什么是RTPCR,RTPCR的定義與檢測方法?
1.定義:是以RNA為模板,聯合逆轉錄反應(reverse transcription,RT)與PCR,可用于檢測單個細胞或少數細胞中少于10個拷貝的RNA模板。 RNA擴增包括兩個步驟: 在單引物的介導下和逆轉錄酶的催化下,合成RNA的互補cDNA;加熱后cDNA與RNA鏈解離,然后與另一引物退火,并由DNA聚合酶催化引物延伸生成雙鏈靶DNA, 最后擴增靶DNA。2.檢測方法⑴一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進行mRNA反轉錄與PCR擴增。Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進行反轉錄和其后PCR擴增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到最低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構建及特異cD......閱讀全文
RTPCR技術的簡介
RT -PCR首先經反轉錄酶的作用以RNA合成 cDNA,再以cDNA為模板,擴增合成目的片段。RT-PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用于檢測細胞中基因表達水平、細胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作為模板的RNA可以是總RNA、mRNA或體外轉錄的RNA產物。無論使用何種RN
RTPCR引物的選擇
隨機引物 適用于長的或具有發卡結構的RNA。適用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反轉錄反應。主要用于單一模板的RT-PCR反應。 Oligo dT 適用于具有PolyA尾巴的RNA。(原核生物的RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴。)由
RTPCR技術的簡介
RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經反轉錄酶的作用,從RNA合成cDNA,再以cDNA為模板,在DNA聚合酶作用下擴增合成目的片段。RT—PCR
RTPCR的反應體系
一:25UL 體系的量如下:無RNA酶水 ?5*buffer 5.0ULDNTP Mix 1.0ULEnzyme Mix 1.0ULprimer A ?(0.6M)Primer B ?(0.6M)RNA模板 ?(不大于1UL)Q (RNA酶抑制劑) 可加可不加二:雖說有幾個試劑未知其量,但都是需要算
RTPCR之外的新冠肺炎診斷方法
目前關于新冠肺炎的檢測方法主要以核酸檢測為主,而核酸檢測主要為傳統的熒光定量PCR方法,需要進行反轉錄、熒光定量等操作步驟,操作過程繁瑣,且有出現檢測結果假陰性的概率。而在針對保證靈敏度和特異性的基礎上,關于新冠病毒的核酸檢測技術也在進一步優化。 恒溫擴增 2月12日,中國新聞網報道
提高RTPCR特異性的方法總結
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法,各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。????? 隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火,產生短的,部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位
RTPCR里的CT值代表什么意思
Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環數。每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值,因此
RtPCR實驗準備及與操作步驟2
六、需購置的Rt-PCR材料:(生工. Tel. 2236106.)Taq酶(含MgCl2 Buffer) 200u 70.00dNTP: 1支oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promegaM-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)RNasin: 1支 110
RtPCR實驗準備及與操作步驟1
一、實驗器具與材料:1、移液槍:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸頭:1ml、200μl、20μl3、勻漿管:5ml4、吸頭臺:放置1ml吸頭的一個,放置20μl吸頭的一個5、EP 管:1.5ml、0.2ml、100μl6、試劑瓶:2個60ml的棕色試劑瓶(廣口,帶蓋)1個125m
RtPCR實驗準備及與操作步驟3
注:1、RNA若用于核酸轉移應溶解于樣本緩沖液中,否則DEPC溶解2、細胞組織加TRIzol勻漿后,可在-60℃放置至少一個月(甚至可一年以上)3、RNA在75%乙醇中,2-8℃至少可保存一周,-20℃至少可保存一年 兩步法RT-PCR (第一步:逆轉錄反應) 試劑 濃度 體積 終濃度
提高RTPCR的靈敏度與產物長度
摘要RT-PCR 已經成為研究者確定感興趣的器官、組織或細胞中mRNA 轉錄本出現、結構和表達水平的基本方法。RT-PCR的基本步驟包括:首先對樣品中出現的所有mRNA 合成一個cDNA拷貝,接著擴增感興趣的基因。因為兩個步驟中使用的反應緩沖液不能兼容,所以這兩個步驟(RT 和PCR)通常分別進行。
基因表達-RTPCR之我見
?本文討論的范圍包括RNA酶保護分析,northernblot,原位雜交,半定量RT-PCR和定量RT-PCR。本文不談具體protocol,是因為各種書籍和kit說明書上都有,主要說一些原則,而且大部分是失敗和成功的經驗,還有小組討論結果以及各種書里七零八落看的內容,希望對大家有用。基因表達的定義
RtPCR經驗總結
