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  • 科學家繪制小細胞肺癌蛋白基因組學圖譜

    肺癌是全球癌癥致死的首位原因,而小細胞肺癌約占肺癌總數的15%,是所有肺癌亞型中惡性程度最高、預后最差的亞型,5年生存率僅為5%。與非小細胞肺癌形成鮮明對比,小細胞肺癌的治療手段單一,患者總生存率低。分子表征與組學研究不足,限制了小細胞肺癌的基礎研究和臨床進展,迄今為止,僅有少量針對小細胞肺癌臨床樣本的基因組研究被報道。小細胞肺癌普遍存在TP53和RB1的失活突變。缺乏驅動突變使得研究難以通過基因突變信息獲得有效靶點和分子分型。蛋白質作為生命功能的執行者,是95%以上藥物的作用靶點。目前,缺乏從蛋白質組層面對小細胞肺癌的系統研究,因此全面系統地表征小細胞肺癌的蛋白質組學圖譜,利于剖析小細胞肺癌的病理機制,對于實現更精準的小細胞肺癌分子分型和個性化治療具有重要意義。 1月5日,《細胞》(Cell)在線發表了中國科學院上海藥物研究所研究員周虎團隊,與同濟大學附屬上海市肺科醫院教授張鵬團隊、中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究......閱讀全文

    與肺癌相關的KRAS基因編碼功能描述

    KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog)基因是GDP/GTP結合蛋白,比較重要的同家族基因還包括HRAS和NRAS。KRAS與GTP結合呈激活狀態,與GDP結合呈關閉狀態,KRAS可被生長因子或酪氨酸激酶(如EGFR)短暫活化,活化后的KRA

    與肺癌相關的RICTOR基因編碼功能描述

    Rictor和Mtor(frap1;mim 601231)是一種蛋白質復合物的組成部分,該復合物整合了營養和生長因子衍生的信號來調節細胞生長(Sarbassov等人,2004[PubMed 15268862])。RICTOR and MTOR (FRAP1; MIM 601231) are comp

    與肺癌相關的ARAF基因編碼功能描述

    絲氨酸/蘇氨酸 - 蛋白激酶A-Raf或簡稱A-Raf是人類中由ARAF基因編碼的酶。[5] A-Raf是絲氨酸/蘇氨酸特異性蛋白激酶的Raf激酶家族的成員。 與該家族的其他成員(Raf-1和B-Raf)相比,對A-Raf知之甚少。它似乎具有其他同種型的許多特性,但其生物學功能尚未得到徹底研究。所有

    與肺癌相關的AREG基因編碼功能描述

    這個基因編碼的蛋白質是表皮生長因子家族的一員。它是一種自分泌生長因子,也是星形細胞、雪旺細胞和成纖維細胞的有絲分裂原。與表皮生長因子(egf)和轉化生長因子α(tgfα)有關。該蛋白與EGF/TGFα受體相互作用,促進正常上皮細胞的生長,抑制某些侵襲性癌細胞系的生長。在乳腺、卵母細胞和骨組織發育中也

    與肺癌相關的KLLN基因編碼功能描述

    這種無內含子基因編碼的蛋白質存在于細胞核中,在那里它可以抑制DNA合成,促進S相停滯,并與凋亡相結合。這種DNA結合蛋白的表達被轉錄因子p53上調。The protein encoded by this intronless gene is found in the nucleus, where i

    與肺癌相關的KIT基因編碼功能描述

    KIT基因編碼的蛋白是干細胞因子受體SCFR,也被稱為原癌基因c-kit或酪氨酸蛋白激酶kit或CD117,是一種受體酪氨酸激酶,這個基因突變與胃腸道間質瘤,肥大細胞病,急性髓性白血病有關。

    與肺癌相關的CRKL基因編碼功能描述

    該基因編碼一個包含sh2和sh3(SRC同源)結構域的蛋白激酶,該結構域已被證明激活ras和jun激酶信號通路并以ras依賴的方式轉化成纖維細胞。是bcr-abl酪氨酸激酶的底物,在bcr-abl的成纖維細胞轉化中起作用,可能致癌。This gene encodes a protein kinase

    與肺癌相關的PDGFRA基因編碼功能描述

    PDGFRA基因編碼的蛋白全名為血小板源性生長因子受體α,是一種細胞表面受體酪氨酸激酶,PDGFRA可以與其相應的配體PDGF結合后活化,再激活磷脂酰肌醇、cAMP及多種蛋白質的磷酸化途徑,調控細胞的分裂和增殖,當基因激活異常時,則會導致腫瘤的發生并促進腫瘤血管生成,PDGFRA的突變與胃腸道間質瘤

