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  • 發布時間:2022-07-04 16:40 原文鏈接: 僅一個堿基,改變大豆多樣性

    福建農林大學教授廖紅/陳志長團隊發現并證實位于基因5’UTR開放閱讀框(uORF)的一個堿基變異導致了大豆群體磷吸收效率水平的多樣性。7月1日,相關研究成果以《uORF的自然變異導致大豆磷吸收效率的多樣性》為題,發表在《自然—通訊》上。

    該研究利用前期收集的大豆磷效率應用核心種質資源,開展了全基因組重測序獲得了高密度的分子標記;并開展了田間表型鑒定,獲取了磷效率相關的表型指標。他們發現在20號染色體上出現了一個新的顯著關聯位點。研究者推斷該位點不影響根長,是通過影響根的吸收效率從而影響磷的吸收量。為了確定該基因的功能,分別構建了大豆RNAi和超表達穩轉材料,并進行磷效率表型分析,結果顯示該基因影響根的磷吸收效率而不影響總根長;進一步證實了該基因在磷吸收方面的功能。

    在研究中,他們解答了各種問題,如位于細胞內質網的蛋白是如何影響根從土壤中吸收磷?GmPHF1(SEC12-like蛋白的編碼基因)的功能變異位點在哪里?最終引起變異的是基因5’UTR中哪一個單核苷酸多態性(SNP),還是兩個SNPs同時發揮作用?SNP影響下游GmPHF1的翻譯是否依賴uORF?最終,該研究鑒定到一個uORF的自然變異,該變異影響下游GmPHF1的蛋白含量和空間分布,從而影響磷轉運蛋白GmPT4從內質網向細胞膜的轉移,最終形成大豆群體磷吸收效率的差異。

    據悉,福建農林大學副教授郭子龍和博士生曹紅瑞為本文共同第一作者,廖紅和陳志長為共同通訊作者。

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