Rt-PCR實驗步驟一、實驗器具與材料:1、移液槍:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸頭:1ml、200μl、20μl3、勻漿管:5ml4、吸頭臺:放置1ml吸頭的一個,放置20μl吸頭的一個5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、試劑瓶:2個60ml的棕色試劑瓶(廣口,
RNA提取和RTPCR
在做Northern等雜交實驗、構建cDNA文庫、獲取能夠編碼真核生物蛋白的基因、獲得RNA病毒基因時,會用到RNA提取和RT-PCR技術。真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是
RNA提取和RTPCR
真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA?PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼區,才形成成熟的mRNA
做RTPCR內參的作用
你說的應該是real time PCR吧,注意RT其實是逆轉錄reverse transcription的縮寫,和real time一定要分開來。常說的qPCR,qRT-PCR,都是通過實時(real time)的方法,測定樣品中某個模版的起始量ct值但是呢,由于之前RNA提取、反轉等步驟,各個步驟
RTPCR成功的幾個要素
1、高質量RNA成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。RNA的質量決定了你能夠轉錄到cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)選擇性分離 poly(A)+RNA。不管起始模板是總RNA還是poly(A)
RTPCR技術的影響因素
(一)組織或細胞樣本不是每種組織或細胞都表達所有的基因,即某些基因的mRNA不存在于某些組織或細胞中。因此,確定所選用的材料中是否含有需擴增的目標mRNA模板是實驗成敗的關鍵。(二)引物合成cDNA第一條鏈時,引物可用隨機6聚核苷酸,或下游引物,或poly(dT),其中以6聚核苷酸的隨機引物效果最好
RTPCR的影響因素介紹
RT-PCR反應受多個因素影響,如硫酸鎂的濃度, 引物退火的溫度,擴增的循環數等。1、建議選擇0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸鎂作初步實驗。2、對于具有較高Tm的引物,增加退火和延伸時的溫度對反應有利。較高的溫度有利于減少非特異的引物結合,因而提高特異產物的得率。3、大多數目標RNA
RTPCR的注意事項
一、防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用lv 仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被lv 仿腐蝕,故不能使用)。3. 有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2
RTPCR技術的操作步驟
1、從RNA(或mRNA)反轉錄合成cDNA第一鏈:2、于95℃加熱5~10min,滅活反轉錄酶,使RNA—cDNA雜交體變性,然后迅速冰浴冷卻:3、PCR擴增:方法基本同PCR。cDNA第一鏈合成方法:20ul反應液中含10xPCR擴增緩沖液,2ul;四種dNTP(10 mmol/L)2ul;RN
Real-time-PCR-跟RTPCR有什么區別
實時熒光定量PCR原理所謂實時熒光定量PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。1.內標在傳統定量中的作用由于傳統定量方法都是終點檢測,即PCR到達平臺期后進行檢測,而PCR經過對數期擴增到達平臺期時,檢測重
RTPCR內參基因選擇:除了βactin還能用什么?
Q1: 要做real-time pcr,而該種的β-actin未確定,我知道一般用持家基因作內參,但似乎其他基因各有缺點,有的作者用他們做內參時被SCI雜志要求用兩個內參以證實,我想知道的是除了β-actin,哪個基因是SCI公認的內參基因(不用作兩個內參了)?A1: 28S和18S rRNA甘油醛
RTPCR里的CT值到底代表什么意思
Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環數。每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值,因此
RTPCR里的CT值到底代表什么意思
Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環數。每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值,因此
RTPCR里的CT值到底代表什么意思
Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環數。每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值,因此
RTPCR里的CT值到底代表什么意思
Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環數。每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值,因此
RTPCR里的CT值到底代表什么意思
Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環數。每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值,因此
rtpcr中沒有溶解曲線的原因是什么
你設置溶解曲線那一步驟了嗎?要是沒設,當然不會起峰。可能由于你的引物根本沒有把目的片段PCR出來,自然也就沒有峰。
RTPCR里的CT值到底代表什么意思
Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環數。每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值,因此