存的異質性被不斷被揭示出來,這些復雜的單細胞表型及空間信息并未反映在組織學分類中。 近日,來
微流控芯片技術的肺癌循環腫瘤細胞檢測及單細胞分析
我國是肺癌高發國家,近十年肺癌的發病率分別占男性和女性惡性腫瘤的第一和第二位,并且發病年齡有下降的趨勢。肺癌的死亡率在惡性腫瘤中始終居于首位,根本原因是肺癌的高轉移能力。因為肺癌具有極強的侵襲性及轉移能力,大多數患者就診時已處于晚期(III期、IV期),失去最佳的治療機會。因此,提高肺癌檢出率、控制
單細胞檢測技術在腫瘤研究中的新挑戰和新方向
單細胞轉錄組研究是近期生命科學領域運用最火的組學檢測技術之一,來自麻省總醫院和哈佛醫學院的研究人員在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上討論了單細胞轉錄組測序技術在腫瘤研究中的經驗與未來挑戰。在此,我們對該review中的部分內容進行解讀和分享。
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s
循環腫瘤細胞捕獲及單細胞分析樣機在大連研制成功
由大連醫科大學牽頭,與中國科學院深圳先進技術研究院等多家單位合作,在國家科技計劃支持下,歷經三年研發,成功構建了具有自主知識產權的循環腫瘤細胞(circulating tumor cell,CTC)捕獲及單細胞分析樣機,顯示出較好的應用前景。 CTC是存在于患者外周血中的各類腫瘤細胞的統稱,對
單細胞檢測技術在腫瘤研究中的新挑戰和新方向(二)
三.殘留病變和復發:利用單核分析(冰凍材料)在許多癌癥類型中,初始治療后通常伴隨著具有增強的侵襲性和抗藥性的復發,突出了殘留病變及其進展和生長對于建立復發性腫瘤的重要性。已有的研究比較了原發性和復發性腫瘤,并揭示耐藥性的各種遺傳原因。未來的研究將擴展這種方法,通過scRNA-seq進行比較,并提供更
單細胞檢測技術在腫瘤研究中的新挑戰和新方向(一)
單細胞轉錄組研究是近期生命科學領域運用最火的組學檢測技術之一,來自麻省總醫院和哈佛醫學院的研究人員在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上討論了單細胞轉錄組測序技術在腫瘤研究中的經驗與未來挑戰。在此,我們對該review中的部分內容進行解讀和分享。作者
《分析化學》:基于拉曼組的腫瘤單細胞藥敏檢測新方法
腫瘤藥敏性檢測方法學是抗癌藥物評價和篩選的前提,也是臨床化療方案設計的基礎。青島能源所單細胞中心開發了基于拉曼組的腫瘤單細胞藥敏檢測新方法D2O-CANST-R,具有快速、低成本、單細胞器精度、識別耐藥細胞、體現抗癌機制、可對接單細胞分選和測序等特色,為癌細胞-藥物互作研究、抗癌藥物篩選等提供
CloneSelect?單細胞分離系統?OR?傳統單細胞克隆方法
CloneSelect??Single-Cell?Printer??f.sight??(?f.sight?)被開發用于滿足這些需求,?它可以柔和地接種單個細胞至微孔,同時記錄整個細胞接種過程,提供單克隆性的圖像證據以及優異的接種后細胞生長用于細胞株開發在這個研究中,我們開展了六組實驗,用無血清培養基
分選率95.2%—循環腫瘤細胞捕獲及單細胞分析樣機研制成功
由大連醫科大學牽頭,與中國科學院深圳先進技術研究院等多家單位合作,在國家科技計劃支持下,歷經三年研發,成功構建了具有自主知識產權的循環腫瘤細胞(circulating tumor cell,CTC)捕獲及單細胞分析樣機,顯示出較好的應用前景。 CTC是存在于患者外周血中的各類腫瘤細胞的統稱,
Namocell單細胞分離儀應用介紹——藻類單細胞分離
Namocell單細胞分離儀最新應用:隨著人們對環境研究的不斷深入,研究人員逐漸將目光轉向藻類的單細胞層面:有些需要對藻類進行單細胞級別的分析(如藻類單細胞測序等),也有需要對單細胞藻類進行培養。這樣就面臨一個棘手的問題,那就是如何獲取藻類的單個細胞。通常實驗室里的方式,是在顯微鏡下用毛細管吸取。這
