AP/MALDI 不涉及真空操作，性能及成像媲美真空 MALDI，為最具性價比的質譜成像系統。
1. 何為“質譜成像”或“成像質譜”？
成像質譜(IMS)為非常靈敏的分子成像技術，提供分子及其空間分辨信息。分析對象可以是組織切片、物質表面、單細胞等，能同時在一次實驗中可視化數千個不同分子的分布信息。為多分子同時成像技術。適于內源性化合物如脂質、肽和蛋白質，及外源性化合物如聚合物、藥物的分布研究，提供從細胞到有機體的詳細的生物過程分子信息。
2. 質譜成像和其他醫學成像技術有何不同？
質譜成像 (MSI) 主要是用來研究病理學離體組織，與磁共振成像 (MRI) 或正電子發射斷層攝影 (PET) 掃描技術實現體內診斷、及免疫組化 (IHC) 等，不同；MSI 常作為體內成像的優勢補充技術，對生物分子的分布代謝加以確認，無需標記實現分子可視化。MSI 有時作為唯一成像工具研究其他技術無法實現的成像、分子修飾、及信息集合。
3. 何為 MALDI ?
MALDI（基質輔助激光解吸電離，Matrix Assisted Laser Desorption Ionization），所產生的質譜圖多為單電荷離子，因而質譜圖中的離子與多肽和蛋白質的質量有一 一對應關系。MALDI 產生的離子常用飛行時間質量分離器 （TOF）來檢測質量數，因此合稱 MALDI-TOF。
MALDI 的優點在于，通過基質輔助，使一些難于電離的樣品電離且無明顯的碎裂，得到完整的被分析物分子的電離產物，特別是生物大分子。準分子離子峰很強，幾乎沒有碎片離子，可以直接分析蛋白質酶解后多肽混合物，對樣品中雜質的耐受量較大，適用于多肽、蛋白質、糖蛋白、DNA 片段、多糖及其他生物技術產品的分析。
傳統的真空紫外激光 MALDI 源處于真空環境中，分析物的離子化發生在高真空條件下。
4. 何為 AP/MALDI ？
AP/MALDI （大氣壓基質輔助激光解吸電離源）采用高效的固態 Nd:YAG 高頻（達1萬赫茲）激光器，離子化發生在大氣壓環境，離子流更加連續穩定，調諧優化簡便。可質譜成像，成像分辨率達 5 μm 以下。
AP/MALDI 作為一種外接離子源，可方便地與各類型的質譜儀聯用，保留質譜原有的高分辨率、高靈敏度等功能。適于多肽、蛋白質、核酸、唾液酸神經節苷酯、低聚木糖、表面活性劑、聚合物等大分子以及脂質、氨基酸、寡肽、中性寡糖、植物皂苷等小分子化合物的原位、直接分析。
AP/MALDI 原理圖
5. AP/MALDI 與 真空 MALDI 的區別？
相似之處：
1）工作原理類似，都是以低熔點的小分子有機物做基質，吸收激光能量，在其脫附成氣態進入氣相的過程中發生電離，生成基質離子，中性待測物與基質離子發生氣相中的質子交換或電子遷移并離子化，進入質譜而被檢測。
2）真空 MALDI 對樣品和基質的處理方法也同樣適用于 AP/MALDI。
3）目前的分辨率，最高型號都已達10 μm 以下空間分辨，新一代 AP/MALDI 更達到 5 μm微米以下。
不同之處：
1）AP/MALDI 的靶板處于常壓，不涉及真空操作，與 ESI 電噴霧源輕松切換；
2）AP/MALDI 為外置式電離源，與質譜本身無關聯，可保留質譜如 Orbi、FTMS、QQQ 等原有的高分辨率、高靈敏度等性能；
3）AP/MALDI 的離子化發生在常壓下，電離更柔和，產生碎片更少，且能夠提供穩定離子流，為準連續電離源，更適合于易碎分子離子的研究；
4）AP/MALDI 可使用揮發性的基質和樣品，而且某些熱不穩定化合物在真空條件下由于激光灼熱引發的分解，將能在常壓狀態下由于空氣的對流冷卻而加以避免，此特點尤其適合對不穩定生物分子的 MALDI 質譜分析；
5）AP/MALDI 具有出色的兼容性，能與主流廠家的各類型質譜儀（四級桿、TOF、離子阱、軌道阱、FTMS 等）聯接，并能與其他離子源（ESI、APCI、納噴源、DART、LESA、原位源、等）快速互換。而真空 MALDI 只能接 TOF 或 TOF/TOF，難以媲美高分辨質譜如 QE 或 FTMS 質譜的超高分辨率和靈敏度。
6. AP/MALDI 還有哪些優勢？
AP/MALDI 除了具有與傳統真空 MALDI 源一樣的制樣簡單、高通量、復雜混合物的譜圖簡單易辨認等特點外，還有以下優勢：
1) 樣品處理均在常壓下完成，避免真空制樣的不便；
2) 是更柔和的離子源，只需較低能量產生離子，減少亞穩離子碎片的出現；
3) 可作為相對獨立的離子源靈活地與各種形式質譜分析器偶聯；
4) 保持原有儀器的高分辨率和高質量準度；
5) 常壓電離形成均勻的離子云，電離更加連續穩定。
除此之外，AP/MALDI 得到的主要是分子離子和準分子離子，碎片和多電荷離子較少，適合于分析脂質、多肽、蛋白質、核酸等生物類樣品。
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