科學家揭示II型拓撲異構酶捕獲轉運片段DNA的關鍵結構
II型DNA拓撲異構酶通過暫時切斷“門片段DNA”(G-DNA),使另一條雙鏈DNA(T-DNA)通過,從而解決復制、轉錄及染色體分離過程中產生的超螺旋與纏結問題,是維持染色體拓撲穩定性不可或缺的酶類。此前研究已部分解析了與G-DNA結合的II型拓撲異構酶結構,但對于T-DNA被酶捕獲和轉運這一關鍵步驟,長期缺乏直接的結構證據。 日前,中國科學院生物物理研究所研究團隊,解析了II型DNA拓撲異構酶直接結合轉運片段DNA(T-DNA)的冷凍電鏡結構。研究團隊以T4噬菌體II型拓撲異構酶作為研究對象,揭示了這一類酶在催化反應循環中長期缺失的中間結構狀態,對學界理解其完整工作機制具有重要意義。團隊通過冷凍電鏡技術解析了溶液條件下,T-DNA被穩定捕獲于II型拓撲異構酶中央腔室的三維結構(分辨率約3?)。研究顯示,該構象與傳統的G-DNA結合構象明顯不同,它更接近酶的apo狀態。同時,在電子密度圖中可觀察到松散結合的G-......閱讀全文
拓撲異構酶的分類
可分為兩類一類叫拓撲異構酶I,一類叫拓撲異構酶II。拓撲異構酶I催化DNA鏈的斷裂和重新連接,每次只作用于一條鏈,即催化瞬時的單鏈的斷裂和連接,它們不需要能量輔因子如ATP或NAD。E.coliDNA拓撲異構酶I又稱ω蛋白,大白鼠肝DNA拓撲異構酶I又稱切刻-封閉酶(nicking-closin
拓撲異構酶的簡介
DNA拓撲異構酶是存在于細胞核內的一類酶,他們能夠催化DNA鏈的斷裂和結合,從而控制DNA的拓撲狀態,拓撲異構酶參與了超螺旋結構模板的調節。哺乳動物中主要存在兩種拓撲異構酶。DNA拓撲異構酶I通過形成短暫的單鏈裂解-結合循環,催化DNA復制的拓撲異構狀態的變化;相反,拓撲異構酶II通過引起瞬間雙
拓撲異構酶的用途
DNA的結構轉換和解析 Ⅱ型拓撲異構酶 Ⅱ型拓撲異構酶巧妙地執行了打開DNA雙螺旋的過程。它將DNA的一個雙螺旋結構切開,并讓另一個螺旋從缺口處穿過,在此之后一個雙螺旋便被打開。這里顯示的圖片是由兩個蛋白構建的:這個編號為1bgw的蛋白具有拓撲異構酶的下半部分結構,另外一個編號為1eil的蛋
拓撲異構酶的臨床應用
這些藥物包括阿霉素(adriamycin)、放線霉素D(actinomycinD)、道諾梅素(daunomycin)、VP-16、VM-26(替尼泊苷teniposide或者表鬼臼毒素(epipodophyllotoxin)。相對來說,無論是臨床,還是處在試驗階段的,作為哺乳動物異構酶II型毒素
拓撲異構酶的用途介紹
DNA的結構轉換和解析 Ⅱ型拓撲異構酶巧妙地執行了打開DNA雙螺旋的過程。它將DNA的一個雙螺旋結構切開,并讓另一個螺旋從缺口處穿過,在此之后一個雙螺旋便被打開。由兩個蛋白構建的:這個編號為1bgw的蛋白具有拓撲異構酶的下半部分結構,另外一個編號為1eil的蛋白來自于一個旋轉酶的結構域,它與拓
概述拓撲異構酶的分類
可分為兩類一類叫拓撲異構酶I,一類叫拓撲異構酶II。拓撲異構酶I催化DNA鏈的斷裂和重新連接,每次只作用于一條鏈,即催化瞬時的單鏈的斷裂和連接,它們不需要能量輔因子如ATP或NAD。E.coliDNA拓撲異構酶I又稱ω蛋白,大白鼠肝DNA拓撲異構酶I又稱切刻-封閉酶(nicking-closin
細胞化學詞匯拓撲異構體
中文名稱:拓撲異構體外文名稱:topological isomer定???????義:拓撲異構體是除鏈環數(linking number)不同外其他性質均相同的DNA分子,可以通過凝膠電泳檢測來觀察。
簡述拓撲異構酶的作用
是使超級螺旋松弛。所謂超級螺旋是DNA中張力積聚的形式。拓撲異構酶抑制成分是重要抗腫瘤藥物,被認為通過穩定拓撲異構酶與DNA之間所形成的一種共價復合物來發揮作用,后者又為DNA復制機制設置了一障礙。科學家對以拓撲異構酶為作用目標的藥物的藥效起源仍不是很了解。由于該藥物的作用而造成的正向DNA超級
DNA拓撲異構酶的功能介紹
中文名DNA拓撲異構酶外文名DNA topoisomerase性????質生物類????別酶功????能實現DNA超螺旋的轉型定義DNA拓撲異構酶為催化DNA拓撲學異構體相互轉變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結合的偶聯反應,為了分析體外反應機制,用環狀DNA為底物。
