根據調亡的生化特征的檢測方法
一、瓊脂糖凝膠電泳
1)常規的瓊脂糖凝膠電泳
方法一:
1.收集細胞(5×106)1000r/min,離心5min,去上清。
2.PBS洗一次,1000r/min,離心5min,去上清。
3.加細胞核裂解液500μl重懸細胞,50℃水浴,3~5h,不時振搖或37℃過夜。
4.加0.5ml平衡酚抽提,上下顛倒幾次混勻,6000r/min,離心5min。
5.上清移至另一Ep管,加0.5ml氯仿:異戊醇抽提,上下顛倒幾次混勻,6000r/min,離心5min。
6.上清移至另一Ep管,加50μl的3mol/L乙酸鈉和2ml預冷無水乙醇,上下顛倒幾次混勻,可見絮狀白色沉淀物。
7.置液氮5~10min,12 000r/min離心10min沉淀DNA,去上清,真空抽干或風扇下吹干殘存液體。
8.加50~100μl TE緩沖液,另加5μl RNase,37℃水浴30min。
9.取20μl加上樣緩沖液2~5μl,1%瓊脂糖凝膠電泳(電壓50V,1.5~2h),UV下觀察。
方法二:
1.離心收集細胞(5×106),PBS(無Ca2+和Mg2+)洗1~2次。
2.0.5ml TBE溶液重懸,37℃孵育30min。
3.1mg/ml蛋白酶K 37℃處理30min。
4.加入上樣緩沖液0.1ml。
5.25μl上樣,1.5%的瓊脂糖凝膠上電泳,2V/cm 6h。
方法三:
1.收集細胞懸液(106細胞),低速離心(1000r/min,離心5min)。
2.去上清,沉淀加0.4ml低滲緩沖液作用1h。
3.13 000r/min,離心10min,將上清轉移至另一Eppendorf管中,加等量50%異丙醇和0.5mol/L NaCl混勻,置液氮5min。
4.12 000r/min,離心10min,棄上清,沉淀真空抽干。
5.加TE 100μl,65℃加熱10min,取20μl,加1~2μl上樣緩沖液,電泳觀察。
方法四:
1.收集細胞,1000r/min離心5min,去上清。
2.用冰預冷的70%乙醇固定,可長期保存于-20℃冰箱。
3.1000r/min離心5min,去除固定液,用約0.5ml的PBS重懸細胞。
4.轉入Eppendorf管中,同法離心,去上清。
5.細胞用40μl PC緩沖液重懸,室溫30~60min。
6.1000r/min離心5min,吸上清于新的Eppendorf管中,真空濃縮15min。
7.加入0.25% NP-40溶液3μl,1mg/ml RNase A溶液3μl,37℃,30min。
8.加入3μl蛋白酶K,37℃,30min。
9.加入12μl樣品稀釋液,含溴化乙錠的1.5%瓊脂糖電泳,觀察。
2)瓊脂糖凝膠電泳的定量檢測
簡易末端標記法
1.按常規提取細胞DNA。
2.在0.5ml的EP管中加入細胞DNA,反應體系如下:細胞DNA 0.5~1.0μg,10×緩沖液2μl,32P-dATP(或-dCTP)0.5μCi,Klenow聚合酶5U,雙蒸水加至20μl。
3.混勻后稍加離心,室溫反應30min。
4.加1μl 0.5mol EDTA終止反應。
5.常規酚/氯仿/異戊醇抽提1次,無水乙醇沉淀DNA,真空抽干。
6.溶于20μl的TE緩沖液中。
7.取標記DNA在1.8%瓊脂糖凝膠上點樣,50V電泳約2h。
8.電泳后的凝集置濾紙上烘干,進行放射自顯影。
5’末端32P標記法
細胞DNA的提取
1.細胞懸液離心后,沉淀加消化緩沖液0.5ml,50℃ 3~5h,或37℃過夜。
2.用等體積的酚:氯仿:異戊醇抽提細胞裂解液。
3.將水相轉移至新的試管,加入150mmol/L乙酸鈉和10mmol/L氯化鎂。
4.加入2倍體積的預冷無水乙醇,置液氮5min或-20℃ 12h。
5.12 000r/min離心沉淀DNA,70%乙醇洗1次后,真空抽干。
6.溶于20μl的TE緩沖液中。
7.加入終濃度為10μg/ml RNase,37℃,30min。
8.同法用等體積酚:氯仿:異戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
9.溶液20μl的TE緩沖液中,-20℃保存備用。DNA含量測定:用260nm波長紫外分光光度計:吸光單位為20時約為1mg/ml DNA。
DNA 5’末端脫磷酸
1.取純化的細胞DNA 10μg,然后加入:10×CIP 2μl(1U),雙蒸水加至50μl。
2.37℃水浴2h。
3.90℃水浴5min以滅活CIP。
4.用等體積酚:氯仿:異戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
DNA 5’末端32P標記
1.將脫磷酸樣品DNA置冰浴上,再加雙蒸水10μl,10×緩沖液2μl,T4多核苷酸激酶10U,32P-ATP 740kBq(20μCi),雙蒸水加至20μl。
2.混合后,37℃水浴60min。
3.加入1μl的0.5mol/L EDTA,90℃滅活5min。
觀測
1.取一定量的標記DNA稀釋后在1.8%瓊脂糖凝膠上點樣,50V電泳約2h。
2.電泳后的凝膠置濾紙上烘干,進行放射自顯影。
3.含32P標記DNA電泳干凝膠進行同位素液閃測定,計算放射活性。
二、原位末端標記技術 1)DNA聚合酶或Klenow大片段介導的原位缺口平移(ISNT) 1.切片常規脫蠟,梯度乙醇復水化。 2.將切片組織浸入2×SSC液中,80℃,20min,然后蒸餾水沖盡。 3.0.5%胃蛋白酶(pH2.0