“生物計算”：比超級計算機更聰明、高效、緊湊
上圖 真菌可能與標準電子設備相連。圖片來源：安德魯·阿達馬茨基下圖 實驗室培養的腦細胞可用于計算。圖片來源：托馬斯·哈滕/約翰斯·霍普金斯大學細菌和超級計算機有什么區別？區別是細菌更“高級”，因為它有更多的回路和更強的處理能力。所有生命都在“計算”。從響應化學信號的單個細胞，到在特定環境中航行的復雜生物體，信息處理是生命系統的核心。經過數十年的嘗試，科學家終于開始收集細胞、分子甚至整個生物體，來為人類自己的目的執行計算任務。從本質上講，計算機也只是信息處理器，而且人們越來越認識到大自然擁有豐富的這種能力。最明顯的例子是復雜生物體的神經系統，它能處理來自環境的大量數據并對各種復雜的行為“下指令”。但即使是最小的細胞，也充滿了復雜的生物分子通路，這些通路響應輸入信號，打開和關閉基因、產生化學物質或進行自我組織。最終，生命中所有令人難以置信的壯舉，都依賴于DNA存儲、復制和傳遞遺傳指令的能力。如何構建一臺生物計算機？生物系統有自身的獨......閱讀全文
RNA生物計算機實現復雜邏輯計算
來自美國哈佛大學Wyss研究所、亞利桑那州立大學、哈佛醫學院、麻省理工學院和哈佛-麻省理工Broad研究所的一項最新研究表明，通過向大腸桿菌中添加少量帶有邏輯門的遺傳材料，可控制其信使RNA執行特定的計算，使活細胞能夠經誘導以一種微型機器人或計算機的形式執行計算。相關研究結果發表在2017年8月
“生物計算”：比超級計算機更聰明、高效、緊湊
上圖 真菌可能與標準電子設備相連。圖片來源：安德魯·阿達馬茨基下圖 實驗室培養的腦細胞可用于計算。圖片來源：托馬斯·哈滕/約翰斯·霍普金斯大學細菌和超級計算機有什么區別？區別是細菌更“高級”，因為它有更多的回路和更強的處理能力。所有生命都在“計算”。從響應化學信號的單個細胞，到在特定環境中航行的復雜
“生物計算”：比超級計算機更聰明、高效、緊湊
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502722.shtm ??? ???上圖 真菌可能與標準電子設備相連。圖片來源：安德魯·阿達馬茨基下圖 實驗室培養的腦細胞可用于計算。圖片來源：托馬斯·哈滕/約翰斯·霍普金斯大學細菌和超級
中科院天津工業生物所舉辦生物計算設計溝通會
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499478.shtm
微生物檢驗菌落總數計算方法
7.1菌落總數的計算方法7.1.1若只有一個稀釋度平板上的菌落數在適宜計數范圍內，計算兩個平板菌落數的平均值，再將平均值乘以相應稀釋倍數，作為每 g（mL）樣品中菌落總數結果。7.1.2若有兩個連續稀釋度的平板菌落數在適宜計數范圍內時，按公式（1）計算：（1）式中：N——樣品中菌落數；∑C——平板（
計算生物學所量化生物學平臺正式投入運行
近日，中科院上海生命科學研究院計算生物學研究所量化生物學平臺（Omics Core）正式投入運行。平臺配備有Illumina HiSeq 2000測序系統和相關儀器設備，該測序系統將文庫DNA/cDNA片段附著到特殊處理的光學透明玻璃表面（即Flow cell），并采用可逆終止法邊
哺乳動物細胞“變身”生物計算機
《科學》雜志28日報道，波士頓大學合成生物學家威爾森·黃帶領的團隊提出一種方法，用基因工程方法編輯哺乳動物細胞DNA，從而進行復雜的計算，使這類細胞變成生物計算機。他們希望新的編程技術有助于癌癥治療、按需生長可以替換受損身體部位的組織等。 科學家嘗試將細胞編輯工程從細菌擴展到哺乳動物細胞，創建
之江實驗室開展生物計算國際科學合作
6日，記者從之江實驗室獲悉，由該實驗室主辦的首屆生物計算國際學術會議昨日在杭州舉行。會上，之江實驗室發起并正式啟動生物計算國際合作科學計劃(BioBit Program)，攜手倫敦大學、華盛頓大學、以色列理工學院等國際頂尖科研力量，共同開展生物計算創新探索研究，賦能生命健康、新材料、環境等多領
北京基因組所召開生物計算研討會
10月27日下午，中國科學院北京基因組所組織召開了“北京基因組研究所計算生物學研討會”，會議由所長吳仲義主持，書記楊衛平、副所長李俊雄、基因組所生物信息研究人員以及科技處相關人員參加了會議。 研討會上，與會學者就目前計算生物學領域中涉及如何運用大規模高效的理論模型和數
新生物計算機能并行處理多個復雜信號
近日出版的《自然》雜志刊登了一篇研究論文：美國亞利桑那州立大學教授艾利克斯·格林和哈佛大學維斯生物啟發工程研究所合作，研制出迄今為止最復雜的生物計算機。該計算機由RNA（核糖核酸）制成，能在大腸桿菌活細胞內對12種不同指令同時作出反應，控制細菌細胞的行為。 研究團隊在大腸桿菌的活體細胞內誘導
許錦波當選國際計算生物學學會Fellow