DNA拓撲異構酶的相關介紹
DNA拓撲異構酶能催化的反應很多,這里只能作簡單敘述。DNA拓撲異構酶I對單鏈DNA的親和力要比雙鏈高得多,這正是它識別負超螺旋DNA的分子基礎,因為負超螺旋DNA常常會有一定程度的單鏈區。負超螺旋越高,DNA拓撲異構酶I作用越快。現已知道,生物體內負超螺旋穩定在5%左右,低了不行,高了也不行。
Ⅰ型DNA拓撲異構酶的功能介紹
中文名稱Ⅰ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅠ定 義編號:EC 5.99.1.2。在雙鏈結構中使其中一條鏈暫時斷裂,斷裂時不依賴于ATP,負責使超螺旋松弛的酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
拓撲異構酶的基本信息介紹
DNA拓撲異構酶是存在于細胞核內的一類酶,他們能夠催化DNA鏈的斷裂和結合,從而控制DNA的拓撲狀態,拓撲異構酶參與了超螺旋結構模板的調節。哺乳動物中主要存在兩種拓撲異構酶。DNA拓撲異構酶I通過形成短暫的單鏈裂解-結合循環,催化DNA復制的拓撲異構狀態的變化;相反,拓撲異構酶II通過引起瞬間雙
Ⅱ型DNA拓撲異構酶的功能介紹
中文名稱Ⅱ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅡ定 義編號:EC 5.99.1.3。使雙鏈結構的兩條鏈均暫時斷裂,斷裂時依賴于ATP,是將松弛、閉環DNA轉變為超螺旋形式的酶。包括DNA促旋酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
DNA拓撲異構酶的基本信息
DNA拓撲異構酶為催化DNA拓撲學異構體相互轉變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結合的偶聯反應,為了分析體外反應機制,用環狀DNA為底物。
Ⅱ型DNA拓撲異構酶的基本信息
中文名稱Ⅱ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅡ定 義編號:EC 5.99.1.3。使雙鏈結構的兩條鏈均暫時斷裂,斷裂時依賴于ATP,是將松弛、閉環DNA轉變為超螺旋形式的酶。包括DNA促旋酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
DNA拓撲異構酶的基本信息介紹
在閉環狀雙鏈DNA的拓撲學轉變中,要暫時的將DNA的一個鏈或兩個鏈切斷,根據異構體化的方式而分為二個型。切斷一個鏈而改變拓撲結構的稱為Ⅰ型拓撲異構酶(top -oisomeraseⅠ),通過切斷二個鏈來進行的稱為Ⅱ型拓撲異構酶(topoisomeraseⅡ)。屬于Ⅰ型的拓撲異構酶,有大腸桿菌的ω
Ⅰ型DNA拓撲異構酶的基本信息
中文名稱Ⅰ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅠ定 義編號:EC 5.99.1.2。在雙鏈結構中使其中一條鏈暫時斷裂,斷裂時不依賴于ATP,負責使超螺旋松弛的酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
DNA拓撲異構酶(DNA-topoisomerase)的相關介紹
為催化DNA拓撲學異構體相互轉變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結合的偶聯反應,為了分析體外反應機制,用環狀DNA為底物。在閉環狀雙鏈DNA的拓撲學轉變中,要暫時的將DNA的一個鏈或兩個鏈切斷,根據異構體化的方式而分為二個型。切斷一個鏈而改變拓撲結構的稱為Ⅰ型拓撲異構酶(top -oisomera
大腸桿菌的拓撲異構酶的相關介紹
大腸桿菌的拓撲異構酶II(gyrase)除了引入負超螺旋以外.還具有形成或拆開雙鏈DNA環連體和成結分子的能力。II類拓撲異構酶沒有堿基序列特異性,它們可以和任何相交的兩對雙鏈DNA結合。DNA旋轉酶有兩個α亞基和兩個β亞基。α亞基約105KDa,為gyrA基因所編碼,具有磷酸二脂酶活性,可為萘
