WIKI資訊
引言數據非依賴性的掃描模式（data-independent acquisition, DIA）是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。DIA 掃描模式中，超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂，采集所有母離子的碎片離子，并快速地依次掃描相鄰的母離子寬口內的所有碎片離子。DIA 的數據中包含了所有碎片離子的保留時間和強度信息。用非常小的質量偏差寬口（如 10 ppm）目標性地抽提同一肽段的多個子離子，計算子離子的強度，就能對該肽段進行鑒定和定量。DIA 定量相比傳統的基于母離子強度的 DDA 定量有選擇性好，定量準確等優點[1]，所以 DIA 成為定量蛋白組學新的發展方向。 Q Exactive HF 是賽默飛世爾科技在 2014 年的 ASMS 上推出的全新靜電場軌道阱超高分辨質譜儀（圖 1）[2,3]。Q Exactive H......閱讀全文
Skyline 中嵌入的 mProphet 軟件會根據同一肽段的多個子離子峰的 feature 進行打分。 Feature 包括子離子共流出峰形、保留時間偏差、 dotp 值、信噪比等。為了區分假陽性的子離子峰， mProphet 可以建立 decoy 庫，也可以將打分排名第二的肽段作為decoy，
500 ng Hela 細胞裂解液用相同的色譜柱，相同的色譜梯度，將 QE HF 切換至 DIA 掃描模式進行 3 次 DIA 數據采集。在一次掃描循環中，目標母離子質核比范圍 400–1000，四極桿的隔離窗口為 12 Da，包含 50 次 MS/MS 掃描。每一張 MS/MS 譜圖中
2014年4月27日下午，中國化學會首屆全國質譜分析學術研討會組學及生命分析分會在北京西郊賓館召開。在此次的組學及生命分析分會報告中邀請了清華大學化學系/分析中心的梁瓊麟教授； 中國科學院大連化學物理研究所的張麗華教授；中國科學院北京基因組研究所的劉斯奇教授； 復旦大學的陸豪杰