放射性標記的探針與固定在膜上的核酸的Southern雜交
實驗方法原理 Southern 雜交獲得的信號強度取決于若干因素,包括固定的 DNA 與探針互補的比例、探針的大小及特異活性以及轉移到膜上的基因組 DNA 的數量。在最佳條件下,這種方法的敏感度足以檢測到與 32P 標記的高度特異(>109 cpm/μg)的探針互補的 <0.1 pg 的 DNA。 實驗材料 固定于膜上的 DNA 無菌水配的 poly (A) RNA DNA 或 RNA 探針 鮭魚精 DNA 試劑、試劑盒 磷酸-SDS 洗液 預雜交......閱讀全文
Southern雜交分析原理和操作
【原理】Southern雜交是分子生物學的經典實驗方法。其基本原理是將待檢測的DNA樣品固定在固相載體上,與標記的核酸探針進行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號。通過Southern雜交可以判斷被檢測的DNA樣品中是否有與探針同源的片段以及該片段的長度。一.基因組DNA的限制
關于Southern雜交的探針標記簡介
用于Southern印跡雜交的探針可以是純化的DNA片段或寡核苷酸片段。探針可以用放射性物質標記或用地高辛標記,放射性標記靈敏度高,效果好;地高辛標記沒有半衰期,安全性好。人工合成的短寡核苷酸可以用T4多聚核苷酸激酶進行末端標記。探針標記的方法有隨機引物法、切口平移法和末端標記法。
痘苗DNA檢測實驗——Southern-雜交法
實驗方法原理以前,用 HindIII 限制性內切核酸酶消化鑒定痕苗病毒 DNA。大部分的外源基因插入重組病毒的 TK 基因中,TK 基因位于 HindIII 5.1 kb 的 J 片段上。這樣在重組病毒中,如果插入片段上沒有 HindIII 內切酶位點,則J片段就會增大。如果缺乏 HindIII 5
Southern雜交技術的方法和步驟
Southern雜交可用來檢測經限制性內切酶切割后的DNA片段中是否存在與探針同源的序列,它包括下列步驟:(1) 酶切DNA, 凝膠電泳分離各酶切片段,然后使DNA原位變性。(2) 將DNA片段轉移到固體支持物(硝酸纖維素濾膜或尼龍膜)上。(3)?預雜交濾膜,掩蓋濾膜上非特異性位點。(4) 讓探針與
southern印跡雜交的方法步驟
以哺乳動物基因組DNA為例,介紹Southern印跡雜交的基本步驟。一、 待測核酸樣品的制備(一)制備待測DNA基因組DNA是從動物組織(或)細胞制備。1.采用適當的化學試劑裂解細胞,或者用組織勻漿器研磨破碎組織中的細胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白質和RNA;3.用有機試劑(酚/氯仿)抽提
Southern雜交待測核酸樣品的制備
(一)制備待測DNA 基因組DNA是從動物組織(或)細胞制備。1.采用適當的化學試劑裂解細胞,或者用組織勻漿器研磨破碎組織中的細胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白質和RNA;3.用有機試劑(酚/氯仿)抽提方法去除蛋白質。 (二) DNA限制酶消化 基因組DNA很長,需要將其切割成大小
Southern雜交的基本原理介紹
轉印后的濾膜在預雜交液中溫育4-6h,即可加入標記的探針DNA(探針DNA預先經加熱變性成為單鏈DNA分子),即可進行雜交反應。雜交是在相對高離子強度的緩沖鹽溶液中進行。雜交過夜,然后在較高溫度下用鹽溶液洗膜。離子強度越低,溫度越高,雜交的嚴格程度越高,也就是說,只有探針和待測順序之間有非常高的
關于Southern雜交的轉膜的介紹
即將凝膠中的單鏈DNA片段轉移到固相支持物上。而此過程最重要的是保持各DNA片段的相對位置不變。DNA是沿與凝膠平面垂直的方向移出并轉移到膜上,因此,凝膠中的DNA片段雖然在堿變性過程已經變性成單鏈并已斷裂,轉移后各個DNA片段在膜上的相對位置與在凝膠中的相對位置仍然一樣,故而稱為印跡(blot
Southern雜交一般操作方法
一 基因組酶切和電泳在200 μl 微量離心管中加入:25 μl DNA樣品(約10μg),3μl 限制性內切酶(MBI,10 U/ μl)5 μl 相應的10×buffer,補水到50μl。然后加一滴礦物油覆蓋, 稍微離心后放于37℃水浴8-12小時。酶切完后,取5μl 酶切DNA樣品于0.8%的
關于Southern雜交的洗膜的介紹
