認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“人類泛基因組”的概念，即人類群體基因序列的總和。2009 年泛基因組測序首次應用于人類基因組學研究；2013 年泛基因組測序應用于動植物研究領域。如圖，泛基因組進而可以分為，核心基因組（core genome）和可變基因組 (variable genome)。核心基因指的是，在所有動植物品系或者菌株中都存在的基。可變基因組是指，在1個以及1個以上的動植物品系或者菌株中存在的基因。如果某個基因，僅存在某一個動植物品系或者菌株中，該基因還可以細分為品系或者菌株特有基因。一般來說，核心基因組控制著生命體基本生成代謝的功能。另外，結構變異中的......閱讀全文
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
“泛轉錄組”首次用于RNA測序分析
近日發表在《自然·方法》雜志上的一篇新論文中，美國加利福尼亞大學圣克魯斯分校（UCSC）的研究人員介紹了有史以來第一種使用“泛轉錄組”分析全基因組RNA測序數據的方法。 分析一個人的基因表達需要將他的RNA圖譜映射到一個標準參照物，以深入了解基因在多大程度上“開啟”并在體內發揮功能。但當參照物不
“泛轉錄組”首次用于RNA測序分析
近日發表在《自然·方法》雜志上的一篇新論文中，美國加利福尼亞大學圣克魯斯分校（UCSC）的研究人員介紹了有史以來第一種使用“泛轉錄組”分析全基因組RNA測序數據的方法。 分析一個人的基因表達需要將他的RNA圖譜映射到一個標準參照物，以深入了解基因在多大程度上“開啟”并在體內發揮功能。但當參照物
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
我國率先構建野生大豆泛基因組
中國農業科學院作物科學研究所與諾禾致源等合作，在國際上率先構建和分析了一年生野生大豆的泛基因組，為作物種質資源研究和利用提供了新的方法和啟示。該研究成果9月14日在線發表于國際著名學術期刊《自然—生物技術》。 項目牽頭人、中國農科院作科所研究員邱麗娟介紹，大豆是重要的油料和高蛋白糧飼兼用作物。
首個棉花泛基因組圖譜助力分子育種
近日，華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表了題為“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究論文，公布了目前為止變異類型最豐富的棉花遺傳變異數據集。文章
全球首個牧草圖形泛基因組發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495404.shtm?3月3日，四川農業大學（以下簡稱四川農大）草業科技學院教授黃琳凱團隊在國際權威學術期刊《自然—遺傳學》（Nature Genetics）在線發表了題為《美洲狼尾草泛基因組構建、結構變
高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
我國科學家首提“人類泛基因組”
人類基因組存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因 經過不懈研究和攻關，我國科研人員在人類基因組研究中獲得新的重大進展――發現人類基因組中存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因。科研人員還首次提出了“人類泛基因組”的概念。 由深圳華大基因研究院領銜，華南理工大學參與的研