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優勢與局限這種DNA提取方法已被優化用于從人類糞便樣本中提取高分子量(HMW)DNA，但也已在模擬微生物群落和細菌分離株上得到驗證。我們希望該方案可以適用于其他樣品類型，盡管可能需要對裂解前和裂解后步驟進行修改以解釋特定于樣品的制備和污染物清除的問題是必要的。機械裂解方法（如珠子擊打）仍然是連續裂解和下游相對豐度分類的金標準，因為與酶解法相比，機械裂解法的偏差更小。然而，我們以前已經證明，這種酶解法對革蘭氏陽性和革蘭氏陰性的生物都能進行相對一致的裂解。此外，盡管在大量投入樣品的情況下機械裂解方法可能就足夠了，因此可以進行廣泛的大小選擇，但我們的方法可以優化DNA的高產量，并且在輸入樣品量有限的情況下非常有利。我們用于堿基識別，組裝和環化的下游計算工作流程專為從納米孔或PacBio測序生成的易錯，長讀長測序數據而設計。由于納米孔測序會在均聚物區域產生較高的錯誤率，而PacBio測序具有較高但相對隨機的錯誤率，因此仍建議使用短讀長進......閱讀全文
改進的人類腸道微生物組的高分子量DNA提取，納米孔測序和宏基因組學裝配Improved high-molecular-weight DNA extraction,nanopore sequencing and metagenomicassembly from the human gut microb
葡萄（Vitis vinifera L.）是世界四大水果之一，具有很高的經濟價值。我國葡萄種植面積為79.79萬hm2，居世界第二，產量高達1349萬t，居世界首位（聯合國糧農組織2018年數據）。在全球葡萄產業高速發展的同時，葡萄病害問題日益嚴重，其中葡萄枝干病害被認為是過去30年來最具破壞性