DNA拓撲異構酶催化反應的相關介紹
很多,其反應本質是先切斷DNA的磷酸二脂鍵,改變DNA的鏈環數之后再連接之,兼具DNA內切酶和DNA連接酶的功能.然而它們并不能連接事先已經存在的斷裂DNA,也就是說,其斷裂反應與連接反應是相互耦聯的。拓撲異構酶(包括Ⅰ型和II型)都可以用符號轉化模型進行解釋 除了DNA拓撲異構酶可以產生異構
可以DNA結合的酶拓撲異構酶和解旋酶
拓撲異構酶和解旋酶: 拓撲異構酶是具有活性核酸酶和連接酶的酶。這些酶能夠改變DNA的拓撲特性。它們中的一些通過切割DNA螺旋并允許其旋轉,降低其超螺旋程度,然后通過連接酶將兩端連接。另一方面,其它拓撲異構酶能夠在連接斷裂的DNA鏈之前,切斷螺旋,并允許第二個螺旋通過斷裂部位。拓撲異構酶是許多涉及DN
抗癌藥物對ⅡDNA拓撲異構酶作用的實驗
實驗方法原理DNA拓撲異構酶在DNA形成環狀和超螺旋結構中起重要作用。另一方面在DNA超螺旋結構的松懈、DNA單、雙鏈的斷裂以至再連接的過程均有賴于該酶的參與,從而使DNA的復制或重組成為可能,關于抗癌藥如烴化劑和非烴化劑,其中許多是以DNA拓撲異構酶為靶點使之形成可斷裂的DNA蛋白復合物從而引起D
抗癌藥物對ⅡDNA拓撲異構酶作用的實驗
實驗方法原理 DNA拓撲異構酶在DNA形成環狀和超螺旋結構中起重要作用。另一方面在DNA超螺旋結構的松懈、DNA單、雙鏈的斷裂以至再連接的過程均有賴于該酶的參與,從而使DNA的復制或重組成為可能,關于抗癌藥如烴化劑和非烴化劑,其中許多是以DNA拓撲異構酶為靶點使之形成可斷裂的DNA蛋白復合物從而引起
首張拓撲異構酶II全基因組剪切圖譜
DNA切割酶對基因結構調節起著關鍵作用。研究人員發現,它在導致癌癥的(如白血病和實體瘤)易位(translocations)異常重排中表現活躍。 II型拓撲異構酶(type II topoisomerase, TOP2)通過斷裂DNA雙鏈磷酸二酯鍵,來更正DNA連環數,使細胞DNA正常轉錄、復
武漢植物園篩選出天然拓撲異構酶抑制劑
全球癌癥發病率和死亡率上升,對公共衛生構成挑戰。手術、放療和化療是當前治療癌癥的三種主要方法。然而,這些方法會帶來副作用,且在臨床病例中療效不佳,成為亟待解決的問題。DNA拓撲異構酶(Topos)是DNA復制的關鍵酶,在細胞轉錄、重組和修復中發揮重要作用,是一些抗癌藥物的靶酶,目前已有針對DNA
DNA螺旋與拓撲異構酶相互作用的新發現
一個荷蘭人領導的國際性研究組在分子水平上破解了自然釋放DNA中積累起來的扭曲張力的機制。來自Delft理工大學、Ecole Normale Superieure和Sloan-Kettering研究所的研究人員將他們的發現公布在3月31日的《自然》雜志上,并成為這一期雜志的封面。 IB型拓撲異構
非洲豬瘟病毒DNA拓撲異構酶催化機制研究獲新進展
中國科學院生物物理研究所饒子和院士研究組首次闡明非洲豬瘟病毒編碼的全長II型DNA拓撲異構酶的基本機制,為減輕非洲豬瘟病毒的影響提供了潛在的干預策略。相關論文于5月30日發表在《自然-通訊》。非洲豬瘟是一種威脅全球養豬業的急性、烈性傳染病,至今仍缺少安全有效的上市疫苗與藥物。非洲豬瘟病毒是唯一一種編
非洲豬瘟病毒DNA拓撲異構酶催化機制研究獲新進展
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解析DNA拓撲異構酶核心結構揭示DNA穿鏈新機制
生物物理所解析DNA拓撲異構酶核心結構揭示DNA穿鏈新機制成果入選Faculty of 1000 BiologyGyrase B’三維結構(左)及結構域運動(右) 近日,中科院生物物理研究所王大成課題組與畢利軍課題組合作在Nucleic Acids Research雜志上發表的題為
上海藥物所新型拓撲異構酶抑制劑研究取得新進展
桔霉素三聚體Tricitrinol B結構 拓撲異構酶II(Topo II)抑制劑是一類重要的抗腫瘤藥物。目前臨床上使用的Topo II抑制劑存在著毒副作用大、易產生耐藥性的缺點,而新型Topo II抑制劑的研發因化合物結構類型的局限進展緩慢。極端環境中的微生物因其獨特的結構和生理