今天看到2005年1月一篇文章,這篇文章的核心結論是:
針對SARS,對疑似患者血清標本進行N蛋白的檢測 , 比鑒定抗體更有意義,而且陽性率高。
如下圖,發病后1-5天,檢測N蛋白是陽性率最高的方法。
我想向各位專家請教的問題是:
1、這個結論可靠嗎?
2、對于COVID-19的病人,檢測新冠的N蛋白也會有這種效果么?
之所以想探究這個問題,原因是:
我們拿到了結合新冠N蛋白的核酸適配體(類似抗體),適配體可以用來開發N蛋白的檢測方法,如果這個結論在新冠狀病毒感染中也成立。我愿意免費開放我們的技術和適配體信息。
以下是原文的全文,連接見這里。
《四種試劑盒在SARS實驗室早期診斷中的作用分析》
高陽 周端華 吳新偉 陳小霜 狄飚 劉于飛 陳芳 杜琳 徐慧芳 顧菁 鄭伯健 徐建國
廣州市疾病預防控制中心 ,510080
摘 要:目的比較 4 種檢測嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒 (SARS CoV) 基因、抗原和抗體的試劑盒在SARS患者早期實驗室診斷的可能作用。方法
用 3 種酶聯免疫吸附試驗 (ELISA) 分別檢測SARS CoVIgG、SARS CoVIgM 和SARS CoVN蛋白 , 用熒光定量聚合酶鏈反應 (F PCR) 檢測SARS CoV核酸。
結果:根據 162份血清的檢測結果 , 發病 1-5 天 , N抗原的陽性率可達 90.2% (55 /61) ;發病后的第 15-18 天IgG和IgM陽性率為92.8% (13/14) ;根據 82 份咽拭子的檢測結果 , F PCR法在發病后1-5天的陽性率可達 5 6 .3% (14 / 2 4 ) , 6-9 天可達 71.4 % (10/14 ) 。
結論
除了檢測SARS CoV病毒基因的F PCR方法以外,對疑似患者血清標本進行N蛋白的檢測 , 具有早期預報意義。
關鍵詞:嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒; 陽性率;
收稿日期:2004-09-16
基金: 廣東省科技廳資助項目 (2 0 0 3FD0 2 0 4);
《The effects of 4 laboratory test kits in early detecting of severe acute respiratory syndrome coronavirus》
Abstract:Objective To compare the 4 test kits on severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) gene, antigen and antibody for early diagnose of SARS patients. Methods Three enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) kits were used to detect SARS-CoV IgG, IgM and N protein and fluorescent polymerase chain reaction (F-PCR) kit was used to detect SARS-CoV RNA. Results In 162 serum samples, 90.2% (55/61) became N protein positive in 1-5 days and 92.8% (13/14) became positive IgM and IgG in 15-18 days after the onset of disease, respectively. On 82 gorgling samples, the positive rates of F-PCR were 56.3% (14/24) in 1-5 days and 71.4% (10/14) in 6-9 days after the onset. Conclusion Other than F-PCR, N protein had good effect in the early detection on dubious patients which could lead to effective prevention and control of the epidemic.
Keyword:Severe acute respiratory syndrome coronavirus; Positive rates;
Received: 2004-09-16
早發現、早診斷、早隔離是有效控制嚴重急性呼吸綜合征 (SARS) 爆發或流行的關鍵。但是, 一些早期病例的臨床癥狀往往不典型, 難以和常見的非典型肺炎鑒別。僅僅依靠臨床癥狀可延誤診斷, 錯失有效控制疫情的最佳時機。因此, 早期診斷往往依賴于實驗室檢測結果。目前, 可以發揮早期診斷作用的主要檢測方法有SARS冠狀病毒 (SARS-CoV) 核酸檢測 (RT-PCR) [1]、病毒特異性抗原檢測 (酶聯免疫吸附試驗, ELISA) 和抗體的檢測[2,3]。SARS-CoV特異性抗體檢測方法包括ELISA、間接免疫熒光法 (IFA) 和免疫印跡法 (WB) 。我們采用國內常用的幾種檢測病毒基因、抗原和抗體的方法, 對收集到的SARS患者的血清標本和漱口液標本進行比較檢測, 結果報道如下。
材料與方法
1.標本:
