為了全面探索YTHDF1及其靶基因之間的直接相互作用,作者對過表YTHDF1的A2780細胞,進行了eCLIP-seq,并鑒定了2,343個目標轉錄物,這些轉錄物大多數是mRNA。將eCLIP seq的結果2,343個基因和上面三組數據交集確定的647個基因取交集,產生175個基因,將其確定為YTHDF1的直接結合靶基因。接下來,作者分析了175個基因上,m6A峰和YTHDF1結合mRNA上的eCLIP峰的分布。作者發現這些轉錄本中的大多數YTHDF1結合位點(包括EIF3C)都與m6A位點非常吻合。GO分析表明,結合YTHDF1的轉錄本與翻譯調控最密切相關。EIF3C是真核轉錄起始因子EIF3的亞基之一,其翻譯控制有助于腫瘤發生。此外,EIF3C與多種癌癥(包括肝細胞癌,結腸癌和乳腺癌)的惡性行為相關。CLIP-qPCR還顯示YTHDF1最顯著富集EIF3C mRNA。這些數據表明EIF3C是YTHDF1在卵巢癌細......閱讀全文
m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,例如癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等。2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子的輝煌。2020年1月何川教授團隊再次帶領m6A登上頂級期刊Science,預示著m6A等RNA修飾
m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,例如癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等。2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子的輝煌。2020年1月何川教授團隊再次帶領m6A登上頂級期刊Science,預示著m6A等RNA修飾
導讀 RNA甲基化修飾在調控生物生長發育的過程中起重要作用,m6A和m5C在植物體內的產生機制和生物學功能已有較多研究論文發表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修飾在植物中的研究還非常少。 近日,Plant Physiology 在線發表了華南農業大學余義勛課題組題為“The
m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代謝和翻譯,以及在細胞分化、胚胎發育和壓力應答等過程中起重要作用。這一次,研究重大發現m6A修飾在“人類繁衍”中也發揮著重大意義,該方向的發現將會吸引著更多的科研工作者探究在m6A與“不孕不育”的密切聯系。云序生物一