取出NC膜,在2×SSC溶液中漂洗5min,然后按照下列條件洗膜: 2×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 1×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 0.5×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 0.2×SSC/0.1% SDS,56℃,10min; 0
northern,southern,western雜交的具體步驟
所用于分析的對象不同。 Northern雜交用于分析RNA; Southern雜交用于分析DNA; Western雜交用于分析蛋白質。大致過程如下: (1) 酶切DNA, 凝膠電泳分離各酶
southern印跡雜交的基本概念
Southern印跡雜交是進行基因組DNA特定序列定位的通用方法。其基本原理是:具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補的原則特異性地雜交形成雙鏈。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段轉移至尼龍膜或其他固相支持物上,經干
Southern-Blot雜交的原理、步驟及應用
原理Southern印跡雜交技術是分子生物學領域中最常用的具體方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補的原 則形成雙鏈,此雜交過程是高度特異的。由于核酸分子的高度特異性及檢測方 法的靈敏性,綜合凝膠電泳和 核酸內切限制酶分析的結果,便可繪制出DNA分子的限制圖
Southern-雜交操作步驟及注意事項
Southern 雜交是分子生物學的經典實驗方法。其基本原理是將待檢測的DNA樣品固定在固相載體上,與標記的核酸探針進行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號。通過Southern雜交可以判斷被檢測的DNA樣品中是否有與探針同源的片段以及該片段的長度。該項技術廣泛被應用在遺傳病
基因組DNA-Southern雜交操作步驟
1)基因組DNA Southern印跡的制備 預備 1.用適當的限制性內切酶消化基因組DNA樣品(10μg)。 2.進行瓊脂糖凝膠電泳。一般用0.7~1.0%的瓊脂糖凝膠分離基因組DNA,它在1~15kb的范圍內有較好的分辨率,可選用TBE或TAE緩沖液。瓊脂糖凝膠電泳需在1V/cm的電
Southern印跡雜交實驗原理和方法3
真空轉移法的最大優點是迅速,可在轉膜的同時進行DNA變性與中和整個過程約需30~60分鐘。但在操作中應注意兩個問題,一是真空壓力不能太大,若壓力過大,凝膠被壓縮,轉移效率會降低;二是真空轉移液要密封嚴,防止漏氣影響壓力的產生。下表列出了不同的印跡方法。表10-2 不同印跡方法的比較表五、探針標記用于
Southern雜交電泳凝膠預處理的原理
DNA樣品在制備和電泳過程中始終保持雙鏈結構。為了進行有效地實現Southern印跡轉移,對電泳凝膠做預處理十分必要。分子量超過10kb的較大的DNA片段與較短的小分子量DNA相比,需要更長的轉移時間。所以為了使DNA片段在合理的時間內從凝膠中移動出來,必須將最長的DNA片段控制在大約2kb以下
Southern印跡雜交實驗原理和方法2
(一) 細管虹吸印跡法此法是利用濃鹽酸轉移緩沖液的推動作用將凝膠中的DNA轉移到固相支持物上,轉移方式見圖10-1:容器中的轉移緩沖液含有高濃度的NaCl和檸檬酸鈉,上層吸水紙的虹吸作用使緩沖液通過濾紙橋、濾紙、凝膠、硝酸纖維素膜或尼龍膜向上運動,同時帶動凝膠中的DNA片段垂直向上運動而滯留在膜上。
Southern印跡雜交實驗原理和方法1
實驗原理核酸分子雜交技術是分子生物學領域中最常用的具體方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補的原則形成雙鏈,此雜交過程是高度特異的。由于核酸分子的高度特異性及檢測方法的靈敏性,綜合凝膠電泳和核酸內切限制酶分析的結果,便可繪制出DNA分子的限制圖譜。但為了進一
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
Southern 印跡 放射性標記的探針與固定化核酸進行雜交 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強,當電泳后凝膠經過DNA變