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503301.shtm近日，國際計算生物學學會（ISCB）發布消息，計算生物學家、清華大學智能產業研究院卓越訪問教授許錦波當選ISCB Fellow，當選理由為“通過開創全新計算方式及軟件程序，為蛋白質結構
計算機輔助生物過程設計線上系列講座
現代過程設計理念已廣泛應用于各個工業領域，鑒于生物過程的特殊性和復雜性，利用合適的計算機輔助工具，進行系統的過程開發和評價顯得尤為重要。通過計算機輔助生物過程設計，可以實現：(1) 全流程建模，全局把控流程，促進過程的整體優化，實現資源的科學安排；(2) 合理評價工藝參數，評估新技術，整合原料/設備
NSF斥巨資 計算機助力植物生物學研究
就像谷歌地球能夠讓你從空中放大自己的家一樣，有朝一日，或許只需要點擊幾下鼠標，研究人員便能夠在植物的整個生態系統與分子結構之間任意切換。1月30日，美國國家科學基金會（NSF）向5家研究機構提供了5000萬美元的資金，這些錢將用于研制那些聯系和分析多領域數據的軟件和硬件，旨在實現解答有關植物復雜問題
馬斯克發文稱生物計算正在快速發展，值得追蹤！
北京時間8月3日消息，特斯拉CEO埃隆·馬斯克在推特表示，數字計算與生物計算的比例正在快速增長，值得跟進。生物計算是生物學的一個分支，指運用計算機技術來研究生物學、行為學和社會群體系統。通過生物計算，科學家有望破譯在核酸序列中的遺傳語言規律，模擬生命體內的信息流過程，掌握蛋白質折疊規律等。由此看來，
三公司分享2000萬美元生物云計算項目
2014年9月24日，美國癌癥研究中心（NCI）在美國聯邦政府商務機會網站（Federal Business Opportunities）上發出公告，其于今年1月發起的癌癥基因組云計算平臺試驗項目花落The Broad Institute，Institute for Systems Biolog
生物學,崛起的下一代計算平臺
Synhego公司距離Facebook總部僅五分鐘車程，從外觀來看，它和硅谷的其他創業公司并無差異，但是在它米色的辦公園區里，一模一樣的黑色服務器機架整齊地排列著，燈光閃爍，發出呼呼的排氣聲，然而這些金屬架子里并沒有零件在驅動網絡的運行。這些機器正在利用分子改寫生代碼。 Crispr是一種
奇拉實驗室在計算生物學所成立
王學才和Kirstin Augsburg共同為實驗室揭牌 9月16日上午，奇拉實驗室在上海生命科學研究院計算生物學所內正式掛牌成立。計算生物學所執行所長金力、黨總支書記兼副所長王學才、德國駐滬總領事館文化事務與新聞領事Kirstin Augsburg、領事Fredric Jor
外標法計算怎么計算
RF應該是校正值.外標法的公式應該是：含量（cx）=cr*Ax/Ar其中：cx為樣品濃度；cr為對照濃度；Ax為樣品峰面積；Ar為對照峰面積。外標法是與內標法相對，指添加一定量的標準品（對照 品）于空白檢材中制成對照樣品，與未知檢材平行地進行樣品處理并檢測，根據對照樣 品響應值與其中所添加標準品（對
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計算生物學研究所“蛋白建模”學習班舉辦
Juergen Schlitter教授講課中 6月7日至11日，中科院上海生命科學研究院計算生物學研究所、中科院計算生物學重點實驗室舉辦了為期一周的“Protein Modeling” 學習班。學習班面向生科院各所研究生開放，來自全院的多名研究生參加了學習培訓。 學習班由
水溶液提取法測定氟生物（植物）測定質量結果計算
結果計算?W=c×r/(1-f)質量控制和質量保證(1)采用風干土提取時需測定土壤含水量。具體做法是:稱1.00g風干土在烘箱中(105±2)℃下烘干8h后,將樣品取出置于恒溫干燥器中1h后稱重,然后,將樣品重新放回烘箱中(105±2)℃下再烘干1h,干燥,稱重,重復上述過程,直至恒重(恒重的標準為
新工具可計算生物醫學論文可重復性得分
科學界正在尋找新工具衡量已發表研究成果的可再現性，因為人們擔心許多研究無法獨立再現。 圖片來源：National Eye Institute, National Institutes of Health 1月19日公布的一個新的在線工具可通過分析已發表論文的引文數量，衡量該論文可再
臨床生物化學實驗室中計算機的應用
微處理機在臨床生物化學實驗室全面管理中的作用及其進展已有專著介紹。這里僅就有關實驗數據的處理與報告方面的應用作一概括性的提示。 應用計算機系統處理實驗數據并打印報告等具有多方面的應用，如通過編定的程序，可從大量實驗數據中篩選出最有價值的數據，以提供參比；也可將原始數據進行分析、加工，做出更高層次的