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  • 發布時間:2019-03-14 10:18 原文鏈接: 周強組解析首個人源氨基酸轉運體LAT1–4F2hc復合體結構

      L 型氨基酸轉運體1,簡稱LAT1(也被稱作SLC7A5),屬于反向轉運蛋白,能向胞內轉運不帶電氨基酸,此外還參與藥物的吸收、甲狀腺激素及激素前體物質如L-DOPA的跨膜運送。LAT1和 LAT2(SLC7A8)同屬于SLC7 家族,其介導氨基酸反向協同轉運過程不依賴于鈉離子,其中LAT1也不依賴于pH。

      LAT1和LAT2具有相似的胞內胞外底物選擇性,LAT1傾向于轉運較大的不帶電氨基酸,如亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸和組氨酸【1】,LAT2的選擇性更廣,但一般而言底物親和力更低。在組織特異性上,兩者表達也有差別,另外LAT1在多種腫瘤細胞中檢測到表達上調,使其成為潛在的抗腫瘤藥物靶點【2】。在結構上,LAT1通過二硫鍵與4F2 細胞表面抗原重鏈糖蛋白(4F2 cell surface antigen heavy chain,也叫SLC3A2)共價連接形成LAT1-4F2hc復合體【3】。盡管已有工作解析了細菌來源的LAT1-4F2hc同源晶體結構及人源的LAT2-4F2hc負染的低分辨結構,但人源LAT1-4F2hc復合體亞基之間的相互作用及轉運的工作機制仍未明了。

      2019年3月14日,西湖大學生物學研究所周強研究員團隊在Nature發表了題為Structure of the human LAT1–4F2hc heteromeric amino acid transporter complex的論文(第一單位為清華大學),該研究利用冷凍電鏡技術,研究者首次解析了人源LAT1–4F2hc復合體整體分辨率3.3?的高分辨結構,及LAT1–4F2hc與抑制劑2-amino-2-norbornanecarboxylic acid (BCH)結合的3.5?的結構。

    圖片.png

      研究者在HEK293F細胞中外源大量表達人源LAT-4F2hc蛋白,純化后蛋白用于冷凍電鏡樣品制備及體外的功能學研究。首先蛋白被重構入脂質體進行體外轉運實驗,通過檢測復合體對同位素標記的亮氨酸[3H]leucine的吸收速率,實驗測定了LAT1-4F2hc催化轉運的Km值,確定體外表達純化蛋白具有活力。其他LAT1底物與[3H]leucine的競爭性實驗表明,[3H]leucine的轉運活力可被苯丙氨酸、色氨酸、亮氨酸、酪氨酸、L-DOPA、組氨酸、甲硫氨酸、BCH和異亮氨酸抑制,抑制程度依次降低。同時研究者單獨純化了LAT1蛋白,進行了體外重構脂質體的轉運實驗,發現LAT1單獨幾乎無轉運活性,有力地說明了4F2hc在轉運過程中發揮著重要作用。

      該工作解析了人源LAT1–4F2hc復合體整體分辨率3.3?的高分辨結構,這是已發表工作中,冷凍電鏡解析的高分辨無對稱性的最小膜蛋白,可見區部分不到100kDa。此外研究者還收集了加入抑制劑JPH203的蛋白樣品的數據,功能實驗證明了JPH203對重構入脂質體的LAT-4F2hc復合體的抑制,但3.3?結構中并沒有看到抑制劑的密度。三個結構HAT + BCH,HAT + JPH203, apo-HAT(未外加藥物的結構)整體構象幾乎一致,通過與apo-HAT密度比較,研究者在HAT + BCH結構中發現一處可以較好匹配BCH分子形狀的密度(下圖)。

    圖片.png

      LAT1–4F2hc復合體整體結構呈現朝胞內打開的構象,4F2hc上有四個糖基化位點。研究者看到了BCH的密度,對BCH周圍有相互作用的氨基酸突變后,發現帶有點突變的復合體對亮氨酸的轉運能力下降,這和根據與GkApcT和 AdiC轉運體序列比對結果推測的轉運路徑相符,根據與其他氨基酸轉運體的序列比對結果與對結果分析,找到Tyr117, Phe252, Trp257, Asn258, Tyr259和 Arg348等氨基酸,繪制了可能的氨基酸轉運路徑。

      對結構的分析中發現,4F2hc與LAT1除形成二硫鍵外,還有多個相互作用的界面,由多個氨基酸參與形成,有意思的是,這些有相互作用的氨基酸均在遠離底物轉運路徑,但某些關鍵相互作用氨基酸發生突變,會顯著降低氨基酸的轉運能力,推測4F2hc像一個支架,支持底物轉運過程中LAT1的變構。

      基于對高分辨結構的解析及功能實驗驗證,對LAT1–4F2hc復合體可能的工作機制提出了如下的模型:

    圖片.png

      總的來說,該工作中LAT1-4F2hc復合體高分辨結構清晰的密度,為疾病相關突變的研究提供了結構基礎,對LAT1-4F2hc轉運底物機制的探究具有重要意義,LAT1-4F2hc與抑制劑BCH結合的構象為針對LAT1-4F2hc的抗癌藥物研發提供幫助。

      據悉,西湖大學生物學研究所周強研究員為此文的通訊作者,清華大學博士生鄢仁鴻、趙馨為共同第一作者。

      通訊作者簡介:

      周強(1982 -),黑龍江齊齊哈爾人。2000-2004年本科就讀于清華大學,獲學士學位。2004-2012年博士師從隋森芳院士就讀于清華大學,獲博士學位。博士畢業后繼續留實驗室從事博士后研究工作。2015年博士后出站后在清華大學醫學院顏寧教授課題組任副研究員。2019年初將加盟西湖大學擔任西湖學者、特聘研究員,開展獨立研究工作。(信息來源于西湖大學官網)

      原文鏈接:

      https://doi.org/10.1038/s41586-019-1011-z

      參考文獻

      1.

      Kanai, Y. et al. Expression cloning and characterization of a transporter for large neutral amino acids activated by the heavy chain of 4F2 antigen (CD98). J. Biol. Chem. 273, 23629–23632 (1998).

      2.

      Yanagida, O. et al. Human L-type amino acid transporter 1 (LAT1): characterization of function and expression in tumor cell lines. Biochim. Biophys. Acta 1514, 291–302 (2001).

      3.

      del Amo, E. M., Urtti, A. & Yliperttula, M. Pharmacokinetic role of L-type amino acid transporters LAT1 and LAT2. Eur. J. Pharm. Sci. 35, 161–174 (2008).


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