    與肺癌相關的HRAS基因編碼功能描述

    HRAS編碼的HRAS蛋白為GTP酶,HRas是一種小的G蛋白,屬于小GTP酶超家族,當HRas與鳥苷三磷酸結合后,會結合Raf激酶比如c-Raf,再進一步激活MAPK/ERK通路。這個基因的突變與多種癌癥相關,包括膀胱癌,濾泡狀甲狀腺癌,口腔鱗狀細胞癌。

    與肺癌相關的EGFR基因編碼功能描述

    EGFR編碼的蛋白是一種跨膜糖蛋白,也是表皮生長因子受體家族中的一員,該家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也屬于受體酪氨酸激酶家族。EGFR作為細胞表面蛋白可與配體如表皮生長因子(EGF)結合,EGFR可被激活,

    完全“抑制劑”癌基因-降低肺癌發生

      肺癌是所有腫瘤病癥中致死率最高的惡魔。日前,從中科院昆明動物研究所傳來了好消息,該所腫瘤干細胞生物學學科組已成功揭示癌基因維持肺癌的發生機制。該成果已在線發表于國際期刊《治療診斷學》。  據介紹,HUWE1基因是一種泛素化連接酶,它可通過調節底物的穩定性,控制著細胞內大量與腫瘤發生密切相關的生物

    新型基因檢測有助判斷肺癌患者死亡風險

    新一期英國醫學刊物《柳葉刀》刊登報告說,美國研究人員開發出了一套基因檢測方法,能夠大致判斷肺癌患者的死亡風險高低,在甄別出死亡風險較高的患者后,可以采取額外的化療等手段來幫助治療。美國加利福尼亞大學等機構的研究人員報告說,他們對300多名非小細胞肺癌患者的病情和基因信息進行了分析,發現患者體內14個

    與肺癌相關的BCOR基因編碼功能描述

    該基因編碼的蛋白被鑒定為bcl6的相互作用共壓子,bcl6是一種POZ/鋅指轉錄抑制因子,是生發中心形成所必需的,可能影響細胞凋亡。這種蛋白選擇性地與bcl6的poz結構域相互作用,但不與其他8種poz蛋白相互作用。特定的I類和II類組蛋白脫乙酰基酶(hdacs)與這種蛋白相互作用,這表明這兩類hd

    與肺癌相關的PTEN基因編碼功能描述

    PTEN基因編碼的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂質磷酸酶活性,是第一個具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是繼p53和Rb基因之后,與腫瘤發生密切相關的一種抑癌基因,其主要機制因為PTEN是PI3K/Akt通路的主要負調控因子。PTEN的功能缺陷在人類多種腫瘤中廣泛存在。

    與肺癌相關的SMO基因編碼功能描述

    Hedgehog(Hh)信號通過兩個跨膜蛋白Patched(Ptc)和Smoothened(Smo)介導,在無Hedgehog的情況下,Ptc抑制Smo。當Hedgehog與Ptc結合時,則解除了Ptc對Smo的抑制作用,激活的Smo可導致下游靶基因的活化。Smo或者Hh基因突變或表達異常均可導致細

    與肺癌相關的MTHFR基因編碼功能描述

    該基因編碼的蛋白質催化5,10-亞甲基四氫葉酸轉化為5-甲基四氫葉酸酯,這是同型半胱氨酸再甲基化為蛋氨酸的共基質。該基因的遺傳變異影響對閉塞性血管病、神經管缺陷、結腸癌和急性白血病的易感性,該基因的突變與亞甲基四氫葉酸還原酶缺乏有關。The protein encoded by this gene

    與肺癌相關的PTEN基因編碼功能描述

    PTEN基因編碼的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂質磷酸酶活性,是第一個具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是繼p53和Rb基因之后,與腫瘤發生密切相關的一種抑癌基因,其主要機制因為PTEN是PI3K/Akt通路的主要負調控因子。PTEN的功能缺陷在人類多種腫瘤中廣泛存在。

    與肺癌相關的RICTOR基因編碼功能描述

    Rictor和Mtor(frap1;mim 601231)是一種蛋白質復合物的組成部分,該復合物整合了營養和生長因子衍生的信號來調節細胞生長(Sarbassov等人,2004[PubMed 15268862])。RICTOR and MTOR (FRAP1; MIM 601231) are comp

    與肺癌相關的GNAS基因編碼功能描述

    GNAS作為一個重要的信號轉導蛋白,主要功能是在G蛋白偶聯受體信號轉導途徑中,激活腺苷酸環化酶,導致cAMP水平的升高,參與調控細胞生長和細胞分裂。

    與肺癌相關的NRAS基因編碼功能描述

    NRAS基因是GDP/GTP結合蛋白,比較重要的同家族基因還包括KRAS和HRAS。NRAS與GTP結合呈激活狀態,與GDP結合呈關閉狀態,該基因的突變與黑色素瘤密切相關,機制為該基因的突變導致其下游基因的如Raf激酶的異常持續激活。