血清標本包括162份SARS患者血清和73份健康人血清標本。SARS患者血清來源于2003年2-4月廣州市住院患者, 其恢復期血清 (發病后3-5月) 抗體中和試驗均陽性 (中和試驗結果由香港大學提供) 。采血時間最早為發病后第1天, 最晚為發病后第59天。還包括廣州2003年12月至2004年1月確診為SARS的4例患者的血清標本。漱口液標本82份, 2003年2-4月采自廣州市各級醫院的SARS患者, 采樣時間最早為發病后第1天, 最晚為發病后第45天。
2.檢測方法:
采用第一軍醫大學珠江醫院開發的檢測N (nucleocapsid) 蛋白的試劑盒和北京華大吉比愛公司發展的檢測IgM和IgG抗體的試劑盒[4], 以及達安基因公司的檢測SARS-CoV基因熒光定量PCR試劑盒[5]。均按廠家提供的說明書嚴格操作。第一軍醫大學珠江醫院開發的ELISA方法, 是用基因工程表達的SARS-CoV N蛋白, 制備單克隆抗兔抗體, 包被微孔板, 以辣根過氧化物酶 (HRP) 標記的雙抗體夾心ELISA法。北京華大吉比愛的ELISA方法, 是用純化的SARS-CoV裂解液為抗原包被微孔板, 為間接ELISA法。達安基因公司的熒光定量PCR試劑盒是以SARS-CoV的pol基因1b區的一個保守區為靶基因, 擴增片段長度為85 bp, 設計特異性引物及熒光探針, 利用逆轉錄酶將RNA逆轉錄為cDNA, 再將cDNA進行PCR擴增, 利用全自動熒光PCR檢測儀在線檢測熒光信號, 用于漱口液等標本中的SARS-CoV核酸。
結果
1.特異性抗原、抗體檢測結果:
采用3種ELISA試劑盒檢測162例SARS患者血清標本的結果見表1。
表13種ELISA試劑盒檢測162例SARS患者 血清的結果
珠江醫院研制生產的檢測N抗原的試劑盒在發病后第1-5天檢測陽性率90.2%, 6-9天為76.0%, 10天以后檢測陽性率明顯下降 (χ2=7.41, P=0.01) 。北京華大吉比愛公司的檢測IgM和IgG抗體的ELISA試劑盒在發病后的第15-18天檢測率達92.8%。以后隨著發病后天數的增加, IgM抗體陽性率下降 (χ2=4.40, P=0.04) , IgG抗體陽性率不變 (χ2=0.01, P=0.93) 。73份健康者血清的N蛋白和IgM和IgG抗體的檢測結果均為陰性。
橫向比較不同檢測方法在發病后同一時間的檢測陽性情況發現, 感染后1-5天N抗原的陽性率最高 (χ2=175.17, P<0.01) , 6-9天仍為N抗原的陽性率最高 (χ2=26.39, P<0.01) , 發病后10-14天, IgM抗體和IgG抗體的陽性率高于N抗原 (χ2=6.51, P=0.04) , 發病后15-18天IgM和IgG抗體的陽性率仍然高于N抗原 (χ2=29.87, P<0.01) , 發病后19天以上者, IgG抗體的陽性率最高 (χ2=67.52, P<0.01) 。
2.核酸檢測結果:
采用熒光定量PCR法檢測82例SARS患者漱口液標本結果見表2。采用達安基因公司研制的熒光定量PCR試劑盒, 發病后第1-5天檢測陽性率56.3% (14/24) , 6-9天為71.4% (10/14) , 10-14天為63.6% (14/22) , 15天以后檢測陽性率明顯下降。
表2 熒光定量PCR試劑盒檢測70份SARS患者 漱口液的結果 下載原表
圖1為發病后的不同時間4種檢測方法的靈敏度曲線變化。4種試劑盒在SARS發病后不同時間的檢出陽性率
3. 2003年末以后新發4例SARS病例檢測結果:對2003年12月至2004年1月在廣州發現的4例SARS患者的血清和漱口液標本采用上述4種方法的檢測結果見表3。
表3 2003-2004年廣州4例SARS患者的檢測結果 下載原表
討論
本研究所選擇血清標本來源于162例SARS患者, 其臨床癥狀均符合衛生部頒發的《傳染性非典型肺炎臨床診斷標準 (試行) 》, 其相應的恢復期血清均經抗體中和試驗檢測為陽性, 為確診的SARS病例。所選擇的咽拭子標本來自于上述患者。
研究發現, 對于早期診斷來說, 在發病后1-5天采取患者血樣標本, 使用檢測N蛋白的試劑盒進行檢測, 陽性率可達90.2%。采取咽拭子、肛拭子等標本進行病毒基因的檢測, 使用熒光定量PCR陽性率則為56.3% (14/24) [6,7]。檢測IgM和IgG抗體的ELISA等試劑盒盡管在實踐中表現出一定價值, 但是由于SARS-CoV侵入機體、感染靶細胞、產生抗體需要一定的時間, 在發病1-6天基本上檢測不到針對N蛋白的特異性抗體[8,9,10]。因此從理論上講, 檢測N蛋白同時合并SARS-CoV基因檢測的方法, 可獲得更早的有診斷意義的數據。檢測N蛋白的試劑陽性率比較高的原因, 可能是因為N蛋白為SARS-CoV的主要蛋白, 合成的量大, 在病程早期以可溶性抗原的形式釋放到患者血液中[4]。
對2003年末廣州新發4例SARS患者血清和漱口液的檢測結果, 提供了進一步的資料。從檢測結果來看, N蛋白仍然表現出很好的早期診斷價值。但由于2003年末發病的患者臨床表現不典型, 癥狀輕, 預后好, 沒有發現傳播的證據, 而S基因的序列資料分析結果表明, 導致2003年末感染的SARS-CoV是動物源性的, 和2003年上半年人間流行的SARS-CoV有很大的區別, 因此兩者之間表現出的差異, 可能是因為病毒株的不同造成的[11,12]。
雖然我們選擇的患者均經過臨床診斷和血清中和試驗的確診, 但是血清標本和患者的相對應關系, 及與咽拭子標本之間的相對應關系不清。盡管2003年疫情的特殊情況給分析結果帶來了遺憾, 但仍然提供了非常有價值的參考數據[13]。我們的研究認為, 除了檢測SARS-CoV基因的PCR方法以外, 對疑似患者血清標本進行N蛋白的檢測, 具有早期預報意義, 雖然還不能夠明確診斷, 但是可提醒我們及時采取有效的預防和控制措施, 防止疫情的擴散, 并密切注視患者的抗體變化, 及時明確診斷。
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