人類病原菌及其引發的疾病嚴重威脅公眾健康，亟需發展高靈敏性、高特異性的診斷工具。監測人類病原菌并追溯其污染來源對人類健康具有重要意義。目前對人類病原菌的監測主要有兩個挑戰，一是多個病原菌豐度的同時定量，對微生物污染水平、健康風險的綜合評估具有必要性；二是微生物污染來源的鑒定，對環境管理者減緩或控制環境污染的相關舉措至關重要。
中國科學院城市環境研究所發展一種高靈敏度（80%）和高特異性（99%）的高通量熒光定量芯片，可同時對23種人類病原菌的68個標記基因和10種糞源宿主的23個標記基因進行定量。研究團隊基于該芯片對廈門13個海濱浴場的水體進行病原菌檢測和污染溯源，并結合nanopore三代長片段測序技術對水體潛在病原菌進行檢測。該研究發展的針對微生物污染監測和溯源的高通量定量芯片將為病原菌相關的健康評估提供數據，為人類健康發展的環境管理措施提供科學依據。
相關研究成果以High-throughput diagnosis of human pathogens and fecal contamination in marine recreational water為題發表在Environmental Research上，城市環境所蘇建強研究組博士安新麗為論文第一作者。該研究得到國家重點研發計劃的支持。
基于HT-qPCR分析的糞便污染溯源的標記基因靈敏性和特異性驗證
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