    與肺癌相關的PTPRF基因編碼功能描述

    該基因編碼的蛋白是蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的成員。眾所周知,PTP是調節多種細胞過程的信號分子,包括細胞生長、分化、有絲分裂周期和致癌轉化。該PTP具有一個細胞外區、一個跨膜區和兩個串聯胞質內催化域,因此代表一種受體型PTP。細胞外區包含3個免疫球蛋白樣結構域,9個非免疫球蛋白樣結構域與神經細

    與肺癌相關的RET基因編碼功能描述

    RET蛋白是一種受體酪氨酸激酶,可以激活下游多種信號途徑,如RAS、PI3K及STAT等,誘導細胞增生。RET常以本身斷裂再與另一基因融合,重組成一新基因,具備自我磷酸化且持續激活,KIF5B-RET、CCDC6-RET、TRIM33-RET和NCOA4-RET是非小細胞肺癌中已發現的RET融合基因

    與肺癌相關的MYC基因編碼功能描述

    該基因編碼的蛋白質是一種多功能的核磷蛋白,在細胞周期進展、凋亡和細胞轉化中起到作用。作為調節特定靶基因轉錄的轉錄因子發揮作用。這種基因的突變、過度表達、重排和易位與多種造血腫瘤、白血病和淋巴瘤,包括伯基特淋巴瘤有關。有證據表明,來自上游、非aug(cug)幀和下游aug起始位點的選擇性翻譯起始導致兩

    與肺癌相關的ATM基因編碼功能描述

    ATM基因編碼的蛋白屬于PI3/PI4激酶家族,這種蛋白是一種重要的細胞周期檢查點激酶,通過磷酸化調控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、檢查點激酶CHK2、檢查點蛋白RAD17和RAD9以及DNA修復蛋白NBS1。ATM和與其密切相關的蛋白ATR被認為是在細胞周期調控以及DNA損傷

    與肺癌相關的RHOA基因編碼功能描述

    這個基因編碼一個小GTP酶的rho家族成員,在非活性GDP結合態和活性GTP結合態之間循環,在信號轉導級聯中起分子開關的作用。rho蛋白促進肌動蛋白細胞骨架的重組并調節細胞的形狀、附著和運動。該基因的過度表達與腫瘤細胞增殖和轉移有關。已識別出多個可選拼接變體。This gene encodes a

    與肺癌相關的AURKA基因編碼功能描述

    該基因編碼的蛋白是一種細胞周期調節激酶,在染色體分離過程中似乎與紡錘體極的微管形成和/或穩定有關。編碼蛋白存在于有絲分裂的間期細胞的中心體和紡錘體兩極。該基因可能在腫瘤的發展和進展中起作用。在1號染色體上發現一個經過加工的假基因,在10號染色體上發現一個未經加工的假基因。已發現該基因的多個編碼相同蛋

    與肺癌相關的BRAF基因編碼功能描述

    該基因編碼蛋白屬于raf/mil家族的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,參與調控MAP/ERKs信號通路,在細胞分裂、分化和分泌起重要作用。BRAF基因的突變與各種癌癥相關,包括非霍奇金淋巴瘤,結直腸癌,惡性黑色素瘤,甲狀腺癌,非小細胞肺癌,肺腺癌。

    與肺癌相關的TYMS基因編碼功能描述

    胸苷酸合成酶利用5,10-亞甲基四氫葉酸(亞甲基四氫葉酸)作為輔因子催化脫氧尿苷酸甲基化為脫氧胸苷酸。此功能維持DNA復制和修復的關鍵DTMP(胸腺嘧啶-5-一磷酸素)池。這種酶作為腫瘤化療藥物的靶點一直備受關注。它被認為是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脫氧尿苷和一些葉酸類似物的主要作用部位。該

    與肺癌相關的ALK基因編碼功能描述

    ALK基因編碼一種受體酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK),為跨膜蛋白,屬于胰島素受體超家族,在大腦發育與及特定的神經元中起重要作用。最初在間變性大細胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma, ALCL)發現ALK-NPM1融合蛋白,目

    與肺癌相關的AR基因編碼功能描述

    雄激素受體(AR),也稱為NR3C4(核受體亞家族3,C組,成員4),是一種核受體,通過結合任何雄激素激活,包括睪酮和二氫睪酮在細胞質中,然后易位到細胞核。 雄激素受體與孕酮受體的關系最為密切,較高劑量的孕激素可以阻斷雄激素受體。 雄激素受體的主要功能是作為調節基因表達的DNA結合轉錄因子; 然而,

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