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
實驗材料 基因組 DNA試劑、試劑盒 限制性緩沖液儀器、耗材 瓊脂糖凝膠實驗步驟 1. 7~20 μg 基因組 DNA 稀釋到 500 μl 合適的限制性緩沖液中。4℃ 過夜。2. 每管加 10~20 單位限制性酶。孵育 4~6 小時。10 μl 消化液在小瓊脂糖凝膠上電泳檢測消化的程度。如果需要,
Southern雜交電泳凝膠預處理的基本步驟
1. 如果靶序列>5kb,則需進行脫嘌呤處理。 (1) 把凝膠浸在0.25mol/L HCl中,室溫輕輕晃動,直到溴酚藍從藍變黃。 注意:處理人類基因組DNA≤10分鐘;處理植物基因組DNA≤20分鐘。 (2) 把凝膠浸在滅菌雙蒸水中 2. 如果靶序列
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
放射性標記的探針與固定化核酸進行雜交試劑、試劑盒預雜交液SSCSDS儀器、耗材硝酸纖維素濾膜實驗步驟1. 準備適合即將進行的工作的雜交溶液。每平方厘米硝酸纖維素濾膜或尼龍膜大約需要 0.2 ml 預雜交液。預雜交液:用于檢測低豐度序列:或者6x SSC ( 或 6x SSPE)5 x Denhard
核酸雜交技術(Northern-Blot、Southern-Blot和探針標記)
(一)Southern Blot原理:將待檢測的DNA分子用/不用限制性內切酶消化后,通過瓊脂糖凝膠電泳進行分離,繼而將其變性并按其在凝膠中的位置轉移到硝酸纖維素薄膜或尼龍膜上,固定后再與同位素或其它標記物標記的DNA或RNA探針進行反應。如果待檢物中含有與探針互補的序列,則二者通過堿基互補的原理進
outhern印跡及基因組DNA雜交技術實驗——Southern-印跡
實驗方法原理硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強,當電泳后凝膠經過DNA變性處理,覆以上述濾膜,再于其上方壓上多層干燥的吸水紙,借助它對深鹽溶液的上吸作用,凝膠上的單鏈DNA將轉移到濾膜上。轉移是原位的,即DNA片段的位置保持不變。轉移結束后,經過80℃烘烤的DNA,將原位地固定于膜上。實
核酸蛋白轉移電泳及雜交(Southern-Blot、Northern-Blot和...2
(10)倒去預雜交液,加入含探針的雜交液封口,42℃ 6h或過夜。 (11)取出轉移膜,按以下條件洗膜 1×SSC,0.1%SDS室溫2×15分鐘 0.25SSC,0.1%SDS,42℃ 2×15分鐘,氣中干燥。 (12)將雜交后的膜曝光于X光片,暗盒中放射自顯影2~
核酸蛋白轉移電泳及雜交(Southern-Blot、Northern-Blot和...1
一、DNA Southern Blot及雜交 本技術可用于基因組DNA特定序列定位,尤其可分析某些基因的限制性內切酶長度多態性,對遺傳性疾病的早期基因診斷、產前診斷或基因變異等方面的研究有應用價值,其過程包括:樣品DNA內切酶水解、水解片斷的瓊脂糖凝膠電泳分離、分離后水解片斷的轉移(固定)、特異
分子生物學里的Northern-Southern雜交的原理
①Southern印跡雜交:用于分析DNA,包括兩個主要過程:一是印跡,即將待測定核酸分子通過一定的方法轉移并結合到一定的固相支持物(硝酸纖維素膜或尼龍膜)上;二是退火,與固定于膜上的同位素標記的探針進行分子雜交,并進行顯影觀察,這樣即可查找所需DNA的位點.②Northern印跡雜交:將RNA從瓊
SOUTHERN-BLOTTING
Materials:Whatman 3 mm Blotting Papernitrocellulose (Schleicher & Schuell, Amersham) or nylon membrane filter (Amersham).Paper towels (preferably C-fo
Southern-Blot
1. Run gel (0.8 -1.0% agarose is best). For yeast chromosomal Southerns, digest 20 μg DNA. Use 50 ml minigel for most purposes. Photograph gel, but mi