Nature子刊：最大規模的全基因組肺癌易感性研究

　　在一項由多國研究人員組成的國際研究組項目中，研究人員利用OncoArray基因分型平臺，完成了最大規模的全基因組肺癌易感性研究，從中發現了一些新的癌癥易感位點。這一研究成果公布在6月12日的Nature Genetics雜志上。

　　肺癌是全世界發病率和死亡率最高的癌癥之一。每年有超過500萬例新發肺癌病例，其中85%屬于非小細胞肺癌。這種類型的肺癌主要是由兩個亞型代表：肺腺癌和肺鱗狀細胞癌。它們可能起源于不同的環境因素或生物過程，但吸煙并不總是主要原因，研究證明肺癌的遺傳率約為18％。之前的全基因組關聯研究發現了幾種肺癌易感基因座，但其中大部分的遺傳性仍然無法解釋。這項最新研究重新分析了肺癌病例和對照組的基因分型。

　　這項研究由Norris Cotton癌癥中心的Christopher Amos博士，國際癌癥研究機構的James McKay博士，以及多倫多大學的Rayjean Hung博士領導完成。涉及樣品包括14,803個肺癌樣品和12262個已有數據的歐洲人對照樣品，總共有29266個樣品和56,450個對照。

　　從中研究人員確定了18個具有全基因組意義的易感基因位點，其中有10個是之前從未發現過的。這些新的基因位點凸顯了肺癌亞型：肺腺癌和肺鱗狀細胞癌易感模式的顯著變化——4個與整體肺癌相關，6個位點與肺腺癌相關。研究人員也發現了與端粒功能相關的幾個基因，它們在肺腺癌易感風險中扮演了重要的角色，但是對肺鱗狀細胞癌易感風險并無顯著影響。

　　Amos表示：“這項研究中最令人興奮的是影響肺癌的新基因發現。研究為分析肺癌患病風險提供了新的見解，而且特別重要的是我們發現了幾個影響端粒功能的新突變，也會影響肺腺癌易感風險。同時我們也發現了煙堿受基的一種亞基周圍出現了突變，這種亞基能影響肺癌患病風險，吸煙習慣，而且似乎在小腦中起重要作用，后者很少涉及成癮行為的影響。”

　　未來通過進一步的研究將更好地了解靶基因在影響肺癌風險，吸煙行為和吸煙對腦生物學影響方面的作用。

　　除此之外，近期Nature Genetics雜志也在肺癌細胞中發現了一些新的驅動突變（driver mutations），可能用于基因靶向治療和免疫治療。

　　研究人員檢查了來自于兩種最常見肺癌類型的1144個基因組分析譜：肺腺癌和肺鱗狀細胞癌。這項研究的高度統計顯著性，可讓研究人員能夠識別影響幾個蛋白質（負責細胞中的信號）的新型驅動突變。在這項研究中，科學家使用統計方法，來區分驅動突變和所謂的過客突變（passenger mutations），這些突變發生在癌癥的發展過程中，但不會引發腫瘤生長。

　　總的來說，科學家們在肺腺癌中發現了38個顯著突變的基因，在肺鱗狀細胞癌中發現了20個突變的基因。然而，只有6個突變基因在這兩種類型腫瘤之間是共享的，從而表明，盡管這兩種類型腫瘤出現在相同的器官，但是它們相互之間的區別很明顯。所確定的基因組突變與其他19種癌癥類型對比發現，與肺腺癌相比，肺鱗狀細胞癌更類似于頭頸部腫瘤和一小部分膀胱癌。

　　另外，這項研究在大多數的肺癌病例中，還確定了幾個預測的新表位（neoepitopes）——可能被免疫系統識別的蛋白質片段，并作為標記來識別和對抗癌癥。因此，47%的肺腺癌和53%的肺鱗狀細胞癌樣本具有至少5個預測的neoepitopes，從而指出了一種免疫療法——這種類型的治療旨在利用病人自身的免疫系統。