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    土壤基因組DNA提取試劑盒使用說明

    本試劑盒提供了從各種來源的土壤中快速簡便的提取基因組DNA的方法。土壤樣品中存在大量的抑制因子如腐殖酸、金屬離子等,這些物質即使微量存在于純化后的DNA中也會對下游反應,如對PCR、限制性酶切等產生影響。因而純化土壤DNA的關鍵在于如何有效的去除土壤中的抑制因子。采用本公司特有的DNA-only硅膠膜離心柱和溶液配方,搭配Foregene Protease,可以有效的去除土壤中各種抑制因子,無需有機溶劑抽提或乙醇及異丙醇沉淀,在90分鐘內即可完成對土壤樣品中DNA的提取操作。產品特點? 無RNA酶污染:無需額外添加RNA酶即可去除基因組DNA中的RNA,避免實驗室遭受外源RNA酶污染。? 速度快:操作簡單,土壤基因組DNA提取操作在90分鐘內即可完成。? 方 便:離心操作均在常溫,無需4℃低溫離心或乙醇沉淀DNA。? 安 全:無需有機試劑抽提。? 質量高:提取獲得的基因組DNA片段大、無RNA、無RNA酶、離子含量極低,能滿足各......閱讀全文

    浙大團隊繪制土壤基因組基因相關性網絡 解碼土壤“黑箱”

      土壤微生物是元素生物地球化學循環過程及其他土壤生態過程的關鍵驅動因子。由于土壤結構和組成的復雜性,土壤微生物生態過程在研究中一直以來都被作為“黑箱”看待,要清楚闡明土壤生態功能是土壤生態學研究當前面臨的一個重大挑戰。  近日,浙江大學環境與資源學院徐建明教授團隊在微生物學頂級期刊《國際微生物生態

    如何提取土壤中的高通量核酸?

    土壤是指地球表面的一層疏松的物質,由各種顆粒狀礦物質、有機物質、水分、空氣、微生物等組成,能生長植物。土壤微生物的數量很大,1克土壤中就含有4000~7000種近10億個細菌。1畝地耕層土壤中,微生物的重量能達到300-3000公斤。而其中90%以上的微生物都是無法直接培養的。因此,提取土壤中的微生

    PNAS:新型DNA分析策略助力土壤宏基因組研究

      對于土壤微生物來說,這是最好的時代。雖然沒有人進行過準確的調查,但一勺土壤中就容納了數千億個微生物細胞,包含成千上萬的物種。密歇根州立大學(MSU)微生物生態學中心的特聘教授Jim Tiedje指出:“土壤是地球上最多樣的微生物棲息地,但我們很少了解土壤微生物的身份和功能。”Tiedje和M

    協同創新驅動農業基因組學發展

       “作為生物技術領域最基礎的學科,農業基因組學研究不僅需要國內外科學家同行的協同創新,更需要與生物技術產業發展需求無縫銜接,才能發揮出農業基因組學的最大潛能。基于這種認識,在國家農業科技創新聯盟的框架下,建立農業基因組學的協同創新聯盟就顯得十分迫切。”中國農科院科技局局長梅旭榮表示。  7月24

    454高通量測序——研究土壤微生物的新手段

      在陸地生態系統中,在土壤中生活有數量龐大的微生物種群,包括原核微生物如細菌、藍細菌、放線菌及超顯微結構微生物, 以及真核生物如真菌、藻類( 藍藻除外) 、地衣等。它們與植物和動物有著明確的分工,主要扮演“分解者”的角色,幾乎參與土壤中一切生物和生物化學反應,擔負著地球C、N、P、S 等物質循環的

    454高通量測序-研究土壤微生物的新手段

    在陸地生態系統中,在土壤中生活有數量龐大的微生物種群,包括原核微生物如細菌、藍細菌、放線菌及超顯微結構微生物, 以及真核生物如真菌、藻類( 藍藻除外) 、地衣等。它們與植物和動物有著明確的分工,主要扮演“分解者”的角色,幾乎參與土壤中一切生物和生物化學反應,擔負著地球C、N、P、S 等物質循環

    我國科學家找到“植物殺手”薇甘菊速生機制

      由中國農業科學院深圳農業基因組研究所主持的一項研究日前在學術期刊《自然·通訊》在線發表。該研究從多個角度揭示了薇甘菊的環境適應性進化和快速生長的分子機制,為防治這一重要外來入侵植物提供了理論依據。  薇甘菊原產于中南美洲,隨后入侵到東南亞等地,已被列入世界最有害的外來入侵物種之一,也是中國首批外

