1、前言
隨著第二代測序(NGS)技術在包括前列腺癌等腫瘤臨床診療中得到愈發廣泛的應用,對NGS在前列腺癌臨床應用過程中的檢測內容、檢測技術、生物信息學分析、數據處理及解讀等環節的質量 管理提出了更高的要求。推薦有意愿進行基因檢測的受檢者進行初步的腫瘤遺傳咨詢,在充分理解檢測價值及必要性的情況后再進行相關檢測。
2、適宜進行基因檢測的對象
不同病情和治療階段的前列腺癌患者的基因突變特征各異,基于前列腺癌臨床實踐以及 藥物研發現狀,推薦符合表1所列情形的前列腺癌患者考慮進行NGS基因突變檢測。評估是否適宜進行基因檢測需要結合前列腺癌患者的家族史、臨床及病理學特征。其中家族史需要考慮:
是否有兄弟、父親或其他家族成員在60歲前診斷為前列腺癌或因前列腺癌死亡;
是否在同系家屬中具有多名包括膽管癌、乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、結直腸癌、子宮內膜癌、胃癌、腎癌、黑色素瘤、小腸癌以及尿路上皮癌患者,特別是其確診年齡≤50歲;
患者個人是否有男性乳腺癌或胰腺癌病史;④是否已知家族攜 帶相關胚系致病基因突變。
對于初診未進行風險評估、極低風險至中風險的前列腺癌患者,其家族史、臨床特征的獲得及遺傳咨詢是檢測前的必要步驟:對于具有明確相關家族史、已知家族成員攜帶胚系致病基因突變的上述風險級別患者,推薦進行DNA損傷 修復相關基因(特別是BRCA2、BRCA1、ATM、 MSH2、MSH6、GEN1、FANCA、CHEK2)的胚系變異檢測;對于家族史不詳的上述風險級別患者,需要結合臨床特征進行遺傳咨詢后綜合判斷是否有必要進行相關檢測。而對于高風險、極高風險、局部進展及轉移性前列腺癌患者,推薦進行DNA修復基因(特別是BRCA2、BRCA1、 ATM、MSH2、MSH6、GEN1、FANCA、CHEK2)的胚系變異檢測。而對于所有轉移性去勢抵抗性前列腺癌(mCRPC)患者,推薦進行至少包含DNA修復基因胚系及體細胞變異的檢測。如腫瘤組織檢測已發現與腫瘤發病風險相關基因突變而缺乏胚系變異驗證的前列腺癌患者,建議遺傳咨詢后再考慮是否進行檢測。
另外,前列腺導管內癌(IDC-P)和前列腺導管腺癌(DAP)是前列腺癌中具有獨特病理學特征的亞型。IDC-P和DAP患者預后較差,對具有該病理學特征的前列腺癌患者,不論是否存在明確的腫瘤家族史均推薦進行胚系基因檢測。
具有明確家族史的初診未進行風險評估或極低至中風險前列腺癌患者;家族史不詳或不明確患者需經腫瘤遺傳咨詢指導后綜合考慮檢測必要性
高風險、極高風險前列腺癌患者
局部進展(N1)、轉移性(M1)前列腺癌患者
具有IDC-P或DAP病理學特征的前列腺癌患者
mCRPC患者
腫瘤組織檢測已發現與腫瘤發病風險相關基因突變而缺乏胚系變異驗證的前列腺癌患者,進行遺傳咨詢推薦后再考慮檢測
3、檢測內容
雖然通過NGS技術發現多數mCRPC患者存在具有臨床價值的基因突變,但是由于藥物研發及相關藥物在前列腺癌患者臨床研究中的證據有限,針對前列腺癌患者的NGS基因檢測應在增加受檢者獲益及避免過度檢測中求得平衡。《本共識》建議針對不同遺傳背景及檢測目的的受檢者,應根據實際需要進行檢測組合的篩選,檢測組合和檢測流程應在臨床應用前進行充分的性能分析評估。
BRCA2、BRCA1及ATM
其他DNA修復相關基因
錯配修復基因
其他基因
4、NGS檢測流程的規范
NGS檢測的全部流程包括從符合送檢要求的樣本中提取DNA、其后基于雜交捕獲或擴增子建庫方法進行文庫構建,文庫需測序至符合要求的測序深度;對于不同類型變異(包括堿基取代、插入缺失、拷貝數改變和基因重排)采用特定生物信息學分析方法進行分析和注釋,最后對檢測發現的基因突變信息進行分析并提出報告。
5、生殖泌尿腫瘤精準醫學專家團隊(GU-MTB)
《本共識》專家委員會倡導各單位組建GUMTB,以進一步規范本中心的基因檢測與精準治療。GU-MTB有助于為腫瘤治療提供更多選項,優化患者的個體化診療方案,并建立生物標志物引導的臨床治療路徑。
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