BMC evolutionary biology雜志10月27日在線發表了中國科學院水生生物研究所原生動物功能基因組學學科組博士生熊杰完成的題為Genome-wide identification and evolution of ATP-binding cassette transporters in the ciliate Tetrahymena thermophila: A case of functional divergence in a multigene family的論文(http://www.biomedcentral.com/1471-2148/10/330)。
該研究鑒定得到了165個四膜蟲ATP結合盒轉運蛋白基因,是目前已報道的含該類基因最多的真核生物;對這些基因進行系統發育和保守內含子分析、以及與同為纖毛蟲的草履蟲進行比較,發現眾多的四膜蟲ATP結合盒轉運蛋白是在四膜蟲與草履蟲分化后通過基因復制擴張產生的(約800 Mya);進一步對它們的基因表達譜和表達進化模式的分析表明,部分四膜蟲ATP結合盒轉運蛋白基因在發生基因復制后其表達和功能也發生了分歧,同時這些基因在基因組中保留下來的模式則更多地符合新功能化和劑量平衡的模型。
此項研究是該學科組繼去年完成四膜蟲細胞色素P450基因家族分子進化工作(BMC genomics)之后,對四膜蟲中與環境感知和響應相關的多基因家族進化模式和功能演化分析的新進展,進一步驗證了他們提出的四膜蟲是研究該類多基因家族分子進化良好真核生物的觀點。
該研究得到了國家自然科學基金項目和中科院知識創新重要方向性項目的資助。
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