( 5 ) Arndt 等設計了一個多肽庫。此庫的設計基于 Jim-Fos 雜二聚,庫中 b、c 和 f 殘基來自于各自的野生型蛋白,a 位和 d 位為 Val 和 Leu ( 帶有 a3Asn 在核心的插入例外,此插入引導期望的螺旋取向和寡聚態),e 和 g 殘基則用三核苷酸作改變以得到等摩爾的 Arg、Lys、Gin 和 Glu 混合物(見注 7;參考文獻 [8])。出人預料的是,最好地選擇出來的成功者-Winzip-A2B1 雜二聚體(見注 18),在 g/e' 位缺少完全互補的帶電殘基,盡管選擇過程是很徹底的。更確切些說,6 個 g/e' 對的兩個預測為排斥的,提示得到的序列偏離簡單的電荷互補規則( PV 假設)。可以假定,整體靜電勢(包括分子內和分子間相互作用)起主要的作用,并且與核心殘基的作用,如像有利的堆積或立體沖撞,也可以調節這些 g/e' 作用(見參考文獻 [......閱讀全文
盤繞螺旋結構的設計和優化技巧 實驗步驟 本節討論盤
雖然表觀上簡單,盤繞螺旋(coiled coil ) 模體是高度專一的,并在理解三級結構及其形成方面具有重要意義。最常觀察到的盤繞螺旋形態——平行二聚態,其一般的結構類型仍有待全面的描述。盡管如此,其結構已呈現出在某些特定位置需要某些特定類型氨基酸的嚴格規則。本實驗來源「現代蛋白質工程實驗指南」〔德