定量蛋白質組學質譜采集技術進展（一）
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋白質組學在相對定量和絕對定量分析方面的局限提供了有效途徑。本文對定量蛋白質組學目前遇到的瓶頸問題進行了分析,總結了質譜定量采集技術的最新進展,并評述了這些新技術的特點以及在定量蛋白質組學應用中的優勢。 關鍵詞 定量蛋白質組學; 同步母離子選擇; 平行反應監測; 數據非依賴性采集; 綜述 1引言 當今蛋白質組學的關注焦點和研究趨勢已經逐漸從定性分析轉向定量分析。定量蛋白質組學是對細胞、組織乃至完整生物體的蛋白質表達進行定量分析,對生物過程機理的探索和臨床診斷標志物的發現與驗證具有重要意義[1,2] 。定......閱讀全文
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（一）
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（四）
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（二）
同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,
綜述：基于質譜技術的糖蛋白質組學與糖組學研究進展
糖是組成生命體的四大類重要分子之一，糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內，在很多生命過程中起著重要作用，如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時，糖基化修飾在疾病中，特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用，許多疾
質譜和蛋白質組學：擊中目標
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)?? 作者：Nathan Blow?? 分析測試百科? 譯 ??? 近年來，質譜儀大幅提高了動態范圍和靈敏度，使研究者們在疾病生物標志物的發現和驗證方面，更從容地面對挑戰。 ??? 在2008年6月的美國質譜大會（ASMS）
定量蛋白質組學的技術發展
以質譜為基礎的定向蛋白質組學研究領域的發展歷程并不短，早在上個世紀70年，三重四極桿質譜儀就已經出現，并在80年代首次在發表的文章中，證明可以被用來檢測肽段。 過去幾年間，更廣泛的范圍內定向質譜技術的應用迅速攀升，而且新方法，新工具，新資源和新一代方法，也令更多研究領域的科學家們能利用到這項技
AB SCIEX推出創新的蛋白質組學質譜應用新技術
將與蘇黎世聯邦理工學院通力合作，專注發展 TripleTOF 5600 系統上的 SWATH? 采集方式，來研究全面的系統蛋白質組學 馬薩諸塞州弗雷明漢市2011年6月7日電 /美通社亞洲/? --蘇黎世聯邦理工學院及 AB SCIEX（全球領
質譜技術幫助科學家發現蛋白質組學重要成果
最近，來自瑞士和荷蘭的科學家，對在22種不同生長條件下大腸桿菌表達的蛋白質，進行了定量和定性分析。確定了超過2300個蛋白質，其中一些處于每個細胞一個副本的平均水平。由此產生的數據集描述了細胞中大多數(> 90%)的蛋白質量，對細胞生物學家來說這將是一個寶藏。相關研究結果發表在十二月出版的《Na
質譜技術助力全新定量蛋白質組數據差異分析計算模型
8月13日，國際學術期刊Cell Discovery 在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所中科院計算生物學重點實驗室（馬普計算生物學研究所）邵振課題組研究論文“MAP: model-based analysis of proteomic data to detect proteins wit