單細胞凝膠電泳法檢測單細胞DNA損傷
單細胞凝膠電泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又稱慧星試驗(comet assay)是一項較新的電泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于檢驗DNA單鏈斷裂以來,經過不斷的改進,已成為一種快速、靈敏、簡便的檢測DNA損傷的方法,廣泛地應用
單細胞是什么
單細胞既可以指單細胞生物,比如細菌等,也可以指從多細胞生命體分離的單個細胞,比如實驗室培養的人體細胞等。此外,受精卵也是單細胞,屬于可以發育成完整生命體的全能干細胞。
單細胞分離技術
單細胞測序日趨火爆的原因很大程度上得益于單細胞分離技術的不斷完善。這一講,我們將跟大家一起回顧傳統的單細胞分離技術,并重點介紹單細胞分離技術的新寵微孔芯片技術及微流控技術。圖1為目前常見單細胞分離設備。圖1:目前常見單細胞分離設備傳統單細胞分離技術相信許多實驗人員,都見過下面我們要介紹的傳統的單細胞
什么是單細胞
單細胞生物 生物可以根據構成的細胞數目分為單細胞生物(Protozoa)和多細胞生物(Metazoa)。單細胞生物只由單個細胞組成,個體微小,用肉眼很難看的見,大多數單細胞生物生活在水域環境中,有些寄生在我們身上。單細胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在適宜的環境下出芽繁殖)單細胞生物包括所有古細菌和真細菌和
龍億濤等腫瘤分子標志物單細胞逐層成像獲新進展
腫瘤分子標志物的存在或表達變化是研究腫瘤發生、發展以及調控機制的重要基礎。通過對不同腫瘤分子標志物表達進行檢測,可以幫助腫瘤的診斷、分類、預后以及治療。華東理工大學化學學院龍億濤教授科研小組在腫瘤分子標志物單細胞逐層成像研究方面取得了突破性進展,相關研究成果日前已在線發表于《德國應用化學》。
單細胞分離對單細胞測序領域有著很大的幫助
單細胞分離可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來,然后移到合適的培養基進行培養,分離法對操作技術有比較高的要求,多限于高度專業化的科學研究中采用。 它不僅僅可以用于分離單細胞,還可以用于nl級別試劑的分配和磁珠的分選,對于單細胞測序領域有著很大的幫助。快速高效接種單個活細胞
Namocell單細胞分離儀在單細胞測序領域的應用
9月26至27日2019年細胞產業大會暨2019第四屆(上海)細胞與腫瘤醫療高峰論壇在上海新南雅酒店舉行。本屆會議,邀請了全國30位專家學者、人物演講、40家企業參展,400余人報名參會,逾500人參加了會議,就細胞儲存、細胞治療、細胞培養、細胞工程、細胞銀行、細胞能量與代謝、細胞免疫學、細胞生理學
單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助
???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像,單細胞隔離,單細胞選擇功能于一體,自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管,PCR微孔板或其它反應微管中,在隔離單細胞后,它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像,采用倒置熒光顯微鏡,配備自動掃描顯微鏡載物臺,自
單細胞分離技術應用于眾多領域的單細胞分析
單細胞分離目前主要有三種選擇:手動分離、熒光激活細胞分選和微流體技術。當然,除了成熟的方法,巧妙的新方法也在不斷涌現,能以更高的準確性和特異性來分離單細胞。 將細胞分散到懸液中,會失去它們在組織里的位置信息。如果想了解單細胞所處的環境,就需要用到激光捕獲顯微切割技術,這種技術通過掃描組織切片來
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。