將固定于膜上的DNA片段與探針進行雜交之前,必須先進行一個預雜交的過程。因為能結合DNA片段的膜同樣能夠結合探針DNA,在進行雜交前,必須將膜上所有能與DNA結合的位點全部封閉,這就是預雜交的目的。預雜交是將轉印后的濾膜置于一個浸泡在水浴搖床的封閉塑料袋中進行,袋中裝有預雜交液,使預雜交液不斷在膜上流動。預雜交液實際上就是不含探針的雜交液,可以自制或從公司購買,不同的雜交液配方相差較大,雜交溫度也不同。但其中主要含有鮭魚精子DNA(該DNA與哺乳動物的同源性極低,不會與DNA探針DNA雜交)、牛血清等,這些大分子可以封閉膜上所有非特異性吸附位點。具體步驟如下: (一) 配制預雜交液:6×SSC,5×Denhardt’s試劑,0.5% SDS,50%(v/v)甲酰胺,ddH2O,100μg/ml鮭魚精DNA變性后加入。注:1.每平方硝酸纖維素膜需預雜交液0.2ml。2.預雜交液制備時可用或不用poly(A)RNA。3.當使用......閱讀全文
將固定于膜上的DNA片段與探針進行雜交之前,必須先進行一個預雜交的過程。因為能結合DNA片段的膜同樣能夠結合探針DNA,在進行雜交前,必須將膜上所有能與DNA結合的位點全部封閉,這就是預雜交的目的。預雜交是將轉印后的濾膜置于一個浸泡在水浴搖床的封閉塑料袋中進行,袋中裝有預雜交液,使預雜交液不斷在
1.將標記的DNA探針置沸水浴10min,迅速置冰上冷卻1-2min,使DNA變性。 2.從水浴中取出含有濾膜和預雜交液的塑料袋,剪開一角,將變性的DNA探針加到預雜交液中。 3.盡可能除取袋中的空氣,封住袋口,滯留在袋中的氣泡要盡可能地少,為避免同位素污染水浴,將封好的雜交袋再封入另一個未
即將凝膠中的單鏈DNA片段轉移到固相支持物上。而此過程最重要的是保持各DNA片段的相對位置不變。DNA是沿與凝膠平面垂直的方向移出并轉移到膜上,因此,凝膠中的DNA片段雖然在堿變性過程已經變性成單鏈并已斷裂,轉移后各個DNA片段在膜上的相對位置與在凝膠中的相對位置仍然一樣,故而稱為印跡(blot
取出NC膜,在2×SSC溶液中漂洗5min,然后按照下列條件洗膜: 2×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 1×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 0.5×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 0.2×SSC/0.1% SDS,56℃,10min; 0
Southern雜交可用來檢測經限制性內切酶切割后的DNA片段中是否存在與探針同源的序列,它包括下列步驟: (1) 酶切DNA, 凝膠電泳分離各酶切片段,然后使DNA原位變性。 (2) 將DNA片段轉移到固體支持物(硝酸纖維素濾膜或尼龍膜)上。 (3)預雜交濾膜,掩蓋濾膜上非特異性位點。
用于Southern印跡雜交的探針可以是純化的DNA片段或寡核苷酸片段。探針可以用放射性物質標記或用地高辛標記,放射性標記靈敏度高,效果好;地高辛標記沒有半衰期,安全性好。人工合成的短寡核苷酸可以用T4多聚核苷酸激酶進行末端標記。探針標記的方法有隨機引物法、切口平移法和末端標記法。
實驗概要本實驗介紹了Southern雜交的基本流程。主要試劑細菌基因組DNA抽提試劑盒,限制性內切酶,變性溶液,中和溶液,10 X SSC,雜交緩沖液(200mM磷酸鈉緩沖液,PH7.2,1 mM EDTA,50%甲酞胺,1% BSA,7% SDS),隨機引物標記試劑盒,洗脫緩沖液(2 X SSC,
?? Southern雜交可用來檢測經限制性內切酶切割后的DNA片段中是否存在與探針同源的序列,它包括下列步驟: (1) 酶切DNA, 凝膠電泳分離各酶切片段,然后使DNA原位變性。? (2) 將DNA片段轉移到固體支持物(硝酸纖維素濾膜或尼龍膜)上。? (3) 預雜交濾膜,掩蓋濾膜上非特異性
(1) 約50μl體積中酶切10pg-10μg的DNA, 然后在瓊脂糖凝膠中電泳12-24小時(包括DNA分子量標準物)。 (2) 500ml水中加入25μl 10mg/ml溴化乙錠,將凝膠放置其中染色30分鐘, 然后照相。 (3) 依次用下列溶液處理凝膠,并輕微搖動: 500ml 0.2m
?SOUTHERN BLOT1. Run the gel as normal. Often for genomic southerns it is desirable to run long gels (18cm) over 4-6hrs.2. Photograph the gel with a r