來自斯坦福大學醫學院,霍德華休斯醫學院等處的研究人員研發出了一種具有某種配體親和性,能識別RNA結構和序列作用的整體策略,這種技術的全稱為RNA分子互作機械誘導捕獲技術,是一種微流體系統平臺,能對程序性RNA文庫進行整體分析,以及功能解讀。
文章的通訊作者之一是斯坦福大學Howard Y. Chang博士,張博士出生于臺灣,畢業于哈佛大學,現任斯坦福大學首席研究員。其主要研究領域是基因功能研究及衰老研究,在2007年他曾通過阻遏一個關鍵蛋白成功逆轉了小鼠皮膚的衰老,引起了同領域里的極大關注,同時他也曾成功地建立了一種基因模塊圖譜(gene module map),這種圖譜能將胚胎干細胞、成年組織干細胞、以及人類癌癥組織的轉錄程序系統連接起來,是一位多產的華裔學者。
ENCODE項目的研究數據表明,四分之三的人類基因組是能轉錄的,但其中只有最多不過1.5%的能編碼出蛋白,其余的非編碼RNAs(ncRNA),包括5"和3"非翻譯區mRNAs,都發揮著表觀遺傳,轉錄和轉錄后基因網絡調控等方面的作用。這些調控功能主要是通過ncRNAs和不同配體之間的相互作用完成的,但是很難確定特異性調控相互作用的非編碼RNA的序列,或結構域,而且我們對于非編碼RNA互作組的分子作用機理,了解的也很少,因此要解析非編碼RNA中的一些擾亂調控功能的致病突變,并不容易。
在這篇文章中,研究人員研發出了一種具有某種配體親和性,能識別RNA結構和序列作用的整體策略,并將其應用于莖-環結合蛋白,從中獲得了理想的結果。
這種技術的全稱為RNA分子互作機械誘導捕獲技術,這是一種微流體系統平臺,能對程序性RNA文庫進行整體分析,以及功能解讀。
研究人員在莖-環結合蛋白的研究中,首先構建了一個RNA突變全文庫,然后通過這一RNA-MITOMI技術,精確的定義了調控親和性的RNA結構和序列特征,并且通過這一平臺,研究人員還重建了功能結構域,從中發現了新的結合特異性,豐富了系統發育相互作用數據。具體流程如下:
(RNA-MITOMI是一種微流體平臺,能對程序性RNA文庫進行整體分析,以及功能解讀)
Chang博士研究組曾入選了 HHMI2009年早期職業科學家項目( 2009 Early Career Scientist Program),獲得百萬美元資助,這項計劃將在6年中為每一位入選科學家提供包括薪酬,福利和研究預算在內的,超過150萬美元的經費支持,這些科學家也會被聘為霍華德休斯醫學研究院的全職研究員。
近年來這一研究組成果不斷,他們曾證實了之前的一項假設:衰老相關的組織,器官,甚至面部皮膚的退化是一個主動,有計劃的過程,而不是細胞“疲倦”后的逐漸衰退,這說明有一天也許我們能“返老還童”,或者退一步說,推遲下一個皺紋出現的時間。
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