    第一屆地球環境微生物計劃會議在深圳召開

      6月14日,第一屆地球環境微生物計劃(EMP)會議在深圳召開。世界各國科學家將攜手全方位分析全球范圍內微生物群落的多樣性及功能。項目將對全球典型的環境樣本進行宏基因組測序,其中包括土壤、海洋、空氣、淡水生態系統等整個地球表面的絕大多數的微生物群落。   會上,來自各國的專家學者相互分享了微生物

    中外科學家全方位分析全球微生物群落

      6月14日,第一屆地球環境微生物計劃(EMP)會議在深圳召開。世界各國科學家將攜手全方位分析全球范圍內微生物群落的多樣性及功能。項目將對全球典型的環境樣本進行宏基因組測序,其中包括土壤、海洋、空氣、淡水生態系統等整個地球表面的絕大多數的微生物群落。   會上,來自各國的專家學者相互分享了微生物

    穩定輸出,樣本DNA提取案例分享

    最近實驗室的師兄師姐們反饋,試用了MP的兩款柱膜法新品試劑盒(SPINeasy DNA Kit for Soil和SPINeasy DNA Kit for Feces)都得到比較理想的實驗數據,問了一圈身邊的科研小伙伴們,認為操作簡便,提取DNA純度高、收率好的試劑盒為優先考慮購買的上上之選

    Nature破解土壤中的耐藥基因組

      在美國,每年大約有兩百萬人受到耐藥菌的感染,其中有超過兩萬三千人會因此而死亡。人們發現,耐藥菌能夠分享對抗生素的抗性,這種現象無疑進一步加重了公共健康所面臨的威脅。  近日華盛頓大學醫學院的科學家們解析了土壤細菌的耐藥基因組(resistome)。他們發現,生活在土壤中的天然細菌擁有大

    不同品牌試劑盒提取土壤DNA的結果對比

    1.引言 提取高濃度、大片段、多樣性程度高、具有代表性的土壤微生物總DNA對土壤微生物多樣性研究至關重要。然而,土壤是一個非常復雜的異質體系,其中含有的腐植酸及腐植酸類似物、酚類化合物、重金屬離子等,在DNA提取過程中如不能有效去除,將直接影響后續的PCR擴增、核酸雜交、內切酶消化等分子操作。用傳統

    Cell丨程時鋒團隊揭示現存陸地植物的共同祖先起源類群

      光合真核生命起源于大約15億年前的海洋,繁盛于有光和水的地方;大約5-6億年前,發生了綠藻陸地化事件,祖先綠色植物開始了從簡單到復雜、從水生向陸地的邁進。植物陸地化是一個漫長而復雜的演化過程,在潮起潮落、滄海桑田的跌宕變遷中,一些地理生境出現周期性干涸的現象,如形成小水坑、河床、近海泥沼等,開始

    12月王牌聚焦:管住那些會帶來麻煩的科研成果

      即將告別2015,迎來2016,倒數夜世界各地的人都將開始新年倒數,但這個時候也是最令各處警察緊張的時刻,因為人群聚集有可能會引發騷亂和事故,因此需要多加管制。同理一些生命科學研究也必須加以監管,否則帶來的也許將是一場災難。  今年美國FDA在審慎考慮了二十年之后,終于批準了一種轉基因三文魚用作

    基因組所程時鋒團隊揭示植物祖先成功登陸的分子機制!

      2019年11月14日,Cell雜志在線發表了來自中國農業科學院基因組所合成生物學中心程時鋒團隊聯合德國、加拿大、俄羅斯與深圳華大基因等團隊題為“Genomes of subaerial zygnematophyceae provide insights into land plant evol

    “童年”生長環境決定作物“成年”健康

      人們常說“三歲看大”,童年的成長環境影響著人成年后的身體健康。最近,科學家發現,作物也是如此。9月26日,《科學進展》在線發表南京農業大學資環學院教授沈其榮團隊最新研究成果。他們發現,土傳病原菌入侵作物根際或根系,與苗期土壤中病原菌的數量、土壤理化特性的高低并沒有關系,而與苗期土壤細菌群落的結構

    兩種新型CRISPR/Cas基因編輯系統問世

      英國《自然》雜志21日發表一項生物學進展,報告了兩種新型的CRISPR/Cas基因編輯系統。  CRISPR被稱為“生物科學領域的游戲規則改變者”,現已發展成為該領域最炙手可熱的研究工具之一。以往研究表明,通過介入,CRISPR能使基因組更有效地產生變化或突變,效率比既往基因編輯技術更高。現在,

    “耕地土壤生物功能分析方法”培訓會在南京土壤所召開

      7月10日,由農業部耕地保育重點實驗室主辦的“耕地土壤生物功能分析方法—基因芯片及高通量分析技術”培訓會在中國科學院南京土壤研究所成功召開。耕地保育學科群各單位有關專家、代表共40余人參加了本次培訓會議。培訓會議由農業部耕地保育重點實驗室常務副主任孫波研究員主持。  南京土壤所副所長蔣新首先致會

    454高通量測序——研究土壤微生物的新手段(一)

    在陸地生態系統中,在土壤中生活有數量龐大的微生物種群,包括原核微生物如細菌、藍細菌、放線菌及超顯微結構微生物, 以及真核生物如真菌、藻類( 藍藻除外) 、地衣等。它們與植物和動物有著明確的分工,主要扮演“分解者”的角色,幾乎參與土壤中一切生物和生物化學反應,擔負著地球C、N、P、S 等物

    永久凍土帶漸消融 微生物釋放成焦點

    正在消融的永久凍土帶。  北極永久凍土中封存的碳估計有16720億公噸,超過2009年美國溫室氣體排放量的250倍。然而,永久凍土帶消融會否導致這些被困無數個世代的碳逸出,給碳循環帶來潛在影響?隨著全球氣溫緩慢上升,這樣的憂慮也在升溫。在這種情況下,包含在凍土層中的微

    楊國威/楊劍等揭示細菌細胞收縮注射系統多樣性特征

      在進化過程中,細菌及其他微生物學可通過其編碼的多種分泌系統與宿主相互作用并應對相應的環境改變。細菌細胞外可收縮注射系統(extracellular Contractile Injection System, eCIS),不同于必須錨定在自身細胞膜上的常規CIS系統(如六型分泌系統T6SS),eC

    南極微生物可依靠微量氣體生存

      南極洲是地球上環境最嚴酷的地區之一,然而這里的微生物群落種類豐富,令科學家費解。圖片來源于網絡  新一期英國《自然》雜志刊登研究報告說,南極洲的一些微生物可在極端條件下依靠空氣中微量的氫氣、一氧化碳等氣體存活。  由澳大利亞新南威爾士大學領導的研究團隊在南極洲東部的威爾克斯地和伊麗莎白公主地兩處

    如何選擇最佳的全血DNA、RNA提取方法?

    從全血中提取DNA和RNA應該說是最基本的工作了,提取的DNA和RNA質量的好壞直接影響了下游的實驗和分析,可供選擇的方法非常多,亂花漸欲迷人眼,如何選擇最適合的方法,成了很多人實驗開始前最難以抉擇的事情。我們從兩個方面,層層剝繭,分析最佳的實驗方法。 1、全血的采集保存和DNA的提取I. 用含抗凝

    北京基因組所細菌陸生化研究取得階段性成果

      近日,中國科學院北京基因組研究所章張課題組對DnaE2酶的研究取得了新進展。該研究合理地解釋了新基因產生和基因組進化對細菌環境適應性的影響,并進一步討論了真核生物與陸生菌之間的共進化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Micro

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    DGGE技術在微生物生態學中的應用

      在自然界中存在大量豐富的微生物資源,但目前被人們所培養利用的僅僅占1%~10%,還有大量的微生物沒有被人們所了解和利用。隨著基因組學在生物技術領域的不斷發展,微生物基因組學的研究憑借基因組研究(TIGR)所利用鳥槍法成功地對流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因組序

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    土壤微生物響應氣候暖化分子機制獲揭示

      日前,清華大學環境學院周集中研究組發現氣候暖化背景下微生物活動對永久凍土帶土壤碳庫的重要影響。相關成果發布于《自然—氣候變化》。  整個北半球土壤有機碳總量的一半富集在北極地區,其原因是氣溫較低導致微生物對永久凍土帶土壤有機碳的分解緩慢,有利于有機碳的積累。由于人類活動的影響,近幾十年來北極地區

    Eppendorf參加第一屆地球環境微生物計劃(EMP)會議

      中國 深圳(2011年7月5日) 6月13-15日,全球領先的生物技術公司Eppendorf參加了由深圳華大基因、基因組標準協會(GSC)和地球環境微生物聯盟(EMP)共同舉辦的 “第一屆地球環境微生物計劃(EMP)會議”。一直以來Eppendorf公司和地球環境微生物聯

    數百微生物基因組草圖繪成 全新抗生素或由此產生

      英國《自然》雜志14日在線發表的一項微生物學最新成果,美國科學家團隊繪制完成數百個非培養且未被研究過的微生物基因組草圖,并鑒定出了一千多個生物合成基因簇。研究表明,土壤中的細菌極有可能代表了一種有待開發的新型抗生素,以及其他藥用化合物的來源。圖片來源于網絡   細菌在與抗生素的博弈中